protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22 (lymphoid) (PTPN22) - 5487 nt intron 19 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.51672
gtaagttggtacttatgtttaaaaatatcgttttctcaattttgtaatttttatttatat  c.2281+60

         .         .         .         .         .         .  g.51732
aaccaaccaatattgtgaaaagattaacaatattattcctaaacagagcctccatagggt  c.2281+120

         .         .         .         .         .         .  g.51792
cctatgaatcagaacaatcacccataggcctccttttttttttttttttttttttgctag  c.2281+180

         .         .         .         .         .         .  g.51852
gcttcacaatactaatattgggcagggagtaggcgatgagaagtcttctgtttaatacac  c.2281+240

         .         .         .         .         .         .  g.51912
aagaataataattagtacaatggcattaaaaaaattttaaatttatttttaaaatttatt  c.2281+300

         .         .         .         .         .         .  g.51972
ttaatagcagagatggggtttcaccatattgcccaggttggtctcgaactcctgggctca  c.2281+360

         .         .         .         .         .         .  g.52032
agtgatcctcctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcataagccactgcacc  c.2281+420

         .         .         .         .         .         .  g.52092
cggccaatgtttggtactttctacccatcctaagatgctgtcatacaattggattattta  c.2281+480

         .         .         .         .         .         .  g.52152
aaatttccagcagtctaacctcagatgtattttctttgaaaatagtcacagcaaagcata  c.2281+540

         .         .         .         .         .         .  g.52212
ttgtgaacaaatgtgttgacttcatgaaataagcaaagcattgacacatttccattttta  c.2281+600

         .         .         .         .         .         .  g.52272
ctaagtattattagcaataaaagtctgttgcttactatttttgctacgttgtaatgaaaa  c.2281+660

         .         .         .         .         .         .  g.52332
taaaatccattgagtcctgaaactgtggaaaattatcttagaaatcttatttacaaataa  c.2281+720

         .         .         .         .         .         .  g.52392
aaaatataaaaaccatggtgatggccgggtgtggtggctcatgcctataatcccagcact  c.2281+780

         .         .         .         .         .         .  g.52452
ttgggaggccgaggcaggtggatcacaaggtcagcagtttgagaccagcctggctaacat  c.2281+840

         .         .         .         .         .         .  g.52512
agtgtaaccccgtctctactaaaaatacaaaaattagccgggtgtggtggcatgcacctg  c.2281+900

         .         .         .         .         .         .  g.52572
tagtcccagctactcggaaggctggggcaggaggattgcttgaactcgggatgcggaggt  c.2281+960

         .         .         .         .         .         .  g.52632
tgcggtgagccaagattgcgccactgcactccagtctgggcaacagagcgagactccgtc  c.2281+1020

         .         .         .         .         .         .  g.52692
tcaaaaaaaaaaaaagaaccatggtgacaatcttaaaaaaatttttgatacatttggtta  c.2281+1080

         .         .         .         .         .         .  g.52752
atcagtgaaagagcagttatttgacattaaactggtactatagggagagacaaaaagcac  c.2281+1140

         .         .         .         .         .         .  g.52812
tgagaaaatctgatgtaggtatagtctaagaaagaaggtttccttttgggttttcattct  c.2281+1200

         .         .         .         .         .         .  g.52872
atctccctacccaaaagctccaggttcttgagctagtttgctatcactgccattatagct  c.2281+1260

         .         .         .         .         .         .  g.52932
gatctctgacaccaactcatgatggctgaagtatagttggaaaacataccttttctccta  c.2281+1320

         .         .         .         .         .         .  g.52992
aaaagagtcaaaagagaatttaaacatttcaaatggaaattatggtaggaaacaggggaa  c.2281+1380

         .         .         .         .         .         .  g.53052
ataaaacagccaagtgcaaagaaatgagtgacttaaatggttaaccaaagattggtttga  c.2281+1440

         .         .         .         .         .         .  g.53112
tccacctaactcagaaaacagttttctttctctagctctaactctgcctagaatatcaaa  c.2281+1500

         .         .         .         .         .         .  g.53172
taaagaaacagaaacttcaggtagatttaggttggcacagctttgaaggtatagtggaac  c.2281+1560

         .         .         .         .         .         .  g.53232
tttcagagattgagtcttatttctaagtaagagctcccagttcattctctggatctgggc  c.2281+1620

         .         .         .         .         .         .  g.53292
tgtgctgtatttttcagttaccttgatcctctggtcttttgccgttaaatgaagaacatc  c.2281+1680

         .         .         .         .         .         .  g.53352
tggctcccaaaattgatcctgaagctttagactgtacttcatatgtgtcctcagcccctt  c.2281+1740

         .         .         .         .         .         .  g.53412
ccagatggttcatgattctggaattccatgtgttctccctgtagcctggatctcccactg  c.2281+1800

         .         .         .         .         .         .  g.53472
gtctgtaaagctggtcctacttttaatgaaattaggattcttcttctgttattttaagct  c.2281+1860

         .         .         .         .         .         .  g.53532
agtatctaagcctagtgtcattcattcattcattcaatgaatatttgttgagtgtctact  c.2281+1920

         .         .         .         .         .         .  g.53592
atgttccaggcattctgtaaggcacttggtatatgatggtgaacagaacagatatgggct  c.2281+1980

         .         .         .         .         .         .  g.53652
ctgcctttgtggaatgtaagtttggtgaggggttccaacattaaacaaacaacattaaac  c.2281+2040

         .         .         .         .         .         .  g.53712
aaaatttggttgaccatattcacaaatatatacttaataacacatgataaatgctatgaa  c.2281+2100

         .         .         .         .         .         .  g.53772
ggaaaacaaaagggtaactatgagaggataacaaaggggatccactttagaatgagtagt  c.2281+2160

         .         .         .         .         .         .  g.53832
ccaagaaagcccccgctttttttgagacggagtctagctctgtcgcccaggctggagtga  c.2281+2220

         .         .         .         .         .         .  g.53892
aatgatgcgatctcggctcactgcaacctccccctcccaggttcaagtgattctcctgcc  c.2281+2280

         .         .         .         .         .         .  g.53952
tcagcctcccaagtgctgggatgacaggcgcacaccactatgcccagctaatttttgtat  c.2281+2340

         .         .         .         .         .         .  g.54012
ttttagtagagacaaggtttcaccgtgttggccaggatggtcttgatctcctgaccttat  c.2281+2400

         .         .         .         .         .         .  g.54072
gatccacccacctcggcctcccaaagtgctgggattacagctgtgagccactgtgcccgg  c.2281+2460

         .         .         .         .         .         .  g.54132
cccaagaaaccctttttaaggaagtgacaactgaacccaaaacatgaaggagcagccagc  c.2281+2520

         .         .         .         .         .         .  g.54192
cagccaaagggtccagagaagagtatttcagatagagggaacaaaatctctgaggtagga  c.2281+2580

         .         .         .         .         .         .  g.54252
gattttggtgtattgtagaaactcaaagggaagccatcttagatgcagggtagtaagtaa  c.2281+2640

         .         .         .         .         .         .  g.54312
agaggagacaggagtaaggcgaagctggaaagatcagggaggagcagttagatttttatg  c.2281+2700

         .         .         .         .      g.54356
ggtcatgcatggtaagtagtttagtttattctaagtgtaatggg  c.2281+2744

--------------------- middle of intron ---------------------
    g.54357         .         .         .         .           g.54399
    c.2282-2743  aatccataaaagggttttaggcagagatgttacatgctctgtt  c.2282-2701

.         .         .         .         .         .           g.54459
tcctatttatttttaaacatgcttcacagaaaagtataaaacgatcacactggctgctac  c.2282-2641

.         .         .         .         .         .           g.54519
atacagaatgaattatagagtgacaagagtggaagctgtcaactgttggtgggaaacttt  c.2282-2581

.         .         .         .         .         .           g.54579
aattgctcagaaatcctttagttacaagtgacagaaaacctaacttaagctgacttcagc  c.2282-2521

.         .         .         .         .         .           g.54639
agaaaaggggaatttactggcttgtaacaatggtccaaatgatgtaatcagaacctaaat  c.2282-2461

.         .         .         .         .         .           g.54699
tctcatttcatgtctctcaggttagtctcactctgtgttaactcattcataggcaggttt  c.2282-2401

.         .         .         .         .         .           g.54759
ttatcatgtgagttcaggcttatgatggaaaaaaaataactctttattggttttcaagcc  c.2282-2341

.         .         .         .         .         .           g.54819
acactgtgatgactagtgccaactgggtctgattgtcttgacttggttcatttgcccatc  c.2282-2281

.         .         .         .         .         .           g.54879
cctgaaccaattatagtcaatgttctgattaggcaggatagtgtcatgccctaatattta  c.2282-2221

.         .         .         .         .         .           g.54939
acacttattacatgtggacactgtccaatcaggaatgaggtcagacctatacatctggtg  c.2282-2161

.         .         .         .         .         .           g.54999
tgaccatgccaatataccaactgaaaatcagccctagttataggtcatttccttaatcta  c.2282-2101

.         .         .         .         .         .           g.55059
aaggtacaatcagctctaatggaagcacgggaactgaaaactggggaggggtagtttcct  c.2282-2041

.         .         .         .         .         .           g.55119
aaaggaaaattcaagttctattatcagaagagggaatgaagtttaggcaggcagcataaa  c.2282-1981

.         .         .         .         .         .           g.55179
tatatccatgataggccaggtgcagtggctcatgcctgtattcccagcgctttgggaggc  c.2282-1921

.         .         .         .         .         .           g.55239
caaggcaggcagatcacgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaacc  c.2282-1861

.         .         .         .         .         .           g.55299
ccatctctactaaaaatacaaaaaatttacccaggcgtgttggcatgcacctgtagtccc  c.2282-1801

.         .         .         .         .         .           g.55359
aggtcctcgggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacctgggaggcggtggttgtggtg  c.2282-1741

.         .         .         .         .         .           g.55419
agccgagattgtgccattgcactccagcctgggcgacagagtgagactgtctcaaaaaaa  c.2282-1681

.         .         .         .         .         .           g.55479
accccaaaacaaacaaacaaaacaaaacaaaacaaaaaaatccatgatgagccaaaataa  c.2282-1621

.         .         .         .         .         .           g.55539
caaaatagcagtttcctctgatatatatgtgtggaatctgtgcctcctttgtaaaaaaaa  c.2282-1561

.         .         .         .         .         .           g.55599
caatattctcctttgagacaattttgttttctttctgaaggatgtatataactttcagct  c.2282-1501

.         .         .         .         .         .           g.55659
cctatgcagtatacagattactgatatctcctgaacttcctcacctttactactttctat  c.2282-1441

.         .         .         .         .         .           g.55719
taatgtctctatcttcagtgcctacagcaatgcttagcacatagtaagtatttaaatatg  c.2282-1381

.         .         .         .         .         .           g.55779
aatagtattttatacttatactttatattaagtattttaatatattaagtataataatta  c.2282-1321

.         .         .         .         .         .           g.55839
tacttactatagtaatatagtaagtacaaaataaatatgtatcttaattagatctgattg  c.2282-1261

.         .         .         .         .         .           g.55899
aaattcagtatgtagtctagtgattcatactcaggtacctcctcgaaaaggaaggtgttt  c.2282-1201

.         .         .         .         .         .           g.55959
ctagaatcctagtattacgtatgcatgtgcaaatatgcatacctaatatgcatatgcagt  c.2282-1141

.         .         .         .         .         .           g.56019
tcacacagtgcattctgaaaatgttgaaaacaacacaaaaacacttaatatcttcccatt  c.2282-1081

.         .         .         .         .         .           g.56079
tatatgcaatttgttagaaagtttatacaaacctgaaattatctttttccattgccaaga  c.2282-1021

.         .         .         .         .         .           g.56139
cagagaatgtgcaaaatgtggacaaagtttttaagggactgttttcaaaactgcagaaac  c.2282-961

.         .         .         .         .         .           g.56199
tgatacatgaatatatcaatgtacatatatgacctatgagtaacttataagttaacttat  c.2282-901

.         .         .         .         .         .           g.56259
acctataagtaactaaaatagcaaaacaaagcagcataacaatgcttttgggagattatt  c.2282-841

.         .         .         .         .         .           g.56319
ggcctaaataataataattattatgtttttttgagacagggtcttgctctgtcacccagt  c.2282-781

.         .         .         .         .         .           g.56379
ctggatggagtgcagtggcgcaatctgggctcacctcatccctctgcctcccaggttgga  c.2282-721

.         .         .         .         .         .           g.56439
tcaatttttgtgcctcagcctcccaagtagctgggattagagatttgcaacaccatgcct  c.2282-661

.         .         .         .         .         .           g.56499
cgctaatttttttttgtatttttagtagagacggggtttcaccatgttggacaggctggt  c.2282-601

.         .         .         .         .         .           g.56559
ctcgtactcctggcctcaagttatctgcctgcctcagcctcccaaagtactgggattaca  c.2282-541

.         .         .         .         .         .           g.56619
ggcgtgagtcaccgtgcccggttatgggcctaaattagaatcacttataattagaaaaaa  c.2282-481

.         .         .         .         .         .           g.56679
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.         .         .         .         .         .           g.56739
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.         .         .         .         .         .           g.56799
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.         .         .         .         .         .           g.56859
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.         .         .         .         .         .           g.56919
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.         .         .         .         .         .           g.56979
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.         .         .         .         .         .           g.57039
ttgacagtgatatgtttatttgggattattaattactcttaacaattatatgtgatctga  c.2282-61

.         .         .         .         .         .           g.57099
tcaacagtcatctgagtctgtctttagtctttcccttatatttttttcttttgattctag  c.2282-1


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