RAR-related orphan receptor A (RORA) - 5596 nt intron 05 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.723138
gtaatggcatgcatgcttctcctgggatgctctattcatgccctttgaagtaaaaggggt  c.820+60

         .         .         .         .         .         .  g.723198
atgtctgactttcctctaatgagttctgctaaatgatgcaattcacctttaccatttggg  c.820+120

         .         .         .         .         .         .  g.723258
ccacttaattttctgccctgcccccttgcttttgaccctctgctgtttcccatggtttat  c.820+180

         .         .         .         .         .         .  g.723318
ccaatacatgcattgacctctcagcattagaaatggggcaaaaccaacggaagcagtctt  c.820+240

         .         .         .         .         .         .  g.723378
tgaattctgcagaaaactgtaagttcaggaaatggctacattaacttcattagtggttta  c.820+300

         .         .         .         .         .         .  g.723438
ctttagttatattccaaggattgctttatacctaaggtgacaaaaaaaaaaatggcagtc  c.820+360

         .         .         .         .         .         .  g.723498
cacaaactgaacttggcccacagacatatttttttgcccagggcagagttttaaaatttt  c.820+420

         .         .         .         .         .         .  g.723558
tgaatcagttgctaatatttaaatttggataattatacccaaaagttcagcttttttagc  c.820+480

         .         .         .         .         .         .  g.723618
ttcttgtgggaggggaaaaaatgatctatttacactgagccaacatttgtgaatgtcaac  c.820+540

         .         .         .         .         .         .  g.723678
agccaactggcaacagccaggggattacacctttcaatgggcccacctgactcccgccat  c.820+600

         .         .         .         .         .         .  g.723738
ttatatcatatgcacagcccctgtaggcatctcatttttgcaactctgatatatagtata  c.820+660

         .         .         .         .         .         .  g.723798
aatgttcaacagaaatcagcttctttacttaccaaaatgttctgatgatggatattggtg  c.820+720

         .         .         .         .         .         .  g.723858
acaaaattgatgtaattcatataaggctcaccatgcaaaagacaaaaaactgtccttttc  c.820+780

         .         .         .         .         .         .  g.723918
ttattgctggaacattactgcttcttgggagatgtgacctagaaatgttgataacacaga  c.820+840

         .         .         .         .         .         .  g.723978
caatgggcaactttccatttcgaggaagttgtgttaacatccgctgctatatttaatcga  c.820+900

         .         .         .         .         .         .  g.724038
tttttaagtacagcactattattagaaaaactttgataagaacctttgtagtttttaaat  c.820+960

         .         .         .         .         .         .  g.724098
ttgatctgctcctcctggtggttcctcacacaaggttataatcctttgggatatgtcaat  c.820+1020

         .         .         .         .         .         .  g.724158
tagttgctgtggagatgactaagttaatacaaggagagaatgaagacttcagacggaaaa  c.820+1080

         .         .         .         .         .         .  g.724218
gaaacagcaggttcagacttgagcacagaaatcctcagttcacagaaataatggctgtgt  c.820+1140

         .         .         .         .         .         .  g.724278
tctttagacggtttctctacctctgcaccccataaaacatcttttaagtgaaaatttata  c.820+1200

         .         .         .         .         .         .  g.724338
tttccagtaaaatctttctccaaatagaacaaattgaatgttctttacggtttttacaca  c.820+1260

         .         .         .         .         .         .  g.724398
agcatctctttatgggtctaaatttaaatcctcaagagcagggacattttaagcctggtc  c.820+1320

         .         .         .         .         .         .  g.724458
tttaaccactgaacagcattaaaaggtgtattgcagctcttttgattaacagagaaacct  c.820+1380

         .         .         .         .         .         .  g.724518
ctgaactagaagccaagctgagcagaggtaggtttgatttttttttttttttcttgaact  c.820+1440

         .         .         .         .         .         .  g.724578
agaacaaaaaccttccatttttgtcatgaaatcttggttggctgagccttaagcagaact  c.820+1500

         .         .         .         .         .         .  g.724638
gtaatgaaagtacaattttcagatatgaataaggatttgattgaaagctgacatgatacc  c.820+1560

         .         .         .         .         .         .  g.724698
atgaaaaatgacctgactcactttaggtttgcctccaccttaccataaatactagtgact  c.820+1620

         .         .         .         .         .         .  g.724758
ctgtcctgtttgcttgtcaaatattcaatcctgaaataaatccataggccttaggcaaag  c.820+1680

         .         .         .         .         .         .  g.724818
cgtgcccttgaacatggcactttggctaaaaaatgcactcataccgaagtggggccagaa  c.820+1740

         .         .         .         .         .         .  g.724878
atggctgagccgattccctgaggctcccggacaagtcagcttcctcttccatggtctcac  c.820+1800

         .         .         .         .         .         .  g.724938
tttccagtgcagtctgggagccctgccccctcatgcttgctctatgtgcttttaaattag  c.820+1860

         .         .         .         .         .         .  g.724998
ggatttttcacaggtgttgtggtatttaccaagataaattaaatgagatcatcactagga  c.820+1920

         .         .         .         .         .         .  g.725058
gaattcccaaacccaaaactaaactagcatttatctggaaagtatataattgggctctaa  c.820+1980

         .         .         .         .         .         .  g.725118
ttctcttatcccatttatacatgcaaagtgtttcagggagctaagagtatcatgaaagtg  c.820+2040

         .         .         .         .         .         .  g.725178
gcccaagtcttgttgctgcttctccaaagctacttaaatttccctggtatttcttttggg  c.820+2100

         .         .         .         .         .         .  g.725238
gcttaaagcctgctatctctttaactaagactcttgacttcattttaggctaaactttgt  c.820+2160

         .         .         .         .         .         .  g.725298
catcagattttaaacaagtgaaaccaattgtataataggaaaataaattataaaccaaca  c.820+2220

         .         .         .         .         .         .  g.725358
catcctaagtccaattctctctttcaagtgtagtatgcacaacctattacttttagtgaa  c.820+2280

         .         .         .         .         .         .  g.725418
aaatatgacttcatccttggctaggaaattttgcccttggtgtacaattagtacctgaat  c.820+2340

         .         .         .         .         .         .  g.725478
tagacattccagataaacgacctaggttttaagtgcaaattaggtttgttactataattg  c.820+2400

         .         .         .         .         .         .  g.725538
atatctaaagctttgcgcaggagaaacagctgatatactgggcaaagcatgagacaagaa  c.820+2460

         .         .         .         .         .         .  g.725598
atccgcttatatgggttgtggtcctggcattaatataagttatacaacccagtatacacc  c.820+2520

         .         .         .         .         .         .  g.725658
acgtaacatctgcgagctgtagtttctctactcctagaatataaaggtctgtgtctgaat  c.820+2580

         .         .         .         .         .         .  g.725718
catagctctgctacttgccagctgtgacaccttgaagaagtcacttcactgtggttcagt  c.820+2640

         .         .         .         .         .         .  g.725778
ttcctcctctgtaaaatggagataatactagtacctttctcttggggttgttataaggat  c.820+2700

         .         .         .         .         .         .  g.725838
taagtgagaaaacatacatattcaggatagacacaaattatgtgggactggcatatagtg  c.820+2760

         .         .         .          g.725876
aatgctatatgtgttaactgctatcataattattaatg  c.820+2798

--------------------- middle of intron ---------------------
          g.725877            .         .         .           g.725914
          c.821-2798  tcattattatttgttaaacaaggacagtttggaccaga  c.821-2761

.         .         .         .         .         .           g.725974
tgctatctaaagttccttcccactatgaaaatctgtgactaactcagaagcgaggacttc  c.821-2701

.         .         .         .         .         .           g.726034
ccatctgaagtatcgaggcgctggctgtattgctgaagcagtcatggttggggcacatga  c.821-2641

.         .         .         .         .         .           g.726094
cttgccccagtcacaaagtgaggtagactatagattatctgctgagctcagacagaagcc  c.821-2581

.         .         .         .         .         .           g.726154
aggtctcctaactcctagcccaaggtatttcactattccagactttatctgagagaccac  c.821-2521

.         .         .         .         .         .           g.726214
gcttaaattctcgaattttattcagcctgaccatactcgcctttgctgaaatggagattt  c.821-2461

.         .         .         .         .         .           g.726274
aaaaatagcaaagtgtctaaaatcttacacttgccaaatcgactatgaattggaatgaaa  c.821-2401

.         .         .         .         .         .           g.726334
ggctgttggtgagcagatggtgtgaatgcaaccactgccctctactggtatgtcaggtac  c.821-2341

.         .         .         .         .         .           g.726394
actgcatgatttgttgtctcactttttattggctgttttaaataggtagggataagtggc  c.821-2281

.         .         .         .         .         .           g.726454
cacagtttcttaagacaaagtgaaaccacaagatgctaagtatcttattaactagaaatg  c.821-2221

.         .         .         .         .         .           g.726514
aaacataacctggaaggaaatgatatgagcctcttctcatccttcactccacagcatccc  c.821-2161

.         .         .         .         .         .           g.726574
cccctacttccctgcgaagactcttcatcttcatcatttttttatcggcaaaaattggtt  c.821-2101

.         .         .         .         .         .           g.726634
tacattctagaaacgaccttatatagtgagagttctttccaaaagaggtagttcactacc  c.821-2041

.         .         .         .         .         .           g.726694
ttatttatgtattttcttgtttcttactccccattatttttgtctttactcacctattct  c.821-1981

.         .         .         .         .         .           g.726754
ccagcgtcattgattctaagacatgtaatttactggcttctctctctcactctcagtttc  c.821-1921

.         .         .         .         .         .           g.726814
tcattctttcctttacatttgttcttttatttgtgttttattttttatgttatttattca  c.821-1861

.         .         .         .         .         .           g.726874
tgctgttttagtgtctatgtgttgccaagtagggccattcaggtttattatgtttcagtg  c.821-1801

.         .         .         .         .         .           g.726934
tctctaaggagattctggtttccagctccatttaggtgaacctgctctgttttcacacaa  c.821-1741

.         .         .         .         .         .           g.726994
acaagtctgcttctgtttgacaaaagcagtaacaaatttccaaacaaaaagatattctcc  c.821-1681

.         .         .         .         .         .           g.727054
ctagtgttgccaagtttgcattcagcaccgttcttttaaaatgacttgcctattctatac  c.821-1621

.         .         .         .         .         .           g.727114
tcaaaaccctagggagagggatcattttttgatatggttttatattcatgggattttgtc  c.821-1561

.         .         .         .         .         .           g.727174
aattcttttaaaaaatacttctttaatcatccttcccttccagaacaattattaccaagc  c.821-1501

.         .         .         .         .         .           g.727234
tgctccaaattgttagttcctggcatctagattctagcagccttctatgtggtcctcctg  c.821-1441

.         .         .         .         .         .           g.727294
cctgagcttctctgtgctccaatacaccaagcacaaaactgcttgttccatttccccaga  c.821-1381

.         .         .         .         .         .           g.727354
tataattttctttttttttttttaagagggagtctcgctctattgcccaggctggagtgc  c.821-1321

.         .         .         .         .         .           g.727414
agtggtgtgatctcggctcactgcaacctccagctttcaggttcaagcgattctcctgct  c.821-1261

.         .         .         .         .         .           g.727474
tcagcctcccaagtagctgggattacaagcacccgccaccacgcccagctaatttttgta  c.821-1201

.         .         .         .         .         .           g.727534
ttttcagtagagacagggtttcatgatgttggccaggctggtctcgaactcttgacctca  c.821-1141

.         .         .         .         .         .           g.727594
ggtgatccacctgcctcagcctctcaagtagctgggatcacagacagccaacaccacgcc  c.821-1081

.         .         .         .         .         .           g.727654
aatttttttttgtatttttaatagagacagggtttcaccatgttggccaggctggtcttg  c.821-1021

.         .         .         .         .         .           g.727714
aactcctgacctcaagtggtctgcccagctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcg  c.821-961

.         .         .         .         .         .           g.727774
tgagccaccacacccagccaatctcttccttttctgacagcttcaattacttttttcttt  c.821-901

.         .         .         .         .         .           g.727834
ctcttcttctgtaattcaactttataccttattatctagacttgaattgtccttccagtg  c.821-841

.         .         .         .         .         .           g.727894
tgttcatacgtgttcaccagattacaagctcctagagaaaacttctttggcctctaggtc  c.821-781

.         .         .         .         .         .           g.727954
tttcatatcttcaaactccttatgctcaagtataataataactaatattctgtagcacat  c.821-721

.         .         .         .         .         .           g.728014
tctaagtaatcctccccattctaagggctcaactcttttaattctcatggcagccctgtg  c.821-661

.         .         .         .         .         .           g.728074
aaataggtaccatttccctcattttacaaatgaggaaaccaagcacaaagaggttaaata  c.821-601

.         .         .         .         .         .           g.728134
acatacccgagatcacacagctagtaagcagcagagctgagatacagactcaaatggtct  c.821-541

.         .         .         .         .         .           g.728194
agctccagagtatgtggcttcacaactacactatgcatagccacatggtaggccctcagt  c.821-481

.         .         .         .         .         .           g.728254
aatgcttgttctgcaatttgcaggaaaaacaaaagaaatacctagttgtcaccataaaag  c.821-421

.         .         .         .         .         .           g.728314
aatatcattttctagtttttcaagaataagaataatccttcccaggtcaatgttatgtgg  c.821-361

.         .         .         .         .         .           g.728374
cagatgtgtcttcataaaaatgccaagaagaagcaccacgtcaatcatttcctatgtcta  c.821-301

.         .         .         .         .         .           g.728434
tctaggtcaatattttttcattcctagacattggtataaaggcacagaacaagggcaaag  c.821-241

.         .         .         .         .         .           g.728494
tcaggagggtctttgaagtcagcaggtcttatcttcaaatgctggctttgcaaagtccct  c.821-181

.         .         .         .         .         .           g.728554
gtcctccttcacgttcccaaatacaaaacagttccaaattacttgtttaaatgtgtaaag  c.821-121

.         .         .         .         .         .           g.728614
acagtcaaaactcgcacagcacattgttttctacttgttatttcttaaagcaaatattaa  c.821-61

.         .         .         .         .         .           g.728674
atcaccaattattcaaagaacttcgcttttcgtgtttgtgatctcccgttttctccttag  c.821-1


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