SATB homeobox 1 (SATB1) - 7850 nt intron 07 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.49372
gtcagttgtgtttcataagtggttctgtgctgtctcctattttctctttctttagtccca  c.1206+60

         .         .         .         .         .         .  g.49432
tctataactaaagtttattcttttacttctgtactaacattttctctctctcttcatgtg  c.1206+120

         .         .         .         .         .         .  g.49492
atcatattacctattcctggtggagcctcaattttaccactccttttcctatgatatact  c.1206+180

         .         .         .         .         .         .  g.49552
tctgaatcaagggaacctatgtgcagattgatcccaattcagggcctttgaaagactaat  c.1206+240

         .         .         .         .         .         .  g.49612
taaatgtcaaacgtactttaaactggcattacttatgcttttatataatggaatcataag  c.1206+300

         .         .         .         .         .         .  g.49672
ctatagtagatggttaagaaaagtttcatgactcagtcaaggctattggcaggattccag  c.1206+360

         .         .         .         .         .         .  g.49732
gcttctagcctattgtcttttccatttatgttgttactacccatatcaaacttaggtata  c.1206+420

         .         .         .         .         .         .  g.49792
taaatgttccctcttaaagttctactgcagcgttgttgttgttgttgttgtttgttgttg  c.1206+480

         .         .         .         .         .         .  g.49852
ttaacaccttggaagcaataatccacttaattctaagcagccattttgaaaaaatattat  c.1206+540

         .         .         .         .         .         .  g.49912
atgacttattaacataaaatatttgtaagctgtgtgcgctccctcatgctattgtcttcc  c.1206+600

         .         .         .         .         .         .  g.49972
aaattcattgtctagaccaggcatcagcaaactttattctgttatcgaccagatagtaaa  c.1206+660

         .         .         .         .         .         .  g.50032
tattttaggttttgaagcacttaaatctcggtcacactgtagagtaataaagcagccata  c.1206+720

         .         .         .         .         .         .  g.50092
gactataaatgaatggcactgggtatggtagtatttcagtaaaactatttataaaacagg  c.1206+780

         .         .         .         .         .         .  g.50152
ccatggagtaagtgtggctggcaggccttagtttgcagactcatttgtagagatctcact  c.1206+840

         .         .         .         .         .         .  g.50212
gcctgcttatacccctaatgtgcacacctttgtcttcctggcccaattcctgtgaaggta  c.1206+900

         .         .         .         .         .         .  g.50272
ctatctatcagcctggaagatgtttaagagggtcatggagaaaaagtgatatatatgaga  c.1206+960

         .         .         .         .         .         .  g.50332
ggtcataagataaagatatttgagaagccctaaacaaattgactctgttgaactgtgaat  c.1206+1020

         .         .         .         .         .         .  g.50392
gagaagaatttttttctttgtttggaaactagtatgatacgtgatatatatggtgtttat  c.1206+1080

         .         .         .         .         .         .  g.50452
ttttggcccaggtacactaaaacaaaacaaaaaacaacaacaaaaccaaaaaacaaacaa  c.1206+1140

         .         .         .         .         .         .  g.50512
aaacgaaaaaccgcgtaactttgattagaagaaggacattatgccttttcagctcttttg  c.1206+1200

         .         .         .         .         .         .  g.50572
ttttaccactgttctttcttttgtcaatttatcttattttttgacctgactcacattttc  c.1206+1260

         .         .         .         .         .         .  g.50632
ctttcatatttaagttattttgtttattacatgattatgattatgagaataaaattctgg  c.1206+1320

         .         .         .         .         .         .  g.50692
tacagaagtaatctagtattaattcctagtttgcagagtttccatacctaggagaatccc  c.1206+1380

         .         .         .         .         .         .  g.50752
agctgtgacttatttttggcgtgccttaactagatggggagttaggagacctgacaaagc  c.1206+1440

         .         .         .         .         .         .  g.50812
ctctaattcagtgtttgttttcagtcgattcatctttttttttttttttgtacgttcgtc  c.1206+1500

         .         .         .         .         .         .  g.50872
tgtttttgaaaaggcagttgcacaaggctatgtctcaggttaaaattgtatggttttacc  c.1206+1560

         .         .         .         .         .         .  g.50932
tagttctatatctttatagcttaaaaaactgtgttcatcattagctggtgaacttaatat  c.1206+1620

         .         .         .         .         .         .  g.50992
gacacctatattcagttgggggataattattgaaaatgaatggctcaaaagtcaaccctc  c.1206+1680

         .         .         .         .         .         .  g.51052
taaatattcctgtttctggtagcattctttattttagtaaatatagtaagtactaataat  c.1206+1740

         .         .         .         .         .         .  g.51112
tctccgtactaggccaaaaaaagtaggtctctacataacatttcaataatgcttttttga  c.1206+1800

         .         .         .         .         .         .  g.51172
attgagttaaaagcccacaaagacatcatgacatagacacaaattatatatatatgtata  c.1206+1860

         .         .         .         .         .         .  g.51232
tatatgtgtatatatatgtgtgtgtgtatgtgtgtgtatatatatgtatatatgtgtata  c.1206+1920

         .         .         .         .         .         .  g.51292
tatatagttactggtgtcttaaaaattgagcagttatttcttaaagcactaagtaagtgt  c.1206+1980

         .         .         .         .         .         .  g.51352
cctttatatagtgaagaatgctaagacagtagaactcagagaagtgaggataaagttgtc  c.1206+2040

         .         .         .         .         .         .  g.51412
acccatcattacagcttttctccttttgggtttatgatgttacagccattactatgagga  c.1206+2100

         .         .         .         .         .         .  g.51472
gttggccatttgttctgcctttggtccttaaaaggacaaattccacaatatctacaggat  c.1206+2160

         .         .         .         .         .         .  g.51532
ttgttactggaagaaaggcaaaattttctcttttataccatattaatctctttgaaaaag  c.1206+2220

         .         .         .         .         .         .  g.51592
gtaatcatctctgtggttaatatcaaaaacagtgacttttttttctgtgagaggagaatg  c.1206+2280

         .         .         .         .         .         .  g.51652
aaaactttaccttgtatagcttgattgcagatacctccttattaataatagccaatttag  c.1206+2340

         .         .         .         .         .         .  g.51712
gaaaaaaagtcattaccaaaaaaatatttagtgccctggattatgaagggtgttttaaag  c.1206+2400

         .         .         .         .         .         .  g.51772
ctttatattgataattgatactcttcagtcaaagtagatatagggccatatttgaagatg  c.1206+2460

         .         .         .         .         .         .  g.51832
tttgacttaagaggaaatttgtatatatatttcaatattaattccttgagaactaacttt  c.1206+2520

         .         .         .         .         .         .  g.51892
tgcacatgcaggcatgaatttattttcattggtcattcttaaaaaccacacacacataca  c.1206+2580

         .         .         .         .         .         .  g.51952
tacacagctgcatttattttttaatgattatgcattggtatgactggatgtagtgtgttg  c.1206+2640

         .         .         .         .         .         .  g.52012
atttcaaagtgtatgcatttcaataaaagcaggtgcagagggtatggtgtgagtgtggag  c.1206+2700

         .         .         .         .         .         .  g.52072
tatgaaaatacacatgctaatgcgtatgtatagacaaggagctctgcagagttaaatcac  c.1206+2760

         .         .         .         .         .         .  g.52132
acatcacacatttgtgtgcacctagtacaatgtgcagttccaactccaacttttaaaaca  c.1206+2820

         .         .         .         .         .         .  g.52192
ttaaaaaaccaaacaccgcatattctcactcataggtgggaattgaacaatgagatcaca  c.1206+2880

         .         .         .         .         .         .  g.52252
tggacacaggaaggggaatatcacactctggggactgttgtggggtggggggagggggga  c.1206+2940

         .         .         .         .         .         .  g.52312
gggatagcattgggagatatacctaatgctagatgacgacttagtgggtgcagcgcacca  c.1206+3000

         .         .         .         .         .         .  g.52372
gcacggcacatgtatacatatgtaactaacctgcacaatgtgcacatgtaccctaaaact  c.1206+3060

         .         .         .         .         .         .  g.52432
taaagtataataaaaaaaaaattaatgtaaaatatgtacatacaaatacaaagttacatg  c.1206+3120

         .         .         .         .         .         .  g.52492
atagggtcagatgaagatactgtttcttataaacggcattaagaccttaatatgatagaa  c.1206+3180

         .         .         .         .         .         .  g.52552
aacacttgtatgaattgagggttattttagtcattgaagctctgtataactttaaaaccc  c.1206+3240

         .         .         .         .         .         .  g.52612
tgggtcttaggttttaactattgagaattttcttatcatcttaatagggttccctatatt  c.1206+3300

         .         .         .         .         .         .  g.52672
aacacattaccctcccaagactttcgcacatgggtttttttttaagcctaccttttctga  c.1206+3360

         .         .         .         .         .         .  g.52732
aaatttatggtaaacttatatagttacttgttttaaggaatttttccccttctgaattga  c.1206+3420

         .         .         .         .         .         .  g.52792
tgggcatgggttctttaattgccgttgaagatatcagcttttagcatatgtcattcattc  c.1206+3480

         .         .         .         .         .         .  g.52852
agttatgcctacttgatgtctttttaatggaaacctatggctaaaagtaattgccaaagc  c.1206+3540

         .         .         .         .         .         .  g.52912
ttctagatttctacttttcaattcacttctctatcttattgctatttaatggttctgata  c.1206+3600

         .         .         .         .         .         .  g.52972
catgcaaatacattccttaataccctttgatttttaaaagaataaaattcagagtttaac  c.1206+3660

         .         .         .         .         .         .  g.53032
tctgatcccactctgtggcttttttcccctttttcttccccctcctcttgtcttttggca  c.1206+3720

         .         .         .         .         .         .  g.53092
cactttattttccagtaaaataaagaatgaagatggattattcaaaactgataacagtaa  c.1206+3780

         .         .         .         .         .         .  g.53152
tggaccatcatgtaatgttttattaaatttgagttctgtaaattatgtggtggagagaaa  c.1206+3840

         .         .         .         .         .         .  g.53212
tttgcctgcttaagtataacagaaattgctactgtgtttctataattcttcacagtgtaa  c.1206+3900

         .         .       g.53237
tttaagaaaagtccactatccatat  c.1206+3925

--------------------- middle of intron ---------------------
                      g.53238           .         .           g.53262
                      c.1207-3925  cactattgaataaaaggtaaaaagg  c.1207-3901

.         .         .         .         .         .           g.53322
tgctattaccccaacaagacagctctctggttagcctgccaaacgacagagataaatgtg  c.1207-3841

.         .         .         .         .         .           g.53382
tctacttaaaacttacttggcatgaatccatggtagtaggtggagtttgaaaatagtctt  c.1207-3781

.         .         .         .         .         .           g.53442
ttacctggacataggattaaaaattcaccaaacaacagaggcaggtagccttgaagaata  c.1207-3721

.         .         .         .         .         .           g.53502
ttctatgtattttctttttaggagggaggtttcatcaaatcatattttcttcctgagggc  c.1207-3661

.         .         .         .         .         .           g.53562
tttgaagttccatgaagctgataaaatctatttgaatcagtgattatgttcaaagaggag  c.1207-3601

.         .         .         .         .         .           g.53622
acaaacgggaggccagacagcctttttgttcagattggcagtctctttcgcttatctgct  c.1207-3541

.         .         .         .         .         .           g.53682
gttttaaagaattcataattagcttttggaaatactgataatatttattggaggtttttt  c.1207-3481

.         .         .         .         .         .           g.53742
ctttcttttacaactactaatgaattttacttgtaataacttgtaaactgtttttggaat  c.1207-3421

.         .         .         .         .         .           g.53802
gtaaaaacaggtttaggaattcagcagtaaattcattctttagttgaaaaaattagaact  c.1207-3361

.         .         .         .         .         .           g.53862
ctgacttaaccgctatgtaatgacaatgcaaaacaattttgtgttttcatagatacagca  c.1207-3301

.         .         .         .         .         .           g.53922
cacatctaattattggtaagatgtgaagtcccaatgaaaggcagcttctgattttcaata  c.1207-3241

.         .         .         .         .         .           g.53982
aaatgaatatttatgaggtactggtaacttcctacataacatacaagttctcaggttctt  c.1207-3181

.         .         .         .         .         .           g.54042
ttcagacacaagaatgactaatgattttgtttaatttaattcaacaaatttattgagcgc  c.1207-3121

.         .         .         .         .         .           g.54102
caatgattcttgatactgatgacatattttagtcctgatgtttcagcatattctatgaca  c.1207-3061

.         .         .         .         .         .           g.54162
taaataaggtacatgatggccttttcatactattttttagcatgaagaatttttggtaaa  c.1207-3001

.         .         .         .         .         .           g.54222
aggtcacgcttactgtccactgtgtgggcagtactacaaatgaccttggcaagtctgtac  c.1207-2941

.         .         .         .         .         .           g.54282
tatgtcttcaattataggatatgggaactggtggccacatatatcttgaattcagcatat  c.1207-2881

.         .         .         .         .         .           g.54342
aaatatgagtgcagctattcaagtaacaacaacctgaacaggaccaaaacatacattccc  c.1207-2821

.         .         .         .         .         .           g.54402
atatctgggatctgatagcagtcattttgcatccaaaattattctaaagtgacttttttt  c.1207-2761

.         .         .         .         .         .           g.54462
tttaagtaattatcactaatcaaaatgttttctgacaatattttcaagcatttccaccag  c.1207-2701

.         .         .         .         .         .           g.54522
ggggcactcccctcattgaaagctctgggccaaaaaaaaaaaaaaaaaaacccaaaggtt  c.1207-2641

.         .         .         .         .         .           g.54582
tctgaaacacctgagactgtctacactggctgctttaaagctctttgagtgtttcagggt  c.1207-2581

.         .         .         .         .         .           g.54642
ttgaaacatcactttataccatcaacatatttcagacgaacaaaaaaccttgttccagta  c.1207-2521

.         .         .         .         .         .           g.54702
gaataattaagtggtagtaaaatgctttgcccctaaaaacacttgtatgcttaaatagga  c.1207-2461

.         .         .         .         .         .           g.54762
agtcacaccaacatcaaaatataggtagagaacttttaaaattttctcccaagtgacata  c.1207-2401

.         .         .         .         .         .           g.54822
actaccttccaatctcaaccatatggaaatgacttagtcttatatgttagcaagacttga  c.1207-2341

.         .         .         .         .         .           g.54882
gaaagaatattattttgtatgttttcctgtatttgactttctcactatagatctctgctg  c.1207-2281

.         .         .         .         .         .           g.54942
cctcaggaaatatttttgatagaaatatgtgatatagtactttgttatttgggattttta  c.1207-2221

.         .         .         .         .         .           g.55002
aatacctaatttcaagtttcccaaataacatcctaaatatttataactatgttttgccct  c.1207-2161

.         .         .         .         .         .           g.55062
aatctaatttttttaattattagacaattaggaaaaacatctcaaaaaatgccacagaac  c.1207-2101

.         .         .         .         .         .           g.55122
ttttcactgtaggcccaacatgagtgctaataactactactagaattgactcatgggtaa  c.1207-2041

.         .         .         .         .         .           g.55182
cacatcttgttcttaagtttctatcacctgtttgtgattgttttctccattgtggtcttt  c.1207-1981

.         .         .         .         .         .           g.55242
atacacatgatcagtccatttagtaaatacttatcaaacatttacatgagagacattgtg  c.1207-1921

.         .         .         .         .         .           g.55302
ctgggatgatgaaagtgaatattagattattatgctcaaggaatttgtagcatattgtgt  c.1207-1861

.         .         .         .         .         .           g.55362
ttatactgatgttttcatgtatccatatctgtgtagttgagaatatattgctttgtcaag  c.1207-1801

.         .         .         .         .         .           g.55422
tacattttttaagacataacatttggtggagaggagtaaagagcaagggttatttcatta  c.1207-1741

.         .         .         .         .         .           g.55482
cacctattttcaaactttttttttttgagacctgaatgttttactttcaatatggcacat  c.1207-1681

.         .         .         .         .         .           g.55542
cagaaacacagtcaaactaattaggtggccttgtgcaaattaaatagctggatgattgac  c.1207-1621

.         .         .         .         .         .           g.55602
tgcctgtttgactgaattttagttaaattgactagatgttttgctcttgtgtagacacag  c.1207-1561

.         .         .         .         .         .           g.55662
ttacagcattactcgttagtatcctaaggacacatgcccttcattcttcagtcacatttc  c.1207-1501

.         .         .         .         .         .           g.55722
ttagggtaaaaacgaaagttcaggtccaatttccaggctttagctgtaagagactaagtg  c.1207-1441

.         .         .         .         .         .           g.55782
agagacaactttaaaatggactctgaagccctctgcacctgttaaaagttctttttaaat  c.1207-1381

.         .         .         .         .         .           g.55842
accagcttataaatcattttaagaagtatcagtacttttgtattgtctgcacccaactgt  c.1207-1321

.         .         .         .         .         .           g.55902
tgcatttcggcaacatggtacattatctttaaatttgggaacaaaaccaggtttgtactt  c.1207-1261

.         .         .         .         .         .           g.55962
ctaacaaaccatgaaaaaaacaaatgttttaaccttggggcttcattgttttgacatgac  c.1207-1201

.         .         .         .         .         .           g.56022
acgttaccttccttcccccaatatacctttaactgtttctgcaggatattggaaagtaga  c.1207-1141

.         .         .         .         .         .           g.56082
tttgcaaattatatagaaatcctgacaaaattttattctgaagctgatactctggctaag  c.1207-1081

.         .         .         .         .         .           g.56142
tgaagaaaccaaatatgtcttactattccaagcattatttcatgtacaagattaaagaga  c.1207-1021

.         .         .         .         .         .           g.56202
gaagagctgcttagcccttataaaatgaacagaaaattttccaattcttttatttcatat  c.1207-961

.         .         .         .         .         .           g.56262
tgtctcttaaatgcaatggggagaaccacccatttttgaaagagttcttccaaaagttaa  c.1207-901

.         .         .         .         .         .           g.56322
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.         .         .         .         .         .           g.56382
ctaatgatttataaatttcttctatcactaacaatttttattccccaagaaatttgataa  c.1207-781

.         .         .         .         .         .           g.56442
ttacagaatttgatactcttttccttggcatgctgtgatggactttcgcaatgttgaaaa  c.1207-721

.         .         .         .         .         .           g.56502
ttagttaatatatttcaaatcttgtctatggtttttaaagttcaaaatttaaacctgtta  c.1207-661

.         .         .         .         .         .           g.56562
cccagtggtataatacagcaagatagtatttagaatcatttgtgataatcagtgaggttc  c.1207-601

.         .         .         .         .         .           g.56622
tctgaaaatggtaaattgaaagggtcacgtagtgtcatgtactttgataagtcagagttt  c.1207-541

.         .         .         .         .         .           g.56682
aaggaataattttaaacattgcctgtgaaaatacagcataaaccttaggtgatgctttag  c.1207-481

.         .         .         .         .         .           g.56742
taataacctttgttctaatatgttaaaattcattttctggtattttctttgaaagttcta  c.1207-421

.         .         .         .         .         .           g.56802
cttctctagaaatggctttgtatctttacatattgggctgtaggcattacactgcctttg  c.1207-361

.         .         .         .         .         .           g.56862
tctaggcagcttgggaactatacagttcagtgctgttgcattataaggatttcgtttatt  c.1207-301

.         .         .         .         .         .           g.56922
cttaacttccctggatcgtctctctgtgaaagatttcatggcaagttaagctactcaaag  c.1207-241

.         .         .         .         .         .           g.56982
gaaggagaccaattaggcagtttcagtttatgttatatgtaaagcagatgcttaataaaa  c.1207-181

.         .         .         .         .         .           g.57042
ttaagaatacaattgaggctctcttctctaccacttcagttgtaactaatatattcctat  c.1207-121

.         .         .         .         .         .           g.57102
gcagaattaatgcctctgactgttcattttctaaacagagtggagaagaaaagggaagga  c.1207-61

.         .         .         .         .         .           g.57162
tcactgctggccaggcaaagcaaggcagcaggctcaccctgtgcctttcatttcttgcag  c.1207-1


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