sodium channel, voltage-gated, type IX, alpha subunit (SCN9A) - 4367 nt intron 21 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.147708
gtaagaaaatactaaactttataatgttcttattttttaatggggtttaaaatataaaaa  c.3891+60

         .         .         .         .         .         .  g.147768
caatgggtatgtagaaattatgagttgtttctgtttacataaatacataggctgtttatg  c.3891+120

         .         .         .         .         .         .  g.147828
tatgtgtgtgtacatatacatatatacatatgcatatatgtatatatgcatatgtatact  c.3891+180

         .         .         .         .         .         .  g.147888
atatagtatgcatttacatactatatacagtatgcatatatactatatatagtatgcata  c.3891+240

         .         .         .         .         .         .  g.147948
tatggtatatatatgcatattatatacactaatagtatatatatgcatattacatatact  c.3891+300

         .         .         .         .         .         .  g.148008
aatagtatatatgcatattatatatactaatggtatatatgcatactaatatataaatac  c.3891+360

         .         .         .         .         .         .  g.148068
taattatagcattaattaaatagtatattactaaaaatagtataatactcattagtatat  c.3891+420

         .         .         .         .         .         .  g.148128
actagtatattactaaaaaagtataatactaattagtatatactattatatattaatata  c.3891+480

         .         .         .         .         .         .  g.148188
tacagaatatgaaagactatatataaaatatgcatatatagtatagtatatatattattt  c.3891+540

         .         .         .         .         .         .  g.148248
catttactgtacatattagtatatatatgcatactctctctctctctatatatatatata  c.3891+600

         .         .         .         .         .         .  g.148308
tatacacacacagtatttcagtgcatattgtttaacaagggaataagttaatcacagtaa  c.3891+660

         .         .         .         .         .         .  g.148368
tcctgcctttatctaatattgtcaaacaatagaatgatccaaatgagtgacttttttcat  c.3891+720

         .         .         .         .         .         .  g.148428
attaaatggaaatcttccctgtgctaggaagtccaagtgaaaggggaaactattgttcct  c.3891+780

         .         .         .         .         .         .  g.148488
aacatcatctctcatacataagtaatcaaggacctacttatatcaggtgttcaaataata  c.3891+840

         .         .         .         .         .         .  g.148548
tttgtttaagaaactacctgggtaaggagcattagaaaagataggtaagtgagacagcat  c.3891+900

         .         .         .         .         .         .  g.148608
cagccatcacatttaatttcacctttaaaataacattgcaaagtaagtggaattataact  c.3891+960

         .         .         .         .         .         .  g.148668
aaattatatttgagaaaactaaagctcagagagtttacttaatttgcacttaggctgcag  c.3891+1020

         .         .         .         .         .         .  g.148728
agtgcctgaaaagatactcaattagcagagacaaacaagttataatgaataacaactacc  c.3891+1080

         .         .         .         .         .         .  g.148788
ataacctagctttaaggattgtattaaaccagcaactttgtaacacacatggaggacaac  c.3891+1140

         .         .         .         .         .         .  g.148848
aactctattttctgtaattagtccatatcctcatgtgttggtactcctctaaaatttctt  c.3891+1200

         .         .         .         .         .         .  g.148908
ctccagatttatacctgctattttatgcctctgttctggaatgcttcccctgccctgtcc  c.3891+1260

         .         .         .         .         .         .  g.148968
cgaccctaacccgtttgtatagcagacaaacacctatctgtcctttaaggctcaatttaa  c.3891+1320

         .         .         .         .         .         .  g.149028
agttgccttgtccgtccaccaggagacataactggatattctctctctgttcagacacct  c.3891+1380

         .         .         .         .         .         .  g.149088
aaaatcctcattatattgtattttacttatttgtttacttaactgcctccctaccttacc  c.3891+1440

         .         .         .         .         .         .  g.149148
ttctctgagcaatttaacacggagattagtccagcttactgatactttaagtgtggttta  c.3891+1500

         .         .         .         .         .         .  g.149208
ctgaccagctattagcattatctacaaacttattaaaaagacggacggatcatgaggtca  c.3891+1560

         .         .         .         .         .         .  g.149268
ggagttcgagaccagcctggccaatatggtgaaaccccatctctactaaaaatgcaaaaa  c.3891+1620

         .         .         .         .         .         .  g.149328
attacccgggcatagtggtgctcacctgtagtctcagctactagggaggctgaggcagaa  c.3891+1680

         .         .         .         .         .         .  g.149388
gaatcgcttgaacccgggaggcagaggttgcagtgagccgagatcatgcaactgcactcc  c.3891+1740

         .         .         .         .         .         .  g.149448
agcctggggaacagagcaagactctgtatcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagcaaattct  c.3891+1800

         .         .         .         .         .         .  g.149508
tggatctcaccccagacctactgagtcagaaactccaggatggggataagaaacttgggt  c.3891+1860

         .         .         .         .         .         .  g.149568
tttaaccagcctcaagtgaacattagagatctttcagcctaccaaatcttcactgttatc  c.3891+1920

         .         .         .         .         .         .  g.149628
cctacaaacctaattatgactgcaatctctgctattttaattatccagtgtataacggtt  c.3891+1980

         .         .         .         .         .         .  g.149688
tccaagtataaaagaaagatcatgattatacaaaaaagttcataagcacaattcaaaaat  c.3891+2040

         .         .         .         .         .         .  g.149748
attctatctacaagttgaaaattacaagtttcattttgtgcagaaaggtggtattagaat  c.3891+2100

         .         .         .         .         .         .  g.149808
tcattgacattaacttaattttttgagcattaatagaatgttacaatctatcacaacttt  c.3891+2160

         .         .      g.149832
cccctacaaaaccacttccttcag  c.3891+2184

--------------------- middle of intron ---------------------
                        g.149833        .         .           g.149855
                        c.3892-2183  tgattaagccagcccactattta  c.3892-2161

.         .         .         .         .         .           g.149915
actctgtttgctctttgttctttatctgtattacaggtgaattggatgcaggagaatagt  c.3892-2101

.         .         .         .         .         .           g.149975
ttagtatattttgagaggcaaatgtctatttagttacatttgttaaccatgcaaaaagag  c.3892-2041

.         .         .         .         .         .           g.150035
acatttattcatgccgcagggctattttgaaggataaatgaaataatgaaataatgcatt  c.3892-1981

.         .         .         .         .         .           g.150095
tgaggcatattgtagtcagcttgtttgagtccttaggctctttagctttcccaactggct  c.3892-1921

.         .         .         .         .         .           g.150155
tctcatcagaccaataggtgcctgtctttctcagagacccatgattccatcattactcac  c.3892-1861

.         .         .         .         .         .           g.150215
attttttagaaaaacattttaaacaccaactatgtgtcaggtgttgtgatataaaaaaca  c.3892-1801

.         .         .         .         .         .           g.150275
cagagtacagtggtacatagaccccggtccccaaagagtgagtagggtcaatggttacaa  c.3892-1741

.         .         .         .         .         .           g.150335
gagagacagacaagggcacataatgatacaggaatatacagtagggagtggctatccggg  c.3892-1681

.         .         .         .         .         .           g.150395
gaagtctgggaagacatcacaaggaggtgacatttcagacatttcatgactgaagagtaa  c.3892-1621

.         .         .         .         .         .           g.150455
gccccaaatcataggcagataggcattcaaggcagtgataccacatggtagggaggcaca  c.3892-1561

.         .         .         .         .         .           g.150515
gaatagattgtgcaaggtgtgcttggtcagtgactagatgtatcagagtgcctacgtgat  c.3892-1501

.         .         .         .         .         .           g.150575
aaacatagtagggagggcagcaggaaatgagcatgaaaaggtaggctctattaagagctg  c.3892-1441

.         .         .         .         .         .           g.150635
gctactttgaacttcattctctattcctattcctcctaatcttttttgaggtcacataga  c.3892-1381

.         .         .         .         .         .           g.150695
ctgtaagaatctgatgaaagttagaattgtctttccggaaagacagcacaaccataatgt  c.3892-1321

.         .         .         .         .         .           g.150755
ttgttatataatttcatgcccccaggaaacctctacaggtccatgaactccaaataatca  c.3892-1261

.         .         .         .         .         .           g.150815
ttgctctggaccaaaggtcaacaaaccccagcctgtttttgtaaaaatgttcttggaaca  c.3892-1201

.         .         .         .         .         .           g.150875
cagccataccagtttgtttatgtatgacccatgactaccatggcagagttgaatagttgc  c.3892-1141

.         .         .         .         .         .           g.150935
aacggagatataacccacaaagcctaaaaatatttataaaaatgtttgcaaaccttctcc  c.3892-1081

.         .         .         .         .         .           g.150995
ctagatgatctgattagtagtcagagatccttagtatttctctattttaaagcatcttga  c.3892-1021

.         .         .         .         .         .           g.151055
gaacctgcttaatacattgcagaaaagaaggatcccagtgctccttccctaacaggttaa  c.3892-961

.         .         .         .         .         .           g.151115
tctttaacacatttgtacttgaatgggtgctcaagctgaagtgtaagatgacaggtaggt  c.3892-901

.         .         .         .         .         .           g.151175
tttgaaagattaagtaaataagaaaatctggagagtgttaaatgccacaggaattgccct  c.3892-841

.         .         .         .         .         .           g.151235
ggatgaaaactggagtggcaaagacaaactggtgatcaatagcagtacaaatgctgaaaa  c.3892-781

.         .         .         .         .         .           g.151295
gcagaaataaagaaaggattaaagaaaaactgttcctaatttttgtcttaactgaggcca  c.3892-721

.         .         .         .         .         .           g.151355
gcactatatatatttagtcaaaggcttacatataaagtatttagagtaataataataaat  c.3892-661

.         .         .         .         .         .           g.151415
ttaaaacgattgctcttatttcgtagaaccagccaaatctaaaggatttaaaccatttaa  c.3892-601

.         .         .         .         .         .           g.151475
agattctcaatccttttgtggagaatgtctcaaaaaaagagaataagaaaagaaaataat  c.3892-541

.         .         .         .         .         .           g.151535
taaattaaattaaaatgatgtccagtcataattccacctacctgatatacaccaatagtt  c.3892-481

.         .         .         .         .         .           g.151595
tctctatgggggaatctttaatgctggtaataataggatcatgaacatttaaatgtatat  c.3892-421

.         .         .         .         .         .           g.151655
aaatatatatttttcatttatgtttatacatttcttttttttccagagtgtacagatttt  c.3892-361

.         .         .         .         .         .           g.151715
acaagtttaccttatcaataacaggttttggtttattatttttatttattttacatttat  c.3892-301

.         .         .         .         .         .           g.151775
ttaagctattatattatcttagttattttgtcttatattttgctaacaattttattgtgt  c.3892-241

.         .         .         .         .         .           g.151835
gataatcatgtaatttgtaagcctggtgatcacagagttcatgtcttattttgtcttgct  c.3892-181

.         .         .         .         .         .           g.151895
tggcacactgctgagtgtagagtaggcatttaataaacatgagtcggctggttggtttga  c.3892-121

.         .         .         .         .         .           g.151955
tgtcttagatatttaagggcggcttttctaatttatttatgtctgcatggcatttctttc  c.3892-61

.         .         .         .         .         .           g.152015
atgttgcctatttaacatcttactaatcctaatcatgcttttctttcttttgaatactag  c.3892-1


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