senataxin (SETX) - 4213 nt intron 02 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.6397
gtaataatttttttttttagcaggagttcagagcaccaaggtaagtgcaatgatggaaac  c.-8+60

         .         .         .         .         .         .  g.6457
atgtgcagagtcctaaagggacagagaagaaggtcatcagagatagactggaagagagga  c.-8+120

         .         .         .         .         .         .  g.6517
cgggtcggacaggccccccccccagacgtgatgacactcaggaagagcttgcacactggt  c.-8+180

         .         .         .         .         .         .  g.6577
tgttctcaaatccagctttctcttcgaatcttagtggagttctttaaaagggaaacaatt  c.-8+240

         .         .         .         .         .         .  g.6637
ttatccataggatcttttctacttttttttttaagttcctgaggtaagtctgatgtgtat  c.-8+300

         .         .         .         .         .         .  g.6697
tcacagttaagtaccgggcagaggtaggagggtgggtttccaaggccagtggaagagctt  c.-8+360

         .         .         .         .         .         .  g.6757
ccataaaggcagggaataccagtcaccatgaatggttttaggaagagcaagtcaagggag  c.-8+420

         .         .         .         .         .         .  g.6817
gtaagtgtggaggaaagagatgatgtggaagctggatcatcgcgggccttgtgtgtgttg  c.-8+480

         .         .         .         .         .         .  g.6877
agctcagcaatttgaattttatcccaacattggaggaggagtcatttgtgctttcgaagt  c.-8+540

         .         .         .         .         .         .  g.6937
ccagtttggggctttggcctctggcagcattttggaggaggaattgatggcgatcaaaga  c.-8+600

         .         .         .         .         .         .  g.6997
agaaatagatcatttaggcttcttcagtaatccaggcaaatgatgaaaatgtactgaact  c.-8+660

         .         .         .         .         .         .  g.7057
aaggcagtggcggttgcactgagaagaaagtagagatgtaattaaggggtaggctctgga  c.-8+720

         .         .         .         .         .         .  g.7117
gctcagagattgcggctgagggagaaggagcgtataggataattcctaggttactggttt  c.-8+780

         .         .         .         .         .         .  g.7177
gaaaattgaatgtatggtaatgtcatcaacaagggaatatagaacaaataacagatttaa  c.-8+840

         .         .         .         .         .         .  g.7237
gggaaggacttcgttgggttctggtcatgtttactttgaggtgcctgtcagatatgtgag  c.-8+900

         .         .         .         .         .         .  g.7297
tagagatacactgtatgcagttggatattgaatatatctggagttctaggctaggctgtc  c.-8+960

         .         .         .         .         .         .  g.7357
agttattgagtaggtggaacagtgcatcatttcactcaacctccccagtagctgcgacta  c.-8+1020

         .         .         .         .         .         .  g.7417
caggtgcataccaccatgcccagctaatttttatatttttagtagatacggggtttcacc  c.-8+1080

         .         .         .         .         .         .  g.7477
atgttggccaggatggtcttgatctcttgacctcgtgatccctcacgcctcggcctccca  c.-8+1140

         .         .         .         .         .         .  g.7537
gagtgctggaattacaggtgtgagccactgcgccctgcctgcattaagttttacaataca  c.-8+1200

         .         .         .         .         .         .  g.7597
ttctcagtctgggcagcttcaatctaggcagtagttgaagcagtggtttgaagtaggccg  c.-8+1260

         .         .         .         .         .         .  g.7657
cccagaaagagtactgaatgaagaggtgagaattctcaggacaagccttcgaaaacttta  c.-8+1320

         .         .         .         .         .         .  g.7717
gcatttatatgagtaacaaaggcaggggtaattatgaaggtgattgggtagaagtggtgt  c.-8+1380

         .         .         .         .         .         .  g.7777
ccaaaaaatggtgtgttgtaggtaaggaaaggatgggcagcattttcatatgctttagca  c.-8+1440

         .         .         .         .         .         .  g.7837
gagtcaggtcaggaacctattggattggtaatgtaaagattgttagggacttcacattca  c.-8+1500

         .         .         .         .         .         .  g.7897
gtggagtgtaagggtagaagccagagtgcaaaggagctgaagagctgggaggtagtgaat  c.-8+1560

         .         .         .         .         .         .  g.7957
ctaaacttccagatgtttagctgagaagtgtagaagaaagagattgttatttgaagtttc  c.-8+1620

         .         .         .         .         .         .  g.8017
tggctagttaatgttgagaaatggatagcctaaggataagtctgtagaaaattacagtaa  c.-8+1680

         .         .         .         .         .         .  g.8077
tacctatggtgaagcatcctatatttttggttttgacacattagctctctttttggtggg  c.-8+1740

         .         .         .         .         .         .  g.8137
tgctcagagagttgctttaattttggttttgcaacttgagtattgtctggacacacccat  c.-8+1800

         .         .         .         .         .         .  g.8197
ttgtcattcactaatgattgcaagccgttacagtctgatgaaactaacaaaatagacctc  c.-8+1860

         .         .         .         .         .         .  g.8257
aagaagaactgagttgtataaaagcttaagaggattcacagtagtttagaagcaataatt  c.-8+1920

         .         .         .         .         .         .  g.8317
ttctccttaaagacaaaatatgccctattgaggtttcctgggcttagccattaggccagt  c.-8+1980

         .         .         .         .         .         .  g.8377
gatgattttaaatttgaagacaaaaccacacacacagccttttgaagaagaaccatggaa  c.-8+2040

         .         .         .         .         .         .  g.8437
gcacatgttctcttgttggtgtgctctgcagcagtattctccgttatcttctagcggcca  c.-8+2100

         g.8444
tgacact  c.-8+2107

--------------------- middle of intron ---------------------
                                           g.8445             g.8450
                                           c.-7-2106  caccta  c.-7-2101

.         .         .         .         .         .           g.8510
ttttggtagtaactcctatatattttgagaaaatttagtcttgcttttttggttgtggaa  c.-7-2041

.         .         .         .         .         .           g.8570
ataggctagttttctaagtgaaataaaaagcaaattctgtaattttcttaatagaaggtt  c.-7-1981

.         .         .         .         .         .           g.8630
tcttttgttgtctcctttgttagtacttattttaaagtacacaacatttggagcttcaag  c.-7-1921

.         .         .         .         .         .           g.8690
taaggtaagtgggaaaagaagtatgcaacattttatttgcatggtagtctcacttaagtt  c.-7-1861

.         .         .         .         .         .           g.8750
ttttaaagcttaaattggctgcagtctgttagctgctgaaatcatgcttcaaatgtttga  c.-7-1801

.         .         .         .         .         .           g.8810
gaaacctccatgaagtttcactttctgttcttacgtcttctaagttcactttccatatta  c.-7-1741

.         .         .         .         .         .           g.8870
aactaggttaccggaaaaaaaaacagcttctgcaagctgttaacttactagtagtgtgat  c.-7-1681

.         .         .         .         .         .           g.8930
gttggcctcttaggtataagtaattcttcttttgaataaaataattttaaattctgcaga  c.-7-1621

.         .         .         .         .         .           g.8990
aatacattgaagaccttatcccatgttacttggcatttcctagtctgcagtgcccttgta  c.-7-1561

.         .         .         .         .         .           g.9050
ctagaaggcattaataaaatgtaattgagttagagtttgtgtcaggaaagggcggtactc  c.-7-1501

.         .         .         .         .         .           g.9110
tgcggctatcactgcatactctttttcccccccacgtcgatgagaactgtgtaactcatg  c.-7-1441

.         .         .         .         .         .           g.9170
ttatcctttttctctgctttcaggaagctcctcatgtagaacttagtgaaattaaatttc  c.-7-1381

.         .         .         .         .         .           g.9230
ttctaaagaagttttgattttgttttttgaaatctcatttttaaatgtccttttgtgtgt  c.-7-1321

.         .         .         .         .         .           g.9290
atgtactttaatgttgaaagctaccctaaattctttttagaaccatgaagaaagtatacc  c.-7-1261

.         .         .         .         .         .           g.9350
tcttcaaaagcataagtaaaagtaatatttaataaattttaaaaaatcaattcatatgac  c.-7-1201

.         .         .         .         .         .           g.9410
aatgtatttgattatgcttatgcatttctaaataattatttaattgtgggtataagaaga  c.-7-1141

.         .         .         .         .         .           g.9470
aattaaagaattttaaaaaatcactttattttaggaactagctttatgccacagaagcct  c.-7-1081

.         .         .         .         .         .           g.9530
cagcagccaagcctagtttctgttgagatgttttatatttcctgttggtaaagattatgt  c.-7-1021

.         .         .         .         .         .           g.9590
attctgaattttagggtgacggtgatactcaaaaatctcacactgccatgtttccattcc  c.-7-961

.         .         .         .         .         .           g.9650
cacatactcagtgtcttcacttaggtttcttttgtttgtttgttttgagacagagtttca  c.-7-901

.         .         .         .         .         .           g.9710
ctctgtcacccaggctggagtgcagtggcgcaatcttggctcactgcaacctctgcctcc  c.-7-841

.         .         .         .         .         .           g.9770
cacgttcaggcagtactcctgcctcagcctcccaagcagctaggattgcagatgcgcacc  c.-7-781

.         .         .         .         .         .           g.9830
accagctaatttttgtattctttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggctg  c.-7-721

.         .         .         .         .         .           g.9890
gtctcgaactgcggacctcaagcagtctgcccacgtcggcctcccaaagtgctgggctta  c.-7-661

.         .         .         .         .         .           g.9950
caggcatgagccaccgttcccagcttacttaggttttttaacctccttctaacctttctc  c.-7-601

.         .         .         .         .         .           g.10010
cctgagtggagagtttttaaacatttttaaaaactgcctctcctgtgaattttattacca  c.-7-541

.         .         .         .         .         .           g.10070
ccaatatattgtgtctctctttatgtactgtatgtttatctgagctttatatctaaaaag  c.-7-481

.         .         .         .         .         .           g.10130
aggagggctttttcacgtcccactaactagttttagatctctttgagggtgacatcactc  c.-7-421

.         .         .         .         .         .           g.10190
ctgatgagaatgctgagctaggtccattcagtttatgaaatgaacttaagtttgtagttg  c.-7-361

.         .         .         .         .         .           g.10250
gtaacttttttccccattccaaaatctgtactttgaaaatattggtaagtctgggtctct  c.-7-301

.         .         .         .         .         .           g.10310
atatattttctatcggtactgtgttgttttgagccttctctgtagcacaactttatgttg  c.-7-241

.         .         .         .         .         .           g.10370
ccttatgatacttattccttatacaatgcttttatttttctgtatttttcgtatgtcaaa  c.-7-181

.         .         .         .         .         .           g.10430
aatagaaggatttttttagtttagtgaatcagtgattgataagccagccagcagaagatt  c.-7-121

.         .         .         .         .         .           g.10490
tgggttttagtgacacattttaaattgaaaccagggtcacaagttgaaagtgtacctatt  c.-7-61

.         .         .         .         .         .           g.10550
cttgacacacagtaggtctgaagttggttttcttcttgatgtcatcttttctggctgtag  c.-7-1


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