spastic paraplegia 11 (autosomal recessive) (SPG11) - 4828 nt intron 04 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.11644
gtatgtagatgactgcagtttctaatttgaggtaaatagttagactgataagaggttaaa  c.869+60

         .         .         .         .         .         .  g.11704
aatatcctcgttagttttttttttttaactagtgtttctttttctattcagttagatcat  c.869+120

         .         .         .         .         .         .  g.11764
gttctagctaatacattgtaaagtagttactgaataatatgtataactgaccactggcta  c.869+180

         .         .         .         .         .         .  g.11824
ccttttatatttttacatgttcatcaaagttttgattttgatttgatttatatatggttt  c.869+240

         .         .         .         .         .         .  g.11884
atgtcatgtaaatcaaaattacacaattttaaaccacagtttagcacttaattgtataga  c.869+300

         .         .         .         .         .         .  g.11944
catgttatttccctaattttctcatgtttcccatagagtttataagctccttgagaaccc  c.869+360

         .         .         .         .         .         .  g.12004
aagttcatgatttgttctttaaattcattgtcaatgactttttcttccagtttaccttag  c.869+420

         .         .         .         .         .         .  g.12064
ctttccacctccacagccataccctaggcattatcaatatttgaagtcgtccctccccca  c.869+480

         .         .         .         .         .         .  g.12124
agtcactactttttacatctcagtctctgaccacaacttcccaaactttccagcttgctt  c.869+540

         .         .         .         .         .         .  g.12184
actcaagtactcccacttcacctgtcctctgacctaactggaatttccaattcattgacc  c.869+600

         .         .         .         .         .         .  g.12244
ttccactctttaccccatcctgtcttcacttccctctctttccagcatagattctgtgat  c.869+660

         .         .         .         .         .         .  g.12304
ccatcatacagttactttcttgcatgtactctaaactcttgctcctgccctgtgatagca  c.869+720

         .         .         .         .         .         .  g.12364
cttggtctggcaaaatttcaaccctgattgaaatctttttttctgccttcacagtgtctg  c.869+780

         .         .         .         .         .         .  g.12424
cagtcagacagctgagtacttgtagaaaacaacaaaagaaaattgataccactctaggtt  c.869+840

         .         .         .         .         .         .  g.12484
cacacttagtacctttaattggtcttaatgttgcctggaaattttacagtgatttttcat  c.869+900

         .         .         .         .         .         .  g.12544
gagcccattctttacaactgtatttttaaaccttctctgttttcctcaaacctccattaa  c.869+960

         .         .         .         .         .         .  g.12604
tctctttattcccaacttttcttggatgaccttgcctcctatgaaggcccatccctctgt  c.869+1020

         .         .         .         .         .         .  g.12664
gtgtgctttagatcccattccttccatccttcttaggggcctttctccatttcctctctt  c.869+1080

         .         .         .         .         .         .  g.12724
ttttatatagttgtcgcctttatccacagttacagtttctcccagtcagttgtgttccgg  c.869+1140

         .         .         .         .         .         .  g.12784
aaatattacatacagtaagatattttaagaaagactacattcacataacttttattacag  c.869+1200

         .         .         .         .         .         .  g.12844
tatattgttgtaattgtcctattattagttattactccctcactgggcctaatttataaa  c.869+1260

         .         .         .         .         .         .  g.12904
ttaaactttattataggtatgtatgcataggaaaaaacagtacagttgacccttcaacaa  c.869+1320

         .         .         .         .         .         .  g.12964
ctcagggatgccaaccccctgcacgatcaaaatgccacatgtaacttttgactcccccaa  c.869+1380

         .         .         .         .         .         .  g.13024
aacttaactactaatagcctacagttgaccagaaaccttactgataacataaacagttgg  c.869+1440

         .         .         .         .         .         .  g.13084
ttaacacatattttctatgttatatgtattacactatattcttacaataaagtaagctac  c.869+1500

         .         .         .         .         .         .  g.13144
agaaaagaaaatgttaagaaaattttaaggaagcgaaaatacatttacagtactgtactg  c.869+1560

         .         .         .         .         .         .  g.13204
tattgatactctacataatctgtttacaagatgagtagtctgtctgaaaaggcaagcaac  c.869+1620

         .         .         .         .         .         .  g.13264
cgcagcagcatacctcaacccatggtacatgtcaggcaattcatgtttttcttacaatgt  c.869+1680

         .         .         .         .         .         .  g.13324
catgacttttctctacttgggagcacttccagcattacatttcatatgggtcccatggtg  c.869+1740

         .         .         .         .         .         .  g.13384
ttatacaaggttatggtatggcacgaaacatgatgaaaaatacatgagaaccacaagaaa  c.869+1800

         .         .         .         .         .         .  g.13444
tcacttttaaaaaattatgttgttattattttagagacaggatcttgctatgttgtccag  c.869+1860

         .         .         .         .         .         .  g.13504
gctggactcaaactcctgggcccaagcagtcctccaactcagcctcccgagtagctggga  c.869+1920

         .         .         .         .         .         .  g.13564
ctatacgttcacgtcactgtgccagctaaagagatcactttttactgtgttacacaattt  c.869+1980

         .         .         .         .         .         .  g.13624
actggagagaagaactgctcacacagagattattagtaccacatggcattttaagcagat  c.869+2040

         .         .         .         .         .         .  g.13684
gcttacaacactagggctcactgcaatggcaacaggaagtggccatgatattattacagc  c.869+2100

         .         .         .         .         .         .  g.13744
agtacagtatatactacagctaattatatgcagttatttaatactgcatcttgacattcg  c.869+2160

         .         .         .         .         .         .  g.13804
tttacattttctttggcttcgaatggtatcatgtacagtccgtaagtgtgtacattacat  c.869+2220

         .         .         .         .         .         .  g.13864
aggttctgataaatgttaactttttttttttcttttttgagatggagtttcgctcttgtt  c.869+2280

         .         .         .         .         .         .  g.13924
gtccgggatggagcgcaatggtgcaatctcagctcactgcaccctccgcctcctgggttc  c.869+2340

         .         .         .         .         .         .  g.13984
aagcgattctcctgtctcagcatcctgagtagctgggattacccaccacccacgcctggc  c.869+2400

         .      g.13998
taattttttgtatt  c.869+2414

--------------------- middle of intron ---------------------
                                  g.13999         .           g.14012
                                  c.870-2414  tttagtagaaatgg  c.870-2401

.         .         .         .         .         .           g.14072
ggtttcaccgtgttggccaggctggttttgaacttatgacctcagatgatccgcccacct  c.870-2341

.         .         .         .         .         .           g.14132
tggcctcccaaaaatgctgggattacaggcgtgagccaccgcgcccagccaatcttaact  c.870-2281

.         .         .         .         .         .           g.14192
ttttataataagtttgtgggtttctttttttttaattttgagatggagtcttgctctatt  c.870-2221

.         .         .         .         .         .           g.14252
gccaaggttggagtgcagtggtgcagtctcggcccactgcaaggtccgcctcctgggatc  c.870-2161

.         .         .         .         .         .           g.14312
aagtgattctcgtgtctcagcctcccaagtagctgggattataggcatgtgccaccacgc  c.870-2101

.         .         .         .         .         .           g.14372
ccagctaatttttgtattttcagtagaaacggtttcgccatgttggccgggctggtcttg  c.870-2041

.         .         .         .         .         .           g.14432
aacgcctgacctcaagtgatccacctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacagaca  c.870-1981

.         .         .         .         .         .           g.14492
tgagccactgtgcccagccaatttgtgcataatttatggtagaaaatgatagagtagtaa  c.870-1921

.         .         .         .         .         .           g.14552
ctatgtaacttttatgcattcatgacatacctgacttaatctttattttaaaaaatattt  c.870-1861

.         .         .         .         .         .           g.14612
ctaggctaaactgggcatggtagtacatgcctgtggtctcagctactccggaggctgagg  c.870-1801

.         .         .         .         .         .           g.14672
caggaggattgcttgagtccaggagatcaaggctacagtgagctgtcattgcaccactgc  c.870-1741

.         .         .         .         .         .           g.14732
actccagcctgggcaacagagcaagaccctgtctgaaaaaaatatatttctaggctacat  c.870-1681

.         .         .         .         .         .           g.14792
ggttcatttgtgagtttaaacaaattgttgcaaatctttacaaatttttccaatgtattt  c.870-1621

.         .         .         .         .         .           g.14852
ttggaaaaaaaaaatcatataagtggacccatggagttcaaacctgtgatattcaagggt  c.870-1561

.         .         .         .         .         .           g.14912
caactgtatgtatagggtttggtactatctgcagtttcaggtacctactgtgtgtcttga  c.870-1501

.         .         .         .         .         .           g.14972
atgtatccactgtggataagagggaactactgtatctccaacttctttttggtattagat  c.870-1441

.         .         .         .         .         .           g.15032
ccacatccagttaatcatcaggtcctaccctttctgtctcctaaatgtttctttgtccac  c.870-1381

.         .         .         .         .         .           g.15092
ttttctcaactcttctgtcgtcactctatgccaccattatctcttaactgaactatttta  c.870-1321

.         .         .         .         .         .           g.15152
atagtctcctacttgatctcctcatgcctattaccccctcaaatccatccacaatagagt  c.870-1261

.         .         .         .         .         .           g.15212
agctaagagtgatgttgttaaaatgcatattttatcagaggtgtagccagtcattaacat  c.870-1201

.         .         .         .         .         .           g.15272
ctggggcaggggtatctaccttttattttgttgatgggggaactattttctcatgcatct  c.870-1141

.         .         .         .         .         .           g.15332
tctcattttcgccctaccttctctaacttcttttcatcatcatcctgggacagtgtcata  c.870-1081

.         .         .         .         .         .           g.15392
tggttgtgtcaacaaattaccttcaagttgtttaaaggattaatatttaataatgtaagt  c.870-1021

.         .         .         .         .         .           g.15452
gttcaaagagataaaatccttccccttcttcccctagctactctgctgcatctgttcata  c.870-961

.         .         .         .         .         .           g.15512
ttgcttttctgcttaaaagccttcttcaggttccttttccccctcagataaaagtttaaa  c.870-901

.         .         .         .         .         .           g.15572
attcttaatagcctatggggccctgaaccatctttctagcctcatcccattccatcttac  c.870-841

.         .         .         .         .         .           g.15632
ttctcattttctgtacattagccaccctagccttctttgtttctcaaatgtaacagcccc  c.870-781

.         .         .         .         .         .           g.15692
cttttccacatatactctcccacctatacccacatacatactttaccttctagttcttat  c.870-721

.         .         .         .         .         .           g.15752
gcattcctctggtcgcagcctaaatcttactttgtggtggcagtataatgagtgatttta  c.870-661

.         .         .         .         .         .           g.15812
aaatctggactggaggccgaggcaggcacatcactggaagtcaggagtttgagaccagct  c.870-601

.         .         .         .         .         .           g.15872
tggccaatatatagtaaaaccctgtctctactaaaaatacagaaattagccaggcatggt  c.870-541

.         .         .         .         .         .           g.15932
ggcatgcacctgcagtcccagctactcgggaggctaagacaggagaatcgcttgaaccca  c.870-481

.         .         .         .         .         .           g.15992
ggaggcagaggttgcagtgagctgagattgcgccactgcactccagcctgggtgacagag  c.870-421

.         .         .         .         .         .           g.16052
tgagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaagaaaaaaagctagacttgatagtcacattagt  c.870-361

.         .         .         .         .         .           g.16112
ctgtttcaaagtgtttctgaaccttagtttccatttctataagatggggttatatttacc  c.870-301

.         .         .         .         .         .           g.16172
tcacagggttgttagaggcttaaataagagtttgtgtgaagtgtttagcataacatctga  c.870-241

.         .         .         .         .         .           g.16232
aatatagtagacagtaagtgttcttactgctttatcaagctaactgcccttaatagagta  c.870-181

.         .         .         .         .         .           g.16292
aaattcttagagttcactctattactgtgacataagcaagggagataaggagttcctttc  c.870-121

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