stromal antigen 1 (STAG1) - 8356 nt intron 28 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.399744
gtaagttgcacattacaagagaagtggtttttataataatactgttgtaaatgtttattt  c.3065+60

         .         .         .         .         .         .  g.399804
tttgaaaaatttttaatcatttggatatctttactcttgataatttaggctctgatagtt  c.3065+120

         .         .         .         .         .         .  g.399864
tgttttaaggaattatagttttccttcaagcatttatgtagtagttatttcactgcttat  c.3065+180

         .         .         .         .         .         .  g.399924
cttttagtaccctagaatctgcaacatgaaattaagcaggtggaaatgatttcttattat  c.3065+240

         .         .         .         .         .         .  g.399984
gcagttcaaagatgtataaacactggtttagccattgtgtaactcttccttctttccttt  c.3065+300

         .         .         .         .         .         .  g.400044
tatattaatttcattttagttttatattctatttgacttgtttcaaaagattgatttttt  c.3065+360

         .         .         .         .         .         .  g.400104
tcatatttgctttttttgattattgataacagtttaaagaaatatatatgtaatttcaaa  c.3065+420

         .         .         .         .         .         .  g.400164
agaaaatcttgattgggtaagttttatttaaaaccaaaccagaaaacttctaggctgggc  c.3065+480

         .         .         .         .         .         .  g.400224
atggtggctcacacctgtaatctcagcactttgggaggccgagacgggcggatcacaagg  c.3065+540

         .         .         .         .         .         .  g.400284
tcagaagatcaagaccatcctggctaacacggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaa  c.3065+600

         .         .         .         .         .         .  g.400344
aaaaattagccgggcgtggtggcgggtgcctgtagtcccagctactcaggagggtgaggc  c.3065+660

         .         .         .         .         .         .  g.400404
aggaggatggcgtgaacctgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcgcaccactgca  c.3065+720

         .         .         .         .         .         .  g.400464
ctccagcctgggtgacagagcgagactctgtctcaaaaaaaataaaataaaataaaaaat  c.3065+780

         .         .         .         .         .         .  g.400524
ttaaaaaaaataaaaaaaaattagctaggcatggtggtgcatgcctgtagtcccagctgc  c.3065+840

         .         .         .         .         .         .  g.400584
tcaggaggctgatgcacaagaatcgcttgaacccaagtggcagaggttgcagtaagctgc  c.3065+900

         .         .         .         .         .         .  g.400644
gatcatgccactccactccagcctgggtgacagagcgagactccgtctcaataaaaaaat  c.3065+960

         .         .         .         .         .         .  g.400704
aaaataaaataaaaacttttttagaggataatactataatgaatcctaaattttataaac  c.3065+1020

         .         .         .         .         .         .  g.400764
tgttaagacagagagtcctttataatattctagctgggtgcagtgattcacgcctgtaag  c.3065+1080

         .         .         .         .         .         .  g.400824
gaggctgaagcaggaggattgcttgagtccaggagttcaagaccagtcctggcaacgtag  c.3065+1140

         .         .         .         .         .         .  g.400884
caagaccccatctctataaaaaaattttaaaattagccaggtgtggtggtgtgtacctgt  c.3065+1200

         .         .         .         .         .         .  g.400944
agtcccagctacttgggaggctgaggtcggagaatcacttgagcccaggagtttgaggct  c.3065+1260

         .         .         .         .         .         .  g.401004
gcacttagctatgattatgccactgcattccagcctgggtgacagcctggggagcctgtg  c.3065+1320

         .         .         .         .         .         .  g.401064
tcaatcagtcgattttttaaatataacaggattctaaataaatagaattttggagagaca  c.3065+1380

         .         .         .         .         .         .  g.401124
gttaatacttatatgactataagtgatagttctaagtaaagatgttgatgtcatgttgat  c.3065+1440

         .         .         .         .         .         .  g.401184
cagaaaatattcattaagcccctagtatggtcagctactgttgtaaagcttatgctctaa  c.3065+1500

         .         .         .         .         .         .  g.401244
tgccagggggcacagcataaacaggcagatggccaggctcagtggttccgacctggaatc  c.3065+1560

         .         .         .         .         .         .  g.401304
ccagctattccggaggctgaggtgggaggattgtttgagggcaagagtctgagagcagcc  c.3065+1620

         .         .         .         .         .         .  g.401364
tgggcaagacagtgagactgtctctaaaaaaaaaaaaaaaaacaggcagacaaacgagag  c.3065+1680

         .         .         .         .         .         .  g.401424
tttcaggcactgaaatggggtaatatgatagagacaggtgttgaatattagtgggagtgg  c.3065+1740

         .         .         .         .         .         .  g.401484
tttgaaaactttttcaatacaggcatttacagctatacattttcctctaaacattacctt  c.3065+1800

         .         .         .         .         .         .  g.401544
agctgcatcttgtaagttttggtatgttgcatttctgtttttattcatctcaaagtattt  c.3065+1860

         .         .         .         .         .         .  g.401604
tctcatttcacttatttcttctttaacctattggttattcaggagtattttgtttaattt  c.3065+1920

         .         .         .         .         .         .  g.401664
ttatgtatttctgaatttccagattttccttctcttactgatttcttcatttcattgtgg  c.3065+1980

         .         .         .         .         .         .  g.401724
tcagagatcatgcattgtattattttaatccttttaaatttattgaggcttgttttatgg  c.3065+2040

         .         .         .         .         .         .  g.401784
accaacatacggtcttagagactgttccatgtatcagttgacaaaatgtgttaccattct  c.3065+2100

         .         .         .         .         .         .  g.401844
ggttttggttggagtttttgttctgtagatgtgtgttctgtctagttagcttatagtttt  c.3065+2160

         .         .         .         .         .         .  g.401904
gtttatagtgcttttcaggtcttcagtgttcttgttaatcttttgcttagttgtcctatt  c.3065+2220

         .         .         .         .         .         .  g.401964
cattattgaaagtgggatattgaagtctccaaatattactattgaattgtctatttgtcc  c.3065+2280

         .         .         .         .         .         .  g.402024
cttcagttctgtcagtttttgcttcatacattttggggctctcttgttaggtgtatatac  c.3065+2340

         .         .         .         .         .         .  g.402084
ttttttttttttttttttttttttttttaagatggagtctcactctgatacccaggctgg  c.3065+2400

         .         .         .         .         .         .  g.402144
agtgcagtgacacaatcttggctcactgcaatctctgcttcccgggttccagcgattctc  c.3065+2460

         .         .         .         .         .         .  g.402204
ctgcctcagccttctgggtagctgggactataggcgcgtgccaccacacctggctaattt  c.3065+2520

         .         .         .         .         .         .  g.402264
tgtatttttattagagatggggtttcaccatgttggccaggctggtcttgaactcttgat  c.3065+2580

         .         .         .         .         .         .  g.402324
ctcaagtaatctgcccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccacca  c.3065+2640

         .         .         .         .         .         .  g.402384
cgcctggcctgtacatacatttttaattgttacatcttcctgaccagttgagtcttattc  c.3065+2700

         .         .         .         .         .         .  g.402444
taaagtgtcattctctaagacatttttgtgtcatactactataatcactccagctttatt  c.3065+2760

         .         .         .         .         .         .  g.402504
ttgactactgttttgcatggtacacctttttttccatcctttcactttctgcctttgtat  c.3065+2820

         .         .         .         .         .         .  g.402564
ctttgaatctaaagtgtgtttcatgtagacagcaaattggatcatgtgtttttaaattca  c.3065+2880

         .         .         .         .         .         .  g.402624
acctgacattctctattattatactttttgttttttatatgtctcctggagattttgttt  c.3065+2940

         .         .         .         .         .         .  g.402684
ttgttttttggttttttttttttttggttctttctcctttactgccttcttttatattaa  c.3065+3000

         .         .         .         .         .         .  g.402744
atgtatgttttctagtgtagcatactaattcctttaattaatctttaattgtattttttt  c.3065+3060

         .         .         .         .         .         .  g.402804
agttattttcctagtggccttaccaggccttacagtatacatcttatcaaaatttactgg  c.3065+3120

         .         .         .         .         .         .  g.402864
ccgagtgcagtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggctgaggtgggcagatc  c.3065+3180

         .         .         .         .         .         .  g.402924
acttgaggtcaagagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccatctctaataa  c.3065+3240

         .         .         .         .         .         .  g.402984
caatacaaaaattagccgggcatggtggcacatgcctgtaatccaagctacttggaaggc  c.3065+3300

         .         .         .         .         .         .  g.403044
gaaggtgggagaattgcttgaaccccaggggccccaggggcagaggtcgcagtaagccaa  c.3065+3360

         .         .         .         .         .         .  g.403104
tatcgtgccactgcactccaccctggacgatagagtgcgattccgcctcaacaaaacaaa  c.3065+3420

         .         .         .         .         .         .  g.403164
atttacctaaggtctatcctgatttattctaaggaaatacagaaactttaattctatata  c.3065+3480

         .         .         .         .         .         .  g.403224
aatccatttccttcctccttttttggctattcttgttatacctagtccatctatatatat  c.3065+3540

         .         .         .         .         .         .  g.403284
tagaaacccaataataaattgttataattatacttgagataatcttttatagaaactgag  c.3065+3600

         .         .         .         .         .         .  g.403344
aaaagaaaggaaagccagtatgtatttatagagtttgttatattaatcttcctatttacc  c.3065+3660

         .         .         .         .         .         .  g.403404
atttttctggttctcttcatttcttcctgtggattcgaattgccatctggtatcattcct  c.3065+3720

         .         .         .         .         .         .  g.403464
atattcaaatacagcttctctttcactcacttttttgtgtttattgtcaaatatattaca  c.3065+3780

         .         .         .         .         .         .  g.403524
tttctatgttattgacccaacaatacagtaacatacatattgttttatatatttgctttt  c.3065+3840

         .         .         .         .         .         .  g.403584
taaatcagttaagagagaagggataagtaaatatgtaattatacttttgtaactacctac  c.3065+3900

         .         .         .         .         .         .  g.403644
aaattacctttactggcactctttgttttttcatgtaaattcaaattaccctgtggtgac  c.3065+3960

         .         .         .         .         .         .  g.403704
atttgctttcaacttgactaacttcctttagtaggcaggtctgatagcaacagattctct  c.3065+4020

         .         .         .         .         .         .  g.403764
caggggtggcttatgcctgtaaacccagcattttgggaggctgaagcaggaagattgctt  c.3065+4080

         .         .         .         .         .         .  g.403824
gagcccagcagtttgaggttacagtgagcgatgtaagattctcgtttgatagttttttac  c.3065+4140

         .         .         .          g.403862
tttcaacactttgaccatgtgatcccactaccttctgg  c.3065+4178

--------------------- middle of intron ---------------------
         g.403863             .         .         .           g.403900
         c.3066-4178  cctccattgtgagccaggtgataagaattaatcattaa  c.3066-4141

.         .         .         .         .         .           g.403960
ttttattggattttctttgtatgtagtgaattacttttctcttactactttcatgatttt  c.3066-4081

.         .         .         .         .         .           g.404020
gtttttatccttggctttcagcatttttcctatgatgaatccatgtgtgcatctctttgc  c.3066-4021

.         .         .         .         .         .           g.404080
atttatcctgtttgaagttcattgaactttgtggatgtgtaaattatgtttttcatcaaa  c.3066-3961

.         .         .         .         .         .           g.404140
ttgggcaagtttttagccattatttctcctaaatttttctgctttttcgtctgctacctt  c.3066-3901

.         .         .         .         .         .           g.404200
ggttactcccattacacatatgtcagtatatttaatggtatcccatacttctctcatgct  c.3066-3841

.         .         .         .         .         .           g.404260
ctgttcatttttctttattcttttttctctctcttcttcagatggcataacttcttgata  c.3066-3781

.         .         .         .         .         .           g.404320
tatcgtcaaatgtggtgtttcttgcttttgtcagctcaaatctactgtcaagccactata  c.3066-3721

.         .         .         .         .         .           g.404380
gtaaatttttaattttgattatactttcaactgcagaatttccacttggttctgttttaa  c.3066-3661

.         .         .         .         .         .           g.404440
aattgatactctttatttcatgagagatattgtcatcatacccacttttaattagatatg  c.3066-3601

.         .         .         .         .         .           g.404500
attttctttagttctttgaacatacaggtgctcctggatttaagatggggttacatctaa  c.3066-3541

.         .         .         .         .         .           g.404560
taaacccatcataagtttaaaatattgtaagtcaaaaatgcatttaatacacctaatcta  c.3066-3481

.         .         .         .         .         .           g.404620
ccaaacatcacagaataatatagcctacctttaacacgcagaatacttacattagcctat  c.3066-3421

.         .         .         .         .         .           g.404680
agtttgataatatcatgtaacacaaagcctattttataatgaaatgtcaaatatactatg  c.3066-3361

.         .         .         .         .         .           g.404740
aaatttgtttaatactatactgaaagtacaaaacagaatgattgtataggtactcaccat  c.3066-3301

.         .         .         .         .         .           g.404800
taaagtacacagctaaaagcactatcataaagtaaaaaaaaatcataagtcaaagcattg  c.3066-3241

.         .         .         .         .         .           g.404860
taagttggggactttgtatttataatcattgctttgaaatctttgtgggccaaggtgctg  c.3066-3181

.         .         .         .         .         .           g.404920
ttgcttgctcttttatcaatgtatccatcacattttcctgtttctttgtacgtctcataa  c.3066-3121

.         .         .         .         .         .           g.404980
ttttttcttaaaaactggacatttggccaggcgctgtggctcacacctataatcccagca  c.3066-3061

.         .         .         .         .         .           g.405040
ctttgggaggccaaggcggaccgatcacttgagctcacgagttcaagaccagcctgggca  c.3066-3001

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.         .         .         .         .         .           g.405160
tgtagtcccagctactcgggaggctgaggtgggaagatggcttgagcctgagaggcagag  c.3066-2881

.         .         .         .         .         .           g.405220
gttgcagtgagccaagattgtgccactgcactccaacctcggtgacagagtgagacctta  c.3066-2821

.         .         .         .         .         .           g.405280
tctcaaaaaaataaataaataaaaagaacaaatattgcaaaaatgatatcttttgaaata  c.3066-2761

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ataatatagctactctttactaattatctgccccctagaggttgatattattttctcgtt  c.3066-2701

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.         .         .         .         .         .           g.405460
gtgcagcctctgatgtctttgctcagatcttttttcctttgtttttatcatttgtcttgg  c.3066-2581

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ctgctgaggaggtcacccctgggttagcataagccacttactgatcaaaggttgcgctta  c.3066-2521

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aaccccttagccagttaggtttaccctttactgttggatatgtgtatggcttgcaggctg  c.3066-2461

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ctttcataattcagggtatttacttttttgacccacattttaggccagggactagcagct  c.3066-2401

.         .         .         .         .         .           g.405700
tggaagatacctctctgattattcctgagaaaggcagccttgggtgtgcagtcttcagac  c.3066-2341

.         .         .         .         .         .           g.405760
aaccagggaagcattactattttatttttaagcctggcttcctaggagttgctcctaggt  c.3066-2281

.         .         .         .         .         .           g.405820
gtaagaatagctgttagttcagccagtgtttggtgagaggttgtatttaaaccacttttg  c.3066-2221

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ccagtgaagcttcctccctgtgttgatagatccgtatgtggcttggggaatgctttcaag  c.3066-2161

.         .         .         .         .         .           g.405940
tctgcctcattcccttccctttttttgcccatgagtgaatgcagcttaggatatgtgcat  c.3066-2101

.         .         .         .         .         .           g.406000
agctttcccaactcccagcacttttattttttattttattttttaaacctgttccaaata  c.3066-2041

.         .         .         .         .         .           g.406060
tgcttaatggataaacagataaactcacaaaatttgaaacctataaacaaaagaaacttt  c.3066-1981

.         .         .         .         .         .           g.406120
taagcatagcaattacttaagcagatcagtaactataaaatgttatccttctttcatata  c.3066-1921

.         .         .         .         .         .           g.406180
agaagaaatatgtgaaatgccaagttagctcagcaacctattaataaccaccaaagattg  c.3066-1861

.         .         .         .         .         .           g.406240
gtgataaagcattcttccaatgctgtgatgaaaaaaaaaaaataagcacagtggaggatt  c.3066-1801

.         .         .         .         .         .           g.406300
tggtaggctacgttcaaatgaatcaaagggagctagtgaaatgaagaatcacttgttttt  c.3066-1741

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tagttaaaaacaaagggaaacaaatccttccttttaaaaaataatatatatttaaggtgt  c.3066-1681

.         .         .         .         .         .           g.406420
atatatatgatgtcttgatatacatatatgttgtaagatgatgacaacagtcagttaaca  c.3066-1621

.         .         .         .         .         .           g.406480
aatccaactcccaggattgactatgactccaggaaggttcttcttggctgtctctttctc  c.3066-1561

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agaactaccagcaccctctcattttcactccatcaggatctctgttgtcaacacccttag  c.3066-1441

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cactcctctctccagctgcagtttcttcttcatagtcagcctcagccaccagggagaact  c.3066-1321

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ttaacttttatgccactgaaatggggaggagggcagaatttggatggcatggaccagcat  c.3066-1261

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ccctcttctcccagaataacacctctggctctttgagcaggggagagagtaggtaacccc  c.3066-1201

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cttggtgggataaaaggagcttcatttttcctggttgctgttcagaatagaacttacaca  c.3066-1021

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acacagggctgggaggtgatgagaaatgcaaatggtatgcttctttctttcagggtagcc  c.3066-961

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tgggaactagagagagagggaacccccatcttcttggccacctgcctggactagatagag  c.3066-901

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tttctaaaatatagagctgtagtggcagggagaaggaaacaagggaagggaacaggttgt  c.3066-841

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ggatcaaatgctacaaaacttttgctgttcttgctaaaatgtattagattttcttttttt  c.3066-781

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ttttgaatggagtctccagactgtcacccaggctggagtgcagtggcacggtcttggctt  c.3066-721

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ggattacaggtgcatgccaccacgcctggctaattttttttgtagggatagggttgtgcc  c.3066-601

.         .         .         .         .         .           g.407500
aggttgatctcaaactgctgtcctcaagtgatctgcccacctcggcctcccaaagtgctg  c.3066-541

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ggatttacaggcgtgagccacggtgcctggccagattttcttgaataaatttttctccat  c.3066-481

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tagaaatcctgctttggcttgaacactttataagaaaactcaataatctttttgagctaa  c.3066-301

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acttctgatttttttttaacattggtgtttaaaagcaaaggaagaaatataggaaagacc  c.3066-241

.         .         .         .         .         .           g.407860
gtacatacatacacacccttaggtaatacactcacttgctttaaagtatcccaagaataa  c.3066-181

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gtgaaacaaaaccttaactcctcagtccctctctttccaaaggtgaccactgttaatagt  c.3066-121

.         .         .         .         .         .           g.407980
ttaatgtgtgtccttaggtattcttcagaacctgcagaaagagagcctcagattaagaaa  c.3066-61

.         .         .         .         .         .           g.408040
aagtaagtgatgtatgaactgcttctctgaaaatcactgctgtttctattgtgtttctag  c.3066-1


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