synaptojanin 1 (SYNJ1) - 4555 nt intron 04 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.33264
gtgagttcattttttcccttttggtgatttgggacataatatgttcagcagttgttcagt  c.479+60

         .         .         .         .         .         .  g.33324
catcaaaaacctcctcaccgtgacagcaagaaaggaggaagaaccctgaagaccctcgat  c.479+120

         .         .         .         .         .         .  g.33384
gccccttttcagcagcaagtagctacagagaatgacctctacctcatctcccaaaagatt  c.479+180

         .         .         .         .         .         .  g.33444
tctgggtcccaacgccttgagggagcaatgtaagagtagacagtcagatatgagcaggca  c.479+240

         .         .         .         .         .         .  g.33504
cgagggggtggtatacgtgttggaaagaatgccccggaactcctcttaggatgctcagta  c.479+300

         .         .         .         .         .         .  g.33564
ctcactccgtggtcgaactgtcagaatgttgttaagtagatcctgataaggaaggaaaaa  c.479+360

         .         .         .         .         .         .  g.33624
ggcaaaggggaattcctgagagctgagcaggcataatgagtacaaaattgatggctatac  c.479+420

         .         .         .         .         .         .  g.33684
cttcctggggtggtggtaataagcagtgccaccattagataggattcatattgatcactg  c.479+480

         .         .         .         .         .         .  g.33744
gttcccgtgcatgtgcattaagcacagtaagggaggatcccccaaaccttggtgagaact  c.479+540

         .         .         .         .         .         .  g.33804
gggtaaagaaagaactgagacaatagaagatcacaatgcagaatgtcttgggggtgtttc  c.479+600

         .         .         .         .         .         .  g.33864
cagcagggtcagcccactcctttcttggagtgtacttgtacttcctcaataaaacttttg  c.479+660

         .         .         .         .         .         .  g.33924
cttgctttacaaagaaaaaaagttcagcagttgttatgtctagagataacaagggataga  c.479+720

         .         .         .         .         .         .  g.33984
cattgctaattgagtgtatccatctttccttctctggagtcctcagcagagcatggcagg  c.479+780

         .         .         .         .         .         .  g.34044
cagccaatgtcggtttattgaagttggcatgtgacataaaacccctgtgctccccccagt  c.479+840

         .         .         .         .         .         .  g.34104
ctacactgaactttcatttccaaaatacatttaaaatagttgtgtatatttagaaatgaa  c.479+900

         .         .         .         .         .         .  g.34164
tttaattgtaacaaaactgtgttactcacgtttcctattcttggttttgagatcttgtct  c.479+960

         .         .         .         .         .         .  g.34224
ctggcggcattccctttctaagccaacattcccttattattctaaattttaaggttataa  c.479+1020

         .         .         .         .         .         .  g.34284
gtaggtggtcttgattcaagagcaacagattgtgaagaagtagtatactgggacaaaatc  c.479+1080

         .         .         .         .         .         .  g.34344
tagtactataataagttaggacttatgtaggtaagtgtgatgtatttcatgattatgcat  c.479+1140

         .         .         .         .         .         .  g.34404
aactgtgctgtattctaagtaggcacaaatggtgagcagaacacatgggactataattag  c.479+1200

         .         .         .         .         .         .  g.34464
cattgttctattgcagcagaccagatttctagtatagtggttctgttgtttacagccagc  c.479+1260

         .         .         .         .         .         .  g.34524
attgatgttgactttttctcttgatatcatgtgcaaattatgtattattatattgacata  c.479+1320

         .         .         .         .         .         .  g.34584
tgttataaggccaaagttcaggactctttgctcttggcctcccttaacagttcagattca  c.479+1380

         .         .         .         .         .         .  g.34644
agatggtttcctcttgtgtactttttctctctcacactttcactgtcacttatatagtcc  c.479+1440

         .         .         .         .         .         .  g.34704
ttgagtagcacattcgggtgtcacccatttgccctagctgtcagaagactcaaagtcaac  c.479+1500

         .         .         .         .         .         .  g.34764
aacaaacttaggataagaaacttaactttagagcaacagcttggtcacgttgtagctcac  c.479+1560

         .         .         .         .         .         .  g.34824
atggaagtgttttgacccagagtggtggcatcagggagaagagtggacagaataaaaaca  c.479+1620

         .         .         .         .         .         .  g.34884
gggtttatagcattatgtgttagagacttgggtttagcagaggaggagaccatgagggag  c.479+1680

         .         .         .         .         .         .  g.34944
aggaaaggagagaggggatgcagggactaacagggcagatgaatggacatgagttcctgc  c.479+1740

         .         .         .         .         .         .  g.35004
ctgcccaaagaagctagcagtgatgggatgtacttttgtgaagcattgagaaataggctt  c.479+1800

         .         .         .         .         .         .  g.35064
ccaagagttaaaaccatgccaacactacattttttctagtagaagatgttgaagtccctt  c.479+1860

         .         .         .         .         .         .  g.35124
gaaaaggtaaatgtgttgcagctgtccttacatttttttccctcctcatttttacccaaa  c.479+1920

         .         .         .         .         .         .  g.35184
gtttcttagattgagagataaaagctttcatacaacaattagaagtccaagcagatgcag  c.479+1980

         .         .         .         .         .         .  g.35244
atatattgcctaggtttaatcaataggcatgattaattggatggttggttgattgatttt  c.479+2040

         .         .         .         .         .         .  g.35304
tttgagtgtcactctgtcgcccaggctggagcgcagtggcgcgatcttggctcactgcaa  c.479+2100

         .         .         .         .         .         .  g.35364
ccttcacctcctgggttcaagcaattctcctgcctcagcctcctgggtagctgggaccac  c.479+2160

         .         .         .         .         .         .  g.35424
aggcgtgcgccaccacgcaggctaatatttttgtgtttttaataaggatggggtttcacc  c.479+2220

         .         .         .         .         .          g.35482
acgttggccaggctggtctccaactcctgacctcaagtgatcccccccaccttagcct  c.479+2278

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .           g.35539
   cccaaagtgctaggattataggcatgagccaccgtacttggcctccttttttttttt  c.480-2221

.         .         .         .         .         .           g.35599
ttttaattcacttaagagtagagatgggggcaaagtcagataaaagaaagcctgagattt  c.480-2161

.         .         .         .         .         .           g.35659
gtccagcaggagacaggttgaacaaagggacagctagagcaccaaaggtgaattttgctc  c.480-2101

.         .         .         .         .         .           g.35719
attttacaattttgctaaggattggcattcttgagcttcagtttatatagaaaaacggga  c.480-2041

.         .         .         .         .         .           g.35779
acttttggaattcattgtgcatacccttgcacttagtagcaatattttccaggatacaac  c.480-1981

.         .         .         .         .         .           g.35839
catgtaatttttgtagccaaagagtggcagatacctgtgacaaagcccagatagctttac  c.480-1921

.         .         .         .         .         .           g.35899
tccattggaaattctaagctgctgccagtcaaaagtcatgtataaatttaaatgctaaaa  c.480-1861

.         .         .         .         .         .           g.35959
cagtgacacactgacagcaaagaaaaatgaaaactgacagcagagagagaaactctgcct  c.480-1801

.         .         .         .         .         .           g.36019
gcacaaaatgcataggatttaaggtctatttaaatgaggacaagtaagtttcttataact  c.480-1741

.         .         .         .         .         .           g.36079
ttgctgtggcgtaggtctcagctgtggtggttggacatactgggtcacaaccagtttgaa  c.480-1681

.         .         .         .         .         .           g.36139
ctttgcctcagatcaatgtgggtaatagtaaagtatggaagtttaagtcagtgtattttt  c.480-1621

.         .         .         .         .         .           g.36199
aaaataagtaatggtcatcagatttaacattatccctgttgtaatatcatcactcattta  c.480-1561

.         .         .         .         .         .           g.36259
tattcccgtgtgatttcctggatggataagaggggttggggtcatagctggttttccaga  c.480-1501

.         .         .         .         .         .           g.36319
actgctgaccaccctttttatctctgttgcagcctgtaatctgaggggctggcagggagt  c.480-1441

.         .         .         .         .         .           g.36379
tggggctattgctgtgagtcttcaagataatgctattacatcttttataccttatttaag  c.480-1381

.         .         .         .         .         .           g.36439
acaggaagagagagagagtacggagcacttaagtagaagaattccacttaaaacctaaag  c.480-1321

.         .         .         .         .         .           g.36499
agtcaagcttcaataatatagaaaactcattttcaaattgatagagtttttccacttaac  c.480-1261

.         .         .         .         .         .           g.36559
aatgtattttccttagtggtatattgttagtagcttctttatatgttctgtggaggtcta  c.480-1201

.         .         .         .         .         .           g.36619
aggttccaggagagatccctgaggggtaatcagggtgagaaggccaacccagcaaagttc  c.480-1141

.         .         .         .         .         .           g.36679
agtcccaatccccactttagccatagcagcttttatctgtatcataatcattgggcttct  c.480-1081

.         .         .         .         .         .           g.36739
gcatgtttgtttgaataaaatttgtttctctgaaaaaagtttggaaaccaggccacatct  c.480-1021

.         .         .         .         .         .           g.36799
gttacctagaatgctaaaagtatttggagcgatgataaaccctatgcctgcactatctaa  c.480-961

.         .         .         .         .         .           g.36859
tgtggtagccactagccacatcttgctatttaaatttaaattaattaaaatagagcctta  c.480-901

.         .         .         .         .         .           g.36919
taaaagtcaagccttaaaagtagagcttcatgggcgggcgcggtggctcacgcctgtaat  c.480-841

.         .         .         .         .         .           g.36979
cccagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacaaggtcaggagttcaggaccatcct  c.480-781

.         .         .         .         .         .           g.37039
ggctaacactaacacggggaaaccccgtctctaccaaaaatacaaaaaattagccaagca  c.480-721

.         .         .         .         .         .           g.37099
tggtggtgggcgcctgtggtcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatgacataaa  c.480-661

.         .         .         .         .         .           g.37159
actgggaggcagagcttgcagtgagccaagatcccgccactgcactccaacctgggcgac  c.480-601

.         .         .         .         .         .           g.37219
agagcgagactccgtctcaaaaaagaaaaaaaaaaacaaaacaaaacaaaaaattagccc  c.480-541

.         .         .         .         .         .           g.37279
ggcttggtggtgcatgcctgtaatcccagctacgtgggaggctgaggcagaagaatcgct  c.480-481

.         .         .         .         .         .           g.37339
tgaacctgggagacagaggttgcagtgagacgagataatgccactgcactccagcctggg  c.480-421

.         .         .         .         .         .           g.37399
caacattccgagactccatctcaaaaataaataaataaataaataaataaataaataaat  c.480-361

.         .         .         .         .         .           g.37459
aaataaatatttttttaaaaagtagagcttcataaattggggtggggacatgcatatgta  c.480-301

.         .         .         .         .         .           g.37519
ttcctttttggaacaagttaggttataaacacattatatataaagacataacagaaatgg  c.480-241

.         .         .         .         .         .           g.37579
gccacagatactaaaaacacaaaaatactccttttctgtggatcatagatcacatgttga  c.480-181

.         .         .         .         .         .           g.37639
aggatctcgttttatagccctatcttctgatccctagcatagtaaatgtaaatgaattga  c.480-121

.         .         .         .         .         .           g.37699
tttgttgtttgtgcctttaaatttaataatattaaattaattttccaggagattatttta  c.480-61

.         .         .         .         .         .           g.37759
aaagtcatactttgttacttagtattccataagctaatcatttatttcttttcctattag  c.480-1


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