synaptojanin 1 (SYNJ1) - 5860 nt intron 06 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.38874
gtatgtgtttgacattcagttatttttgttttttgaacaattttcatattttctaaactt  c.789+60

         .         .         .         .         .         .  g.38934
tctggatagtttattaattaattcattgatggttccattattccatctaataatgttagc  c.789+120

         .         .         .         .         .         .  g.38994
tggatttgcaaataagggtctagacgagtacagagtttctggaattatcttagatatttt  c.789+180

         .         .         .         .         .         .  g.39054
ttcttttaatgctctttcaaatagccattgaaattgagctgctgtatttagtgttaaaaa  c.789+240

         .         .         .         .         .         .  g.39114
ttttgaagtctttatagtgtattgatttgcaatgtgattccatatttattaccttcttat  c.789+300

         .         .         .         .         .         .  g.39174
cttagtatataatgatttagtctctttaggcagaagaatgtagtagataaaacaaagcct  c.789+360

         .         .         .         .         .         .  g.39234
tgggaaccagacttcttaattgggatctttactctaccactactagctgtgtgatcttgg  c.789+420

         .         .         .         .         .         .  g.39294
gcaaataatttaacccttgtgtgtctcagtttccttatctgtataatgggaataatatta  c.789+480

         .         .         .         .         .         .  g.39354
atagtacctactttatagggttgttgtaaggattaaattaaaagcacttagaatagcacc  c.789+540

         .         .         .         .         .         .  g.39414
tggcccccagtcagcaccatgtaagggttaactattgttgacattttatttttattcaaa  c.789+600

         .         .         .         .         .         .  g.39474
atttattagtccttgaagtatatcatatttactttaggatctgggtatgtatagtctagt  c.789+660

         .         .         .         .         .         .  g.39534
aagtttggtgcttcagcctatagtattgagaaaagggaaagaaaaaaaaatctttcttcc  c.789+720

         .         .         .         .         .         .  g.39594
tttatttgactgctggatctcttacatcttagactggttattgcagagaaaaattacaga  c.789+780

         .         .         .         .         .         .  g.39654
ctacttgaacctttttagtaacattttatttaagacagtctaagagttaacaaggattaa  c.789+840

         .         .         .         .         .         .  g.39714
cacttctactgctctgcaaaaattcttgaattcttgtcaagacgatttgacttgttttat  c.789+900

         .         .         .         .         .         .  g.39774
ctttgtagggataacgtaaatagatatatctttccctaaatttcccttaggagagaatgc  c.789+960

         .         .         .         .         .         .  g.39834
caacagaaccccacttctcctacgctttcatgatcaacagtgggtgtttggagtatttgc  c.789+1020

         .         .         .         .         .         .  g.39894
tttaagaacattgctgaaaccctgatgtgatgcgaggtgaatgcttttgttttagggaca  c.789+1080

         .         .         .         .         .         .  g.39954
ggctagtgttagagattctaataaccagtttatgagccctatggtacactgtttttatgt  c.789+1140

         .         .         .         .         .         .  g.40014
tattttatttctttgtttaatttatttatatttatttatttatatatttatttatttgag  c.789+1200

         .         .         .         .         .         .  g.40074
acagggtctcactctgccacccaggcttgagtgcactggtgcaatcatggctcactgcag  c.789+1260

         .         .         .         .         .         .  g.40134
cctcgatctcccaggctcaagtgatcctcccacctcagcctgccaggtagctgggactac  c.789+1320

         .         .         .         .         .         .  g.40194
aggcacataccactattttttgtagagacagggtcccaccttgttgcccaggatggtctt  c.789+1380

         .         .         .         .         .         .  g.40254
gaactcctgggcaaacagttctcctgccttggcctcccaaaatgctaggattacaggcct  c.789+1440

         .         .         .         .         .         .  g.40314
gagccactgtacttggcctgtgttattttaataagttctgaattacagtgttttgatgat  c.789+1500

         .         .         .         .         .         .  g.40374
ccaataaggttgcgtcctgagtagttacactgagggatcttccttgagtgggacttcctt  c.789+1560

         .         .         .         .         .         .  g.40434
gtgccttccttctcctgtgtgctttccttcctatacggtctggttggctaatgttatgtg  c.789+1620

         .         .         .         .         .         .  g.40494
gtgataggtggaaaattatggattttttttttggcacggaatgatgctctgtcgcccagg  c.789+1680

         .         .         .         .         .         .  g.40554
ctggagtgcagtggtgcgatctcagcttactgcaacctccgcctcccagggtcaagcaat  c.789+1740

         .         .         .         .         .         .  g.40614
tctcctacctcagcctcccgagagctgggactataggcgcgtgccaccacacttggctaa  c.789+1800

         .         .         .         .         .         .  g.40674
tttttttatttttagtagaaatggggtttcaccatattgaccagactggtcttgcactcc  c.789+1860

         .         .         .         .         .         .  g.40734
tgatctcaggtgatccacctgccttggcctcccaaaggactgggattacaggcatgagcc  c.789+1920

         .         .         .         .         .         .  g.40794
accgtgcccggccaggaatcctcatttttaaccaagttctctaccactcaaagtcaagaa  c.789+1980

         .         .         .         .         .         .  g.40854
cttctattttataagatcctactctaatggctatgaagcagccagtcctgaccaagtgaa  c.789+2040

         .         .         .         .         .         .  g.40914
aagtagccctgttaccattagtctcagcattgttctaggcagtaggactttctttttatt  c.789+2100

         .         .         .         .         .         .  g.40974
cccactactatcctctgagttaaggttttcataatttcttctagcctggaagattctcac  c.789+2160

         .         .         .         .         .         .  g.41034
agttttctgtcttgtccctctaggccctgcttcctactagctccgacaggtcttcttatt  c.789+2220

         .         .         .         .         .         .  g.41094
tttgatatatatgttatgcgtgtcagatttactaggcacctatgtccttatgatctggtt  c.789+2280

         .         .         .         .         .         .  g.41154
tactcagcctgtccaacttcaggccttgcagttttctagcaggaatcctctacttccaaa  c.789+2340

         .         .         .         .         .         .  g.41214
attaagatttattgtccttcagtggccactcagatctcttcactaaatacttgagttctt  c.789+2400

         .         .         .         .         .         .  g.41274
cctgtgtatgttattttatgctaggtgctatgagagattcaaagatataatgatgcttca  c.789+2460

         .         .         .         .         .         .  g.41334
tagagaggttgccatttgggcactcaggccttttatggaaaagataaataccaagatgaa  c.789+2520

         .         .         .         .         .         .  g.41394
tttgtttgaggcattataagaattgtcataaggtgttacacaagtaagaatgacattttt  c.789+2580

         .         .         .         .         .         .  g.41454
agtgctggcaacttacttatgatttcctttgacttgtgattttccttttacttatgattt  c.789+2640

         .         .         .         .         .         .  g.41514
cctttccctgaagttgtttagcatttataacttataatactcagatcatatattattata  c.789+2700

         .         .         .         .         .         .  g.41574
ctacatttacagtatatatcagtttattagtccattctcacattgctgtaaagaaatacc  c.789+2760

         .         .         .         .         .         .  g.41634
caagtctgagtaatttatgaagaaagaagtttaattggcttatggttctgcaggttgtac  c.789+2820

         .         .         .         .         .         .  g.41694
aggaagaatggcagcatctgcttctggggaggcttcaggaagcttccagtcatggcaaaa  c.789+2880

         .         .         .         .         .  g.41744
ggcaaaaggggagcgaggagtctcacatggtgggagcaggagcaaaagaa  c.789+2930

--------------------- middle of intron ---------------------
        g.41745     .         .         .         .         .           g.41794
        c.790-2930  agataagagcgaggtgctacacacttttaagtaaccagatctcatgagaa  c.790-2881

.         .         .         .         .         .           g.41854
ctcactcactagtatgagaacaatacaagggggcatagtgccaaaccattcatgagaact  c.790-2821

.         .         .         .         .         .           g.41914
ccacccccatgattcagtcacctcccaccagaccccaccttcaaccttgggggttacaat  c.790-2761

.         .         .         .         .         .           g.41974
tcagaatgagatttagggggtacacagatccaaaccgtatcaatcagtcaaaaaatggta  c.790-2701

.         .         .         .         .         .           g.42034
aacattgtaaggtctacccccaatttttggttgaaatttcagaaatatgtgaaggtaaag  c.790-2641

.         .         .         .         .         .           g.42094
aagtaatattgatggaaaatgatataccataccacacaattaaatgatttttaaaaatac  c.790-2581

.         .         .         .         .         .           g.42154
ctttaatgcaagctttttttttcccccaagttggaatttagctcttgttgcccattggag  c.790-2521

.         .         .         .         .         .           g.42214
tgcaatggcacagtcttggctcaccgcaacctccgcctcccggcttcaagtgattctcct  c.790-2461

.         .         .         .         .         .           g.42274
acctcagcatcccgagtagctgggattacaggcatgtgccaccatgcccagctaattttt  c.790-2401

.         .         .         .         .         .           g.42334
gtattttagtagagacaaggtttcaccatgttggtcaggccggtctcaaactcctgacct  c.790-2341

.         .         .         .         .         .           g.42394
caggtgatccgctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccagctgcctcggcctcccc  c.790-2281

.         .         .         .         .         .           g.42454
aagtactgggattacaggcatgagccaccacacctggccgcaacttttttttaattgggt  c.790-2221

.         .         .         .         .         .           g.42514
aaagttatggttatttaaagccttaacactttctggagtgctacttttatcacgattggc  c.790-2161

.         .         .         .         .         .           g.42574
aatagctctgttattgtaaaacttttctttcaacattgagtaataaaacctagtctagga  c.790-2101

.         .         .         .         .         .           g.42634
ggccatgatgggaggattacttgagaccaggagttcaagaccatcctgggcaacatagac  c.790-2041

.         .         .         .         .         .           g.42694
ccatatttctacaaaaaaataaaaaaataaaaatcattcgggcatggtgacgtgtgcctg  c.790-1981

.         .         .         .         .         .           g.42754
tagtctcagctactcagcaggctgaggtgggaggatcccttgagcccaggaggtcgaggc  c.790-1921

.         .         .         .         .         .           g.42814
tgcagtgagctatggttgcaccactgcattccagcatggttacagagtgagaccctgtct  c.790-1861

.         .         .         .         .         .           g.42874
ctaataacacaaaaacagaaatctaatctagtctagccagtatattgctatgagagctgt  c.790-1801

.         .         .         .         .         .           g.42934
gatacatagctgaatgtatatatgtgttggggaacagagtggtggaaaacaaccataggc  c.790-1741

.         .         .         .         .         .           g.42994
attacctggaagacatgaaaactggatttttttcaccttatgcaccgttgcagtactatg  c.790-1681

.         .         .         .         .         .           g.43054
caaaataaatgttaatcagtaaacaaaaatgctaagttttgaacttgtatggagtgatag  c.790-1621

.         .         .         .         .         .           g.43114
gcaattaatctgggattactccaaagaaaaagtatcaacttgtgagttttctgcagtcta  c.790-1561

.         .         .         .         .         .           g.43174
aaatgcttaatgtcctgggacatacgtctttcaaattttaaacttttatgaatattatta  c.790-1501

.         .         .         .         .         .           g.43234
agtaccataaaatgaaattgaacacagatgtgacattaggctaattgatttcttatttaa  c.790-1441

.         .         .         .         .         .           g.43294
aaattaaagagagaatcccctggttatcagaatactcattagattatctgacttagtgca  c.790-1381

.         .         .         .         .         .           g.43354
gtgagggataatgcttaatgaatgataatactgtactgttaattcagttttggaattgga  c.790-1321

.         .         .         .         .         .           g.43414
tgagcatattagagtttattttctggttttacttgtccaattacatgactgatttgacaa  c.790-1261

.         .         .         .         .         .           g.43474
ccccccttttacaccctctttaaaagcactttgcgcggggcgcggtggctcatgcctgta  c.790-1201

.         .         .         .         .         .           g.43534
atcccagcactttgggaggctgaggcgggcagatcacaaggtcaagagattgagaccatc  c.790-1141

.         .         .         .         .         .           g.43594
ctggccaacatggcgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagctgggcgtggtg  c.790-1081

.         .         .         .         .         .           g.43654
gcgggcgcctgtagtcccagccactcgggaggctgaggcaggagaatcgcctgaacccgg  c.790-1021

.         .         .         .         .         .           g.43714
gaggcagaggttgcagtgagccgagatcacgccaatgcactccagcctggcaacagagtg  c.790-961

.         .         .         .         .         .           g.43774
agactccgtcccccacaaaaaaaagcactttgttcacaggttagcaagaatgaattttgg  c.790-901

.         .         .         .         .         .           g.43834
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.         .         .         .         .         .           g.43894
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.         .         .         .         .         .           g.43954
tcttcttggcatgttatatctttctcaattatgcctcatctctctgctattctcctgtgt  c.790-721

.         .         .         .         .         .           g.44014
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.         .         .         .         .         .           g.44074
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.         .         .         .         .         .           g.44134
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.         .         .         .         .         .           g.44194
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.         .         .         .         .         .           g.44254
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.         .         .         .         .         .           g.44314
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.         .         .         .         .         .           g.44374
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.         .         .         .         .         .           g.44434
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.         .         .         .         .         .           g.44494
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.         .         .         .         .         .           g.44554
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.         .         .         .         .         .           g.44614
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.         .         .         .         .         .           g.44674
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