synaptojanin 1 (SYNJ1) - 5860 nt intron 06 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.38874
gtatgtgtttgacattcagttatttttgttttttgaacaattttcatattttctaaactt  c.906+60

         .         .         .         .         .         .  g.38934
tctggatagtttattaattaattcattgatggttccattattccatctaataatgttagc  c.906+120

         .         .         .         .         .         .  g.38994
tggatttgcaaataagggtctagacgagtacagagtttctggaattatcttagatatttt  c.906+180

         .         .         .         .         .         .  g.39054
ttcttttaatgctctttcaaatagccattgaaattgagctgctgtatttagtgttaaaaa  c.906+240

         .         .         .         .         .         .  g.39114
ttttgaagtctttatagtgtattgatttgcaatgtgattccatatttattaccttcttat  c.906+300

         .         .         .         .         .         .  g.39174
cttagtatataatgatttagtctctttaggcagaagaatgtagtagataaaacaaagcct  c.906+360

         .         .         .         .         .         .  g.39234
tgggaaccagacttcttaattgggatctttactctaccactactagctgtgtgatcttgg  c.906+420

         .         .         .         .         .         .  g.39294
gcaaataatttaacccttgtgtgtctcagtttccttatctgtataatgggaataatatta  c.906+480

         .         .         .         .         .         .  g.39354
atagtacctactttatagggttgttgtaaggattaaattaaaagcacttagaatagcacc  c.906+540

         .         .         .         .         .         .  g.39414
tggcccccagtcagcaccatgtaagggttaactattgttgacattttatttttattcaaa  c.906+600

         .         .         .         .         .         .  g.39474
atttattagtccttgaagtatatcatatttactttaggatctgggtatgtatagtctagt  c.906+660

         .         .         .         .         .         .  g.39534
aagtttggtgcttcagcctatagtattgagaaaagggaaagaaaaaaaaatctttcttcc  c.906+720

         .         .         .         .         .         .  g.39594
tttatttgactgctggatctcttacatcttagactggttattgcagagaaaaattacaga  c.906+780

         .         .         .         .         .         .  g.39654
ctacttgaacctttttagtaacattttatttaagacagtctaagagttaacaaggattaa  c.906+840

         .         .         .         .         .         .  g.39714
cacttctactgctctgcaaaaattcttgaattcttgtcaagacgatttgacttgttttat  c.906+900

         .         .         .         .         .         .  g.39774
ctttgtagggataacgtaaatagatatatctttccctaaatttcccttaggagagaatgc  c.906+960

         .         .         .         .         .         .  g.39834
caacagaaccccacttctcctacgctttcatgatcaacagtgggtgtttggagtatttgc  c.906+1020

         .         .         .         .         .         .  g.39894
tttaagaacattgctgaaaccctgatgtgatgcgaggtgaatgcttttgttttagggaca  c.906+1080

         .         .         .         .         .         .  g.39954
ggctagtgttagagattctaataaccagtttatgagccctatggtacactgtttttatgt  c.906+1140

         .         .         .         .         .         .  g.40014
tattttatttctttgtttaatttatttatatttatttatttatatatttatttatttgag  c.906+1200

         .         .         .         .         .         .  g.40074
acagggtctcactctgccacccaggcttgagtgcactggtgcaatcatggctcactgcag  c.906+1260

         .         .         .         .         .         .  g.40134
cctcgatctcccaggctcaagtgatcctcccacctcagcctgccaggtagctgggactac  c.906+1320

         .         .         .         .         .         .  g.40194
aggcacataccactattttttgtagagacagggtcccaccttgttgcccaggatggtctt  c.906+1380

         .         .         .         .         .         .  g.40254
gaactcctgggcaaacagttctcctgccttggcctcccaaaatgctaggattacaggcct  c.906+1440

         .         .         .         .         .         .  g.40314
gagccactgtacttggcctgtgttattttaataagttctgaattacagtgttttgatgat  c.906+1500

         .         .         .         .         .         .  g.40374
ccaataaggttgcgtcctgagtagttacactgagggatcttccttgagtgggacttcctt  c.906+1560

         .         .         .         .         .         .  g.40434
gtgccttccttctcctgtgtgctttccttcctatacggtctggttggctaatgttatgtg  c.906+1620

         .         .         .         .         .         .  g.40494
gtgataggtggaaaattatggattttttttttggcacggaatgatgctctgtcgcccagg  c.906+1680

         .         .         .         .         .         .  g.40554
ctggagtgcagtggtgcgatctcagcttactgcaacctccgcctcccagggtcaagcaat  c.906+1740

         .         .         .         .         .         .  g.40614
tctcctacctcagcctcccgagagctgggactataggcgcgtgccaccacacttggctaa  c.906+1800

         .         .         .         .         .         .  g.40674
tttttttatttttagtagaaatggggtttcaccatattgaccagactggtcttgcactcc  c.906+1860

         .         .         .         .         .         .  g.40734
tgatctcaggtgatccacctgccttggcctcccaaaggactgggattacaggcatgagcc  c.906+1920

         .         .         .         .         .         .  g.40794
accgtgcccggccaggaatcctcatttttaaccaagttctctaccactcaaagtcaagaa  c.906+1980

         .         .         .         .         .         .  g.40854
cttctattttataagatcctactctaatggctatgaagcagccagtcctgaccaagtgaa  c.906+2040

         .         .         .         .         .         .  g.40914
aagtagccctgttaccattagtctcagcattgttctaggcagtaggactttctttttatt  c.906+2100

         .         .         .         .         .         .  g.40974
cccactactatcctctgagttaaggttttcataatttcttctagcctggaagattctcac  c.906+2160

         .         .         .         .         .         .  g.41034
agttttctgtcttgtccctctaggccctgcttcctactagctccgacaggtcttcttatt  c.906+2220

         .         .         .         .         .         .  g.41094
tttgatatatatgttatgcgtgtcagatttactaggcacctatgtccttatgatctggtt  c.906+2280

         .         .         .         .         .         .  g.41154
tactcagcctgtccaacttcaggccttgcagttttctagcaggaatcctctacttccaaa  c.906+2340

         .         .         .         .         .         .  g.41214
attaagatttattgtccttcagtggccactcagatctcttcactaaatacttgagttctt  c.906+2400

         .         .         .         .         .         .  g.41274
cctgtgtatgttattttatgctaggtgctatgagagattcaaagatataatgatgcttca  c.906+2460

         .         .         .         .         .         .  g.41334
tagagaggttgccatttgggcactcaggccttttatggaaaagataaataccaagatgaa  c.906+2520

         .         .         .         .         .         .  g.41394
tttgtttgaggcattataagaattgtcataaggtgttacacaagtaagaatgacattttt  c.906+2580

         .         .         .         .         .         .  g.41454
agtgctggcaacttacttatgatttcctttgacttgtgattttccttttacttatgattt  c.906+2640

         .         .         .         .         .         .  g.41514
cctttccctgaagttgtttagcatttataacttataatactcagatcatatattattata  c.906+2700

         .         .         .         .         .         .  g.41574
ctacatttacagtatatatcagtttattagtccattctcacattgctgtaaagaaatacc  c.906+2760

         .         .         .         .         .         .  g.41634
caagtctgagtaatttatgaagaaagaagtttaattggcttatggttctgcaggttgtac  c.906+2820

         .         .         .         .         .         .  g.41694
aggaagaatggcagcatctgcttctggggaggcttcaggaagcttccagtcatggcaaaa  c.906+2880

         .         .         .         .         .  g.41744
ggcaaaaggggagcgaggagtctcacatggtgggagcaggagcaaaagaa  c.906+2930

--------------------- middle of intron ---------------------
        g.41745     .         .         .         .         .           g.41794
        c.907-2930  agataagagcgaggtgctacacacttttaagtaaccagatctcatgagaa  c.907-2881

.         .         .         .         .         .           g.41854
ctcactcactagtatgagaacaatacaagggggcatagtgccaaaccattcatgagaact  c.907-2821

.         .         .         .         .         .           g.41914
ccacccccatgattcagtcacctcccaccagaccccaccttcaaccttgggggttacaat  c.907-2761

.         .         .         .         .         .           g.41974
tcagaatgagatttagggggtacacagatccaaaccgtatcaatcagtcaaaaaatggta  c.907-2701

.         .         .         .         .         .           g.42034
aacattgtaaggtctacccccaatttttggttgaaatttcagaaatatgtgaaggtaaag  c.907-2641

.         .         .         .         .         .           g.42094
aagtaatattgatggaaaatgatataccataccacacaattaaatgatttttaaaaatac  c.907-2581

.         .         .         .         .         .           g.42154
ctttaatgcaagctttttttttcccccaagttggaatttagctcttgttgcccattggag  c.907-2521

.         .         .         .         .         .           g.42214
tgcaatggcacagtcttggctcaccgcaacctccgcctcccggcttcaagtgattctcct  c.907-2461

.         .         .         .         .         .           g.42274
acctcagcatcccgagtagctgggattacaggcatgtgccaccatgcccagctaattttt  c.907-2401

.         .         .         .         .         .           g.42334
gtattttagtagagacaaggtttcaccatgttggtcaggccggtctcaaactcctgacct  c.907-2341

.         .         .         .         .         .           g.42394
caggtgatccgctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccagctgcctcggcctcccc  c.907-2281

.         .         .         .         .         .           g.42454
aagtactgggattacaggcatgagccaccacacctggccgcaacttttttttaattgggt  c.907-2221

.         .         .         .         .         .           g.42514
aaagttatggttatttaaagccttaacactttctggagtgctacttttatcacgattggc  c.907-2161

.         .         .         .         .         .           g.42574
aatagctctgttattgtaaaacttttctttcaacattgagtaataaaacctagtctagga  c.907-2101

.         .         .         .         .         .           g.42634
ggccatgatgggaggattacttgagaccaggagttcaagaccatcctgggcaacatagac  c.907-2041

.         .         .         .         .         .           g.42694
ccatatttctacaaaaaaataaaaaaataaaaatcattcgggcatggtgacgtgtgcctg  c.907-1981

.         .         .         .         .         .           g.42754
tagtctcagctactcagcaggctgaggtgggaggatcccttgagcccaggaggtcgaggc  c.907-1921

.         .         .         .         .         .           g.42814
tgcagtgagctatggttgcaccactgcattccagcatggttacagagtgagaccctgtct  c.907-1861

.         .         .         .         .         .           g.42874
ctaataacacaaaaacagaaatctaatctagtctagccagtatattgctatgagagctgt  c.907-1801

.         .         .         .         .         .           g.42934
gatacatagctgaatgtatatatgtgttggggaacagagtggtggaaaacaaccataggc  c.907-1741

.         .         .         .         .         .           g.42994
attacctggaagacatgaaaactggatttttttcaccttatgcaccgttgcagtactatg  c.907-1681

.         .         .         .         .         .           g.43054
caaaataaatgttaatcagtaaacaaaaatgctaagttttgaacttgtatggagtgatag  c.907-1621

.         .         .         .         .         .           g.43114
gcaattaatctgggattactccaaagaaaaagtatcaacttgtgagttttctgcagtcta  c.907-1561

.         .         .         .         .         .           g.43174
aaatgcttaatgtcctgggacatacgtctttcaaattttaaacttttatgaatattatta  c.907-1501

.         .         .         .         .         .           g.43234
agtaccataaaatgaaattgaacacagatgtgacattaggctaattgatttcttatttaa  c.907-1441

.         .         .         .         .         .           g.43294
aaattaaagagagaatcccctggttatcagaatactcattagattatctgacttagtgca  c.907-1381

.         .         .         .         .         .           g.43354
gtgagggataatgcttaatgaatgataatactgtactgttaattcagttttggaattgga  c.907-1321

.         .         .         .         .         .           g.43414
tgagcatattagagtttattttctggttttacttgtccaattacatgactgatttgacaa  c.907-1261

.         .         .         .         .         .           g.43474
ccccccttttacaccctctttaaaagcactttgcgcggggcgcggtggctcatgcctgta  c.907-1201

.         .         .         .         .         .           g.43534
atcccagcactttgggaggctgaggcgggcagatcacaaggtcaagagattgagaccatc  c.907-1141

.         .         .         .         .         .           g.43594
ctggccaacatggcgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagctgggcgtggtg  c.907-1081

.         .         .         .         .         .           g.43654
gcgggcgcctgtagtcccagccactcgggaggctgaggcaggagaatcgcctgaacccgg  c.907-1021

.         .         .         .         .         .           g.43714
gaggcagaggttgcagtgagccgagatcacgccaatgcactccagcctggcaacagagtg  c.907-961

.         .         .         .         .         .           g.43774
agactccgtcccccacaaaaaaaagcactttgttcacaggttagcaagaatgaattttgg  c.907-901

.         .         .         .         .         .           g.43834
gcaacttttttgccccccctcagtgatccttgttgtgattgggcaaccttcattccaacg  c.907-841

.         .         .         .         .         .           g.43894
tctcagagagaaatgtttaaattgaagttcagggaaataatctggtctcacctatatatt  c.907-781

.         .         .         .         .         .           g.43954
tcttcttggcatgttatatctttctcaattatgcctcatctctctgctattctcctgtgt  c.907-721

.         .         .         .         .         .           g.44014
aagaaaagaaaaattataacaatatacaataggtagatattttccatcttgtttaatttg  c.907-661

.         .         .         .         .         .           g.44074
cttaacccaaaattcctgattctgcaaaatgtgcaaatactataattgggtgatggcaag  c.907-601

.         .         .         .         .         .           g.44134
gttgacttggaaagtctgcttttccaggaaggaatgatattctcaatttggtggaacttt  c.907-541

.         .         .         .         .         .           g.44194
ggtgtgaatagaatattcaacatagtagagaagaaaacacatagacatttgtattggtag  c.907-481

.         .         .         .         .         .           g.44254
gcagcttggaggagtaggaatttaggtcagagacataaagtctcatctgaatctcttttg  c.907-421

.         .         .         .         .         .           g.44314
gaattggttatgttgatctcagatagcaagttattttacctgttggtattttggtttttt  c.907-361

.         .         .         .         .         .           g.44374
taattacccaaatggtaatagtatctgttacacagggcatgtagtttgaacttaaaacaa  c.907-301

.         .         .         .         .         .           g.44434
agtaccatatatgaaaacacctttaaaaatagttttcatcaataaaaattcctactagtt  c.907-241

.         .         .         .         .         .           g.44494
tacgagtatttcataatgatgtaacttctttttttgatgaggttggttttttaaaaataa  c.907-181

.         .         .         .         .         .           g.44554
aggtggagggtggaaattccctggaacttgtttttttaaaagcatatcatgaatggaaat  c.907-121

.         .         .         .         .         .           g.44614
cagttatttgattaacgactgtgtgttcagcaaagaaattgttagatattgtaagcagtg  c.907-61

.         .         .         .         .         .           g.44674
atatttctttcgtctatatgttggtttttggtttgattaaatatatttttcttgtctaag  c.907-1


Powered by LOVD v.3.0 Build 27
©2004-2022 Leiden University Medical Center