U6 snRNA biogenesis 1 (USB1) - 7283 nt intron 02 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.8160
gtgagtgatgtgtgaaaggcaagttgccaagacccatagacccgtaggtgcctcatgaag  c.265+60

         .         .         .         .         .         .  g.8220
ggcagaatctggccccaactagaaggaagaaaccagaaacctctaacactggtggtggga  c.265+120

         .         .         .         .         .         .  g.8280
aagtcattgacttagcagagaaagagcaggtttcaagaactggggatttttctgtcatct  c.265+180

         .         .         .         .         .         .  g.8340
tggttttgaattcgtagcctaaaatgtgtattacctctgggtataatattctccctgttc  c.265+240

         .         .         .         .         .         .  g.8400
acgaggaggtgaccaaaggagaatctggagcagggtgtcaaggtcatgccaggcacttta  c.265+300

         .         .         .         .         .         .  g.8460
tttctgagagggccctgggtacgctgggtgtgcaaggttcaaatcccaccctagctctga  c.265+360

         .         .         .         .         .         .  g.8520
tcagcaggtggaagacaaaaaatgcccaggcttcagagtcagacctcactccgctgccca  c.265+420

         .         .         .         .         .         .  g.8580
ctactctgggtgccctttataagatactagacttctcagagcttcagtttcttcaaatct  c.265+480

         .         .         .         .         .         .  g.8640
aaaatgggggtagcactggctaggccaggtggctcacacctatagtcccagcactttggg  c.265+540

         .         .         .         .         .         .  g.8700
aagcggaggcaggcagatcacttgagcccaggtgtttgagaccagcctcggcaacaggta  c.265+600

         .         .         .         .         .         .  g.8760
gaaaccctgtttctaccaaaaatacaaaaaaattagccaggtgtggtggcacacgcctat  c.265+660

         .         .         .         .         .         .  g.8820
ggttcccactacttgagaggctgaggtaggcggattgactgaccctgggaggtagagact  c.265+720

         .         .         .         .         .         .  g.8880
gtggtgtgccaagatcgctccactgcactccagcctgggtgacagagtgagactccatct  c.265+780

         .         .         .         .         .         .  g.8940
caaataagacagtttggtggcttcttacaaaactaaacatactcttatcataaaatccag  c.265+840

         .         .         .         .         .         .  g.9000
caattacattccttggtttttgcccaaaggagttgcatttggtattgacagtgttctgga  c.265+900

         .         .         .         .         .         .  g.9060
gtttagccattctaataggtgtgtagcaatatgtcactgttgtctgttaatttgcatttc  c.265+960

         .         .         .         .         .         .  g.9120
cctgatgacatatgatccagatcatcttttcaatgctttttgccatctgtgtatcttcct  c.265+1020

         .         .         .         .         .         .  g.9180
cagtgaggtgtctgttaaggtcttttgcccactttttaatcatttttgtttattaatatt  c.265+1080

         .         .         .         .         .         .  g.9240
aatcatttttgtttattaataaattttaatcatttttgtttatttaatattatgatgtgg  c.265+1140

         .         .         .         .         .         .  g.9300
gtctaatattggatcttaaaatattgagttttaagagttctttatatttgaaataatagt  c.265+1200

         .         .         .         .         .         .  g.9360
cctttatcagatacgtcttttgcaaatacatttttttcccagccagtcgcttgtcttttc  c.265+1260

         .         .         .         .         .         .  g.9420
attctcttgacgttgtccttcacagagcagaagtttttaagtttaatgaagtccagctta  c.265+1320

         .         .         .         .         .         .  g.9480
tcaattatttctttcatggatcttgcctttggtgtcatatctaaaaagttgtcaccaaac  c.265+1380

         .         .         .         .         .         .  g.9540
ccaagatcatctacatttttctcctatgttatctttcaggaatcttacagttttgcattt  c.265+1440

         .         .         .         .         .         .  g.9600
tacatttagttctgtgtccattttgagttaatttttgtgaaaggtggaaggtctgtgtct  c.265+1500

         .         .         .         .         .         .  g.9660
agattccttttcttatatatggatatccagttattccagcaccattggttgaaaagactc  c.265+1560

         .         .         .         .         .         .  g.9720
tctttttcacattgtattgcttttgctcctttgccaaagatcggttgactgtattgatgt  c.265+1620

         .         .         .         .         .         .  g.9780
gggtctatttctgggttctcaattctgttccattcatctatttgttcaccaataccattg  c.265+1680

         .         .         .         .         .         .  g.9840
gtgaactgttttgattgctgtaactttacatagttaagtctcgaagttgggtagtttcag  c.265+1740

         .         .         .         .         .         .  g.9900
tcctccaactttgttcttctccttcagtagtgtgttgactattctgggttttttgggggc  c.265+1800

         .         .         .         .         .         .  g.9960
tttttttggttttttttagagatagggtctcactatattgcccaagctggtcttgaattc  c.265+1860

         .         .         .         .         .         .  g.10020
ctgggctcaagcaatcctctggcctcagcctcccaaagtgcttggattacagggatgagc  c.265+1920

         .         .         .         .         .         .  g.10080
cacagcacttggcctgttttggttttttacctctccatgtacaccttagaatccgtttgt  c.265+1980

         .         .         .         .         .         .  g.10140
cagtatcacaaaataacttgctgagattttgactgggattgtattgaatctgtagatcaa  c.265+2040

         .         .         .         .         .         .  g.10200
attgggaagaactgacatctttacaatattgaatctttctgtctataaacatagaatatc  c.265+2100

         .         .         .         .         .         .  g.10260
ttgtagggtccagccccactgggtcggtgggttttctccctgtgtgcggagacgagagat  c.265+2160

         .         .         .         .         .         .  g.10320
tgtagaaataaagacacaagacaaagagataagagaaaagacagctgggcccgggggacc  c.265+2220

         .         .         .         .         .         .  g.10380
actactaccaagacgcggagaccggtagtggcctcgaatgccaggctgcgctgatattta  c.265+2280

         .         .         .         .         .         .  g.10440
ttggatacaagacaaagggtcagggtaaggagtgtgagccatctccaatgattgacaagg  c.265+2340

         .         .         .         .         .         .  g.10500
ttacgtgagtcacgccacttggacgggggcccttgcctgcctggcagctgaggcagagag  c.265+2400

         .         .         .         .         .         .  g.10560
agagagggagagagagaggacagcttacaccattatttctgcatatcagagacttttagt  c.265+2460

         .         .         .         .         .         .  g.10620
actttcactaattttgctactgctagctaaaaggcagagccaggtgtacaggtgtgaagg  c.265+2520

         .         .         .         .         .         .  g.10680
cagactaggagcatgaccactgaagcacagcatcacagggagatggttaggcctccagat  c.265+2580

         .         .         .         .         .         .  g.10740
aactgcgggcgggcctaactgatgttaggccctccacaagaggtggaggagcagagtctt  c.265+2640

         .         .         .         .         .         .  g.10800
ctctaaactcccctggggaaagggagactccctttcccggtctgctaagtagcgggtgtt  c.265+2700

         .         .         .         .         .         .  g.10860
ttcccttggcactgacgctaccgttagaccacggtccacttggcaatgggcatcttccca  c.265+2760

         .         .         .         .         .         .  g.10920
gacgctggcattactgctagaccaaggagccctctggtggccctgtccgggcatgacaga  c.265+2820

         .         .         .         .         .         .  g.10980
gggctcgcactcttgtcttctggtcacttctcactatgtcccctcagctcctatctctgt  c.265+2880

         .         .         .         .         .         .  g.11040
atggcctggtttttcctaggttatgattatagagcgaggattattatatattggaataaa  c.265+2940

         .         .         .         .         .         .  g.11100
gagtaattgctacaaactaatgattaataatattcatatataatcatgtctatgatctag  c.265+3000

         .         .         .         .         .         .  g.11160
atctagtataactcttgttgttttatatattttattatactggaacaactcgtgccctcg  c.265+3060

         .         .         .         .         .         .  g.11220
gtctcttgcctcggcacctggatggcttgccacccacaacatctctccacttacttagtt  c.265+3120

         .         .         .         .         .         .  g.11280
cttctttgatttctttcatcagagttttatagttttcctcatatagatcttatacttatt  c.265+3180

         .         .         .         .         .         .  g.11340
ttgttagatttatacttaagtatttcattttgctgggggtgctaaggtaaaccctgtatc  c.265+3240

         .         .         .         .         .         .  g.11400
tttaatttcaaatcctacttgttcgttgctggtgtataggaaagcaaatatacagaagtt  c.265+3300

         .         .         .         .         .         .  g.11460
gacttttgtatgttaactttgtacactgcaaccttgctatatcatttattacttccagga  c.265+3360

         .         .         .         .         .         .  g.11520
aattttttttggtagttcttttggattttctccgtagacaattatgtcatctatgaagaa  c.265+3420

         .         .         .         .         .         .  g.11580
aaacacgctgggtgtggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggtcaaggtgg  c.265+3480

         .         .         .         .         .         .  g.11640
acagattacctgaggttgggagttcaagaccagcctgaccaacatggagaaaccccattt  c.265+3540

         .         .         .         .         .         .  g.11700
ctactaaaaatacaaaattagccagccgtggtgggacatgcctgtagtcccagctacttg  c.265+3600

         .         .         .         .    g.11742
ggaggctgaggtaggagaatcacttgaacccaggaggcaatg  c.265+3642

--------------------- middle of intron ---------------------
       g.11743      .         .         .         .           g.11783
       c.266-3641  gttgcagtgagccaagattgcaccattgcactccgtcctgg  c.266-3601

.         .         .         .         .         .           g.11843
tcaacaagagcaaaacctcgtttcaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaaacggacaca  c.266-3541

.         .         .         .         .         .           g.11903
gtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggcagatcacaaggtca  c.266-3481

.         .         .         .         .         .           g.11963
ggagttcaagaccagcctggccaacatggcgaaacccccatctctactaaaaatacaaaa  c.266-3421

.         .         .         .         .         .           g.12023
attagctgggcatggtggcacatgcctgtaatcccagctacttagaaggctgaggcagga  c.266-3361

.         .         .         .         .         .           g.12083
gaattgcttgaacccgggaggtggaggttgcagtgagcggagagtgcaccactgcactcc  c.266-3301

.         .         .         .         .         .           g.12143
agcctgggcaacagagcaagactctgtcttggggaaaaaaaaaagaaaaacaggcttatt  c.266-3241

.         .         .         .         .         .           g.12203
tcttctttgctaatctgtataccttttatttccttttcttgccttattgcattagctagg  c.266-3181

.         .         .         .         .         .           g.12263
acttccagtatgagttgaaaagcaatagtgagaggaggcatcattaccttgttcctgatc  c.266-3121

.         .         .         .         .         .           g.12323
ttaatgggaaagctttggagtttcctatcagttagctataggtatttttagacattctct  c.266-3061

.         .         .         .         .         .           g.12383
atcaagttaacaaagttcccctctattcctagttttctgagagtttttatcttgaatggg  c.266-3001

.         .         .         .         .         .           g.12443
tattggattttgtcaaatactttttctgtatttattgataggatcatttgatttttctcc  c.266-2941

.         .         .         .         .         .           g.12503
tttagcctattgattggatggattacattaattgatttttgaatgttgagcctgctttga  c.266-2881

.         .         .         .         .         .           g.12563
atacctgggataaatcccatttagttgtggagcattattctctttatatgttgttgtatt  c.266-2821

.         .         .         .         .         .           g.12623
caatttgctaatattttcttgaaaatcttgcatctctgtccatgagagatatgggtctgt  c.266-2761

.         .         .         .         .         .           g.12683
agttttcttgtaatgtctttttctggtattggtatgaggataatgctggcctcatggaat  c.266-2701

.         .         .         .         .         .           g.12743
aagtcaggaagtattctctctgcttttgtcttctgaaagattatagataattggtttaat  c.266-2641

.         .         .         .         .         .           g.12803
tttttccttaaatgtttggtgggattctctagtgaaccgaacccatctgggcctggtgcc  c.266-2581

.         .         .         .         .         .           g.12863
ttctgttttggaaggtaatttttgtttgtttgtttgtttgtttgtttttcggagacagag  c.266-2521

.         .         .         .         .         .           g.12923
tctcactctgttgcccaggatggagcacactggcatgatctcggctcactgcaacctctg  c.266-2461

.         .         .         .         .         .           g.12983
cctcccaggttcaagctattctcctgcctcagcctcatgagtagctgggattacaggcac  c.266-2401

.         .         .         .         .         .           g.13043
ctaccaccacgcctggctaatttttgtatttttagtaaagacacagtttcgccatgttgg  c.266-2341

.         .         .         .         .         .           g.13103
ccaggctgttctcaaactcctgacctccggtgaaccacccaccttggcctcccaaagtgc  c.266-2281

.         .         .         .         .         .           g.13163
tgggatgacaggtgtgagccacagagcccagccggaaggtaattatttatttattcaggc  c.266-2221

.         .         .         .         .         .           g.13223
tgggtgcagtggcttacgcctatcatccagcactttgggaggccaacacgggcagattgc  c.266-2161

.         .         .         .         .         .           g.13283
ctgagtttgagaccagcctgggcaacatggtgaaaccctgtctttactaaaaaaatacaa  c.266-2101

.         .         .         .         .         .           g.13343
aaaaattagccatgcttggtggcgggtgcctgtaatcccagctactcgggagactgaggc  c.266-2041

.         .         .         .         .         .           g.13403
aggagaatcgcttgaacctgggaggcggagattgcagtgaaccaagattgcaccaccgta  c.266-1981

.         .         .         .         .         .           g.13463
ctccatcctgggcaaaagagtgagactctgtctcaaaaaaaaaataataataattcaatt  c.266-1921

.         .         .         .         .         .           g.13523
tgtttaatagatttaggcctatttagattatttcttcttttgtgagttttagcagatcgg  c.266-1861

.         .         .         .         .         .           g.13583
gtctttcaaggaattgttccagttcatctaggttatcaaatttgtggacataaagttatt  c.266-1801

.         .         .         .         .         .           g.13643
catggtattctttgattatccttttattatccatgggatctgtaatgatgtcccatcttt  c.266-1741

.         .         .         .         .         .           g.13703
cattcctgattttagtaatttgtgtgccctctctatttttcttagttagcctggctagaa  c.266-1681

.         .         .         .         .         .           g.13763
acttgttgatttactgatcttttcaaacaaccagcttttggttttattgattttctttat  c.266-1621

.         .         .         .         .         .           g.13823
tgatttcttgtcttcaattttattgatttctgctctaattttaattatttctttacttct  c.266-1561

.         .         .         .         .         .           g.13883
gcttactttggattaaatttgctgttgtttttctactttcctaagatgaaactcagatga  c.266-1501

.         .         .         .         .         .           g.13943
ttgactttagatctttttctttttcttttttttttttttttttgtgagggagcctcgatc  c.266-1441

.         .         .         .         .         .           g.14003
cgtcacccaggctggagtacagtggcgcaatctcagctcactgcaacttccgcctcccag  c.266-1381

.         .         .         .         .         .           g.14063
gttcaagtggttctcctgtctcagcctcccaagtagctaggactataggcacgcaccacc  c.266-1321

.         .         .         .         .         .           g.14123
gtgcccagttatttttgtatttttagtagagacggggtgtcaccatattggtcaggctgg  c.266-1261

.         .         .         .         .         .           g.14183
tctcgaactcctgacctccagtgatccacctgcctctgcctcccaaagtgctggaattac  c.266-1201

.         .         .         .         .         .           g.14243
aggcgtgagccaccatacccggcctagatcttcttttctaatatatgcatttgatgctat  c.266-1141

.         .         .         .         .         .           g.14303
aaatattcttctaagcaccttttgctgcattccacaagttttgataagttatgttttcat  c.266-1081

.         .         .         .         .         .           g.14363
ttttattttgttcaaaatatttataaagttttctggagatttcttctttgatccgtgtgt  c.266-1021

.         .         .         .         .         .           g.14423
tatttagaagtgtgttttttaatctccaagtatttggggattttccagctacatttctgt  c.266-961

.         .         .         .         .         .           g.14483
tacagacttttagtctaatttcattgtggcctgagatcagacattgtatggtttctagtc  c.266-901

.         .         .         .         .         .           g.14543
ttttatatttaaggggttctgatgcttactatttttcttcagattgtatttttgcccttt  c.266-841

.         .         .         .         .         .           g.14603
agtatgtcttgtaatttttcctcgatagctggacatgaagtactatgtaaaaggaactgt  c.266-781

.         .         .         .         .         .           g.14663
ggtaaacaggcctgtatgaatgtggtggtgaggtggtgggggacaagaatccttctgtag  c.266-721

.         .         .         .         .         .           g.14723
tcctgtgattgggtgtcaatcttttggtgagccggttcctctggactgggaacttcccac  c.266-661

.         .         .         .         .         .           g.14783
acgcttctcagaattttccccttcctaggtgggacaggatgaccagaaggtgctgcagtt  c.266-601

.         .         .         .         .         .           g.14843
tggtatttcacttcccctaggtcagttaagagtctgataaaacactttcaggttaggctg  c.266-541

.         .         .         .         .         .           g.14903
taattcagtaagtttctcctgagggtagaccttgttaagaaaaactggaggctgggcgca  c.266-481

.         .         .         .         .         .           g.14963
gtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcgggcggatcacgaggtca  c.266-421

.         .         .         .         .         .           g.15023
ggagatcgagaccatcctggctaacacggtgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaa  c.266-361

.         .         .         .         .         .           g.15083
aaaaatattatccaggcgtggtggcgggcgcccgtagtcccagctactcgggaggctgag  c.266-301

.         .         .         .         .         .           g.15143
gcaggagaatggcatgaacccgggaaacggagcttgcagtgagccgagattgcaccactg  c.266-241

.         .         .         .         .         .           g.15203
cactccagcctgggcggcagagcaagactccttctcaaaaaaaaaaaaataataataaat  c.266-181

.         .         .         .         .         .           g.15263
aaataaataaataaatgaaaataaaattatattagaagacatagacataggctgctgtcc  c.266-121

.         .         .         .         .         .           g.15323
aagtaattttctccccaaacccagagtaataaggacttccctctgccttctgggcttctt  c.266-61

.         .         .         .         .         .           g.15383
cattcagccatggcaccttggctgagagaacggcccgccctctttactcctcccctccag  c.266-1


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