Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A) - 7151 nt intron 16 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.221184
gtgagtttaagggtttggtaatagaaataaatattctgagaattgacacattagttaagt  c.3316+60

         .         .         .         .         .         .  g.221244
tctttgacattgaggataaatgctgttgtggtttcctctgtctggcacagagtgtttcaa  c.3316+120

         .         .         .         .         .         .  g.221304
acagagataaaattacaaatttcactagtaatcaaagaaatacaataaaaatgagatgct  c.3316+180

         .         .         .         .         .         .  g.221364
tattatctgataaatactaatgcttatcacattctcaaagatgaaaaaaaaatgacccca  c.3316+240

         .         .         .         .         .         .  g.221424
tcaagaattgatgggaatgtggggaagctggaacttttataaactgctgaggtgtctgtg  c.3316+300

         .         .         .         .         .         .  g.221484
tgagttcattagtacaacttttcatgtacaataatttgttaaaatctatgaaaaaatctt  c.3316+360

         .         .         .         .         .         .  g.221544
tccttttaacataacatttgacttagcaaacttattttaggaagtttatctcaagtgaac  c.3316+420

         .         .         .         .         .         .  g.221604
agtcattaagtagacacacaagatgtccatacctattctatttgtaacatcaaaatattg  c.3316+480

         .         .         .         .         .         .  g.221664
aaaatgattcagatgttcaacaatgtttcaggaaattatagtatatggcataacagaatc  c.3316+540

         .         .         .         .         .         .  g.221724
ctggtacattgttaaataaattataggctatgatagcatataaactgataccttagttca  c.3316+600

         .         .         .         .         .         .  g.221784
catatcaataaatggaaaatgttcatgacatattgtttaaggcaggggtccccaatcccc  c.3316+660

         .         .         .         .         .         .  g.221844
aggctgtggacaggtactggtctgtgacctgttaggaacaggaccacacagcaggaggtg  c.3316+720

         .         .         .         .         .         .  g.221904
agcagcaggccggcgacattactgcctgagccctgcctcctgtcagttctgtggcggcat  c.3316+780

         .         .         .         .         .         .  g.221964
gagattctcataggaacaggaatcctattgcgaactgtgcatgcgagggatctaggttgc  c.3316+840

         .         .         .         .         .         .  g.222024
acgctccttatgataatctaataataaatataatgcgcttgaatcatgccaaaaccatcc  c.3316+900

         .         .         .         .         .         .  g.222084
ctcctcaccttcccatcctgggtccatggaaaaactgttttccatgaaaccagtccctgg  c.3316+960

         .         .         .         .         .         .  g.222144
ggccaaaaaagttggggaccactggtttaaagtaaataaagttattaaaataatctgaga  c.3316+1020

         .         .         .         .         .         .  g.222204
attataccattttaatttacaaatactggaagacataataaatagatctagttttctcta  c.3316+1080

         .         .         .         .         .         .  g.222264
attgtaaatattatagaaaatgtatcaaatatttctattataatgaattcaagtttttta  c.3316+1140

         .         .         .         .         .         .  g.222324
attctcaggttaaagaactattaaatctggcagtggagtactaacactcaagcaaatagt  c.3316+1200

         .         .         .         .         .         .  g.222384
gtaatttaatacacacattgctgtttccgcagagatagaacacagcaacataaacttttg  c.3316+1260

         .         .         .         .         .         .  g.222444
aaagagaaaggatataaacaagccatcaagcctatctttgcctttgtaacttttatgaag  c.3316+1320

         .         .         .         .         .         .  g.222504
attttaaaggagcttatagaaatcaaattattagaattcattgactttaaaaaacattta  c.3316+1380

         .         .         .         .         .         .  g.222564
ctcagatgttttagatacagtttccctaaagacagaatgaaaaaaataggaatttttaca  c.3316+1440

         .         .         .         .         .         .  g.222624
ttattccagctctatcttctctgatttttgcttctagccatgtttagctacacactagtt  c.3316+1500

         .         .         .         .         .         .  g.222684
taagaaacctcggaacagcaattccaattcaagtttctattttgttctcttcatttaata  c.3316+1560

         .         .         .         .         .         .  g.222744
cacagttttccaaattctactttaaccatgcttaattagttggagaactgtttaaagctc  c.3316+1620

         .         .         .         .         .         .  g.222804
tgtcgaaacactgaaattccataaccttccttaaaatggttaggaggatgccttgtttta  c.3316+1680

         .         .         .         .         .         .  g.222864
acattttaattgactttaaaactcctgcatcgcatagagttttattttgtatgcattata  c.3316+1740

         .         .         .         .         .         .  g.222924
ctgggtttcattttgcacctaattcatataactggaatttagtttcttatgtccacccct  c.3316+1800

         .         .         .         .         .         .  g.222984
ttctcttggctctacatgtctcttcagtattccaagtcttctttaaagttaatggaaact  c.3316+1860

         .         .         .         .         .         .  g.223044
ctgaacttcatgatgcagattgcaaagggaaatgaacatctgtctacatctgccatgttg  c.3316+1920

         .         .         .         .         .         .  g.223104
gcaaagtatcctgaaaacctgctactagaatgtttattttcttccaaatatcagcatgat  c.3316+1980

         .         .         .         .         .         .  g.223164
ccaggtgtcctgaaacttaaacttttgtgacagagaaagagaggagttataaaaatattg  c.3316+2040

         .         .         .         .         .         .  g.223224
aaaatgattttgaagatgacagtaccactgattatttctgaagttgtgaattagggtcac  c.3316+2100

         .         .         .         .         .         .  g.223284
cctactttccatacagcttaatgcaatagcaaaattaaacttaaaactatcaatgatatt  c.3316+2160

         .         .         .         .         .         .  g.223344
attcaagccagaggcatgatttccatagtaacatattgtgatctattttatagaacatca  c.3316+2220

         .         .         .         .         .         .  g.223404
catgttagtacaacattggctgtttttgacgattgcactaataaggaatccaaataacat  c.3316+2280

         .         .         .         .         .         .  g.223464
tttcttacataataaatgtgtattcattcactaatcagacatttatataatcctattaaa  c.3316+2340

         .         .         .         .         .         .  g.223524
caaggtatcatttcctaaaaccatatttttcattaaaaaatgccacttctggcatttctt  c.3316+2400

         .         .         .         .         .         .  g.223584
gacaatcactgtaattaatgatgtgaaaattatctgcatgatggcatttgaacagtaaga  c.3316+2460

         .         .         .         .         .         .  g.223644
acaattggttaacactgtcagaactttgtatcattctaacaatagcctcatgtttattac  c.3316+2520

         .         .         .         .         .         .  g.223704
tctatttctagtgcgtggctagcatgtgtaacatgtaaaggaaacactacttatattcag  c.3316+2580

         .         .         .         .         .         .  g.223764
ctggatgaacacaaatctttgggttaaataaaggcattaggaattataggtggagaatca  c.3316+2640

         .         .         .         .         .         .  g.223824
ttgaacttttcaaagaaaattaatagtgttgtcttccaagcaagtttgatagtttgtttg  c.3316+2700

         .         .         .         .         .         .  g.223884
agacctttatagaattcttttttagaatggaaactttttctagctggcctaatgtactat  c.3316+2760

         .         .         .         .         .         .  g.223944
gggattctctaagacatattttccttcttaggatcatgatatactggtgtaccatcttta  c.3316+2820

         .         .         .         .         .         .  g.224004
aagctttcaaattatttgttattataatagcatgcaaataatgaataattttaaagattg  c.3316+2880

         .         .         .         .         .         .  g.224064
tgaataattaactttaaaaaacaaggtatatctttacgttttatttaaggtagaggtcaa  c.3316+2940

         .         .         .         .         .         .  g.224124
gctagcgcttcgagaatcatacataatcagccctaacagtatctctattgtagccccctt  c.3316+3000

         .         .         .         .         .         .  g.224184
ctgggttgctcataggtatcttacgtgtcataggaaggaagtgaacagttattggaggaa  c.3316+3060

         .         .         .         .         .         .  g.224244
atagcactcttctgttagtgttgcaggtttagggagtggacagtaactcatactgttttt  c.3316+3120

         .         .         .         .         .         .  g.224304
tggtgttgttcctatttgagtttggaatcaaaggagcactagacatagtaggcagatcaa  c.3316+3180

         .         .         .         .         .         .  g.224364
atttaaaaataaaaacgatcttcattactgatgaaagtcagattagagactatatccttt  c.3316+3240

         .         .         .         .         .         .  g.224424
ttcctgcaggaagacaaattagaagagagaaaaatcaatgggctgatctgcacataattt  c.3316+3300

         .         .         .         .         .         .  g.224484
gctccctacaccctgactccccagattcacagtcagatgagttgttcctcatttgggatg  c.3316+3360

         .         .         .         .         .         .  g.224544
gcatgaatggggagatagcccttaaatgtcactttagagaaatccttccacaggaactag  c.3316+3420

         .         .         .         .         .         .  g.224604
aggatgattatttttacatgtaacaatgacttctatcacctacagatattatcgtagttt  c.3316+3480

         .         .         .         .         .         .  g.224664
aagcttagaattttagacaaccaaatattttaatgagccctgggatttcatttctaccct  c.3316+3540

         .         .         .        g.224700
tattcatttccatctttaaaattataatttataatc  c.3316+3576

--------------------- middle of intron ---------------------
            g.224701          .         .         .           g.224735
            c.3317-3575  tcatactacatcaagggatcaatgtaacaagtggt  c.3317-3541

.         .         .         .         .         .           g.224795
aagatgattcagttagctctgagaggaataaatgaagaaatataagatatagagacagga  c.3317-3481

.         .         .         .         .         .           g.224855
tgagaaaacagaagagaagatgacaggcaactgtttttataaggctcttaatattcttaa  c.3317-3421

.         .         .         .         .         .           g.224915
tgcggtagtttccccttatccatggttttgttttctgcagtttgttactcatggtcaaca  c.3317-3361

.         .         .         .         .         .           g.224975
atgttccaaaaataggtgagtctacagtacaataagatgttttgagagagagagaaagac  c.3317-3301

.         .         .         .         .         .           g.225035
catattcacataactattattggggtatattgttataattgttctattttattttcagtt  c.3317-3241

.         .         .         .         .         .           g.225095
attgttgttaatctcttactctgcctaacataaattaaactttatcatagatatgtatgt  c.3317-3181

.         .         .         .         .         .           g.225155
ataggaaaaagaacagtatatatacacacatatatatgtatgtatatatatgtgtatatg  c.3317-3121

.         .         .         .         .         .           g.225215
tgtatatatatacatatatgtatgtgtgtgtatatatatatagtttaatactatttgttg  c.3317-3061

.         .         .         .         .         .           g.225275
ttttaggaatccactggagatcttggaatgtatctcctgtggataagaggggactactat  c.3317-3001

.         .         .         .         .         .           g.225335
attctttcctggaacaatagatcaaatatgtatagaaaaatcattcatgtgtttaataaa  c.3317-2941

.         .         .         .         .         .           g.225395
attttgttcagtgcttattccagaccagaaactgtatcagtcattagaaatacaaagatg  c.3317-2881

.         .         .         .         .         .           g.225455
aaaggaatagttctccttactgagtggggagacatataagtaaaccaaagtaacaataga  c.3317-2821

.         .         .         .         .         .           g.225515
atatataaatgttgaagcagagtaaacttggggtgttaaggaagcacacggtggcttggg  c.3317-2761

.         .         .         .         .         .           g.225575
aggtgtaggaaatgtaaccatgcctgtggtggcaatgatgtgatggagaaccactgaaag  c.3317-2701

.         .         .         .         .         .           g.225635
tttcccagtaaagaaagaatataagctgaattagccagatactgtagttgaggaagcgtg  c.3317-2641

.         .         .         .         .         .           g.225695
atggtcatgaaataaattttgtattaaaagaaaataaggtatattcagcaatcatgggca  c.3317-2581

.         .         .         .         .         .           g.225755
gttccatgtagctttggtaagtggtacaatgggggagtgctacaaaccaggagggtatca  c.3317-2521

.         .         .         .         .         .           g.225815
gccaagatcacaaatcagtgctgagccaaggactgtaaatgtttctctgaaaatgcagaa  c.3317-2461

.         .         .         .         .         .           g.225875
gtctgtagtaacagcaaattttcaaattcagtgttaaagatccgtaccccaaccaaggag  c.3317-2401

.         .         .         .         .         .           g.225935
agcaactaccttgagataagcactcttttaacctgagtattatttttttgttatggatca  c.3317-2341

.         .         .         .         .         .           g.225995
ttaatggatatcctattcataccctttcaaatgcttttatatctttcacactataaattg  c.3317-2281

.         .         .         .         .         .           g.226055
ccttatatgatattcctacacaaatgcatatttccatcccaattctatctgattctaatt  c.3317-2221

.         .         .         .         .         .           g.226115
tcttattaagtagactgctcttgtataatacattctgatctattaggattatattccact  c.3317-2161

.         .         .         .         .         .           g.226175
tttcagatgctacaaacattcagcaagtactgtacttcttttaattgtcatcaggttata  c.3317-2101

.         .         .         .         .         .           g.226235
agtcttccaacttccagtttaagcttatgccagacaatcttttggaatattcagcactga  c.3317-2041

.         .         .         .         .         .           g.226295
aatttatttttttcttttaggttttggcttttggcatgctaaattattttccatcgttgt  c.3317-1981

.         .         .         .         .         .           g.226355
tctagccttcagtgatttttcaaattttgttaatgttttcaacaaccttattgtgggata  c.3317-1921

.         .         .         .         .         .           g.226415
agggtaactttaatctaatctagtaaatatttattgaaataacaatgagccacagctgca  c.3317-1861

.         .         .         .         .         .           g.226475
cgctctctagaaagtctgaatctcagccctaggggacttttccaaatatgatccttcttt  c.3317-1801

.         .         .         .         .         .           g.226535
gggtgctctgccttagcactaaggatggtgactttcccctgtctcttctattcctatatt  c.3317-1741

.         .         .         .         .         .           g.226595
ctttagagttttctgtaccacttagaaagtaaaaccaggcgacctctggtacccatggta  c.3317-1681

.         .         .         .         .         .           g.226655
caactgaaaacagccaccagagagagaactgtctcaccttcctcggctctatcagggtca  c.3317-1621

.         .         .         .         .         .           g.226715
tctctgataagacagtggccctcacctgagtcagtgcccaaggtgccccccacaacacca  c.3317-1561

.         .         .         .         .         .           g.226775
gcggaggcctcctccactgagcagtcggaccccagagtgctctgtaggagctgtagactg  c.3317-1501

.         .         .         .         .         .           g.226835
ggaagaagggccgggtgtggtggctcatggctgtcatcccaacactttgggaagctgagg  c.3317-1441

.         .         .         .         .         .           g.226895
tgggcggattgcttgagcccaggggttcaagaccaacctaggcaaaatggtgcaacccta  c.3317-1381

.         .         .         .         .         .           g.226955
tctctacaaaaaatacaaaaattagccgggcgtggtggtgggcacctgtagtcccagcta  c.3317-1321

.         .         .         .         .         .           g.227015
ttctatttgggagactgaggcaggagaatcgcttgaacccgggaggcagaagttgcagtg  c.3317-1261

.         .         .         .         .         .           g.227075
agccgagattgtgccactgcactccagcctgggtgacaaagtcagaccctgtcttcaaaa  c.3317-1201

.         .         .         .         .         .           g.227135
aaaaaaaaaaaagaaaaaagactgggaatgcctaggtttacacgatgggttatcactcca  c.3317-1141

.         .         .         .         .         .           g.227195
aagatttgtgtcttttgtggccaatggcagatccaggaaagaaatgaaagttgccgatgg  c.3317-1081

.         .         .         .         .         .           g.227255
ggataggctgggggagagcaatacagatgtgtatgggaaaccccaacccatatatattgt  c.3317-1021

.         .         .         .         .         .           g.227315
aaatagatggactaggctaaacattgttgctgtttcagtcttctgcaaactcagcttttc  c.3317-961

.         .         .         .         .         .           g.227375
cacaataaagctctatctcctgtcggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaaggaa  c.3317-901

.         .         .         .         .         .           g.227435
ggaaggaagggagggagggagggagggagggagggagggagggatggatggggggagggg  c.3317-841

.         .         .         .         .         .           g.227495
aaggggaaggggaagcacataaatatgctgggaccttcatattgctatagggcacccctg  c.3317-781

.         .         .         .         .         .           g.227555
cttaatggaaccctcctcgcatctccaatgcaaacagccccatggcggagcaggcagcag  c.3317-721

.         .         .         .         .         .           g.227615
ccactctggtatttgtgtgtttcgcagtcctacagtgtgtttcctgtccttagagaacaa  c.3317-661

.         .         .         .         .         .           g.227675
ggatttccagccatgtgcctaatcacctccactccctatcttattttttaaaaacctctt  c.3317-601

.         .         .         .         .         .           g.227735
tgtagctgcttctctttgccctcacaatccttcatgcatagaagtcctgcttatctaaaa  c.3317-541

.         .         .         .         .         .           g.227795
cttctgttgtgtaaattcctcattgctgataacaaatgtctccaaaatttagcagcttaa  c.3317-481

.         .         .         .         .         .           g.227855
aacaataaacatttataatttctgtaggtcagaaaataagaaaattttccattcaagatg  c.3317-421

.         .         .         .         .         .           g.227915
ttggccaggtgacagatttaccccttggtggtagtttactgacccttagtctggtgtgtt  c.3317-361

.         .         .         .         .         .           g.227975
tagtgtttaacaagcaaacaagttacatagaggaaacatagttacttttctgttttggag  c.3317-301

.         .         .         .         .         .           g.228035
aaccgcaaggactttctcttagaccttctaacaaaaggacactatgaaaagcaaaagaag  c.3317-241

.         .         .         .         .         .           g.228095
aactaaaacaaacatctaaacattctttattatgaatgatactttcttatactcaataat  c.3317-181

.         .         .         .         .         .           g.228155
aaaagcaatcaaccggtatttacattatttcaattttaaaaatatgaaatgtatccttaa  c.3317-121

.         .         .         .         .         .           g.228215
tcaaaagagtagattggtatagtttatgtaattaaataatatgataggaaagcagttagc  c.3317-61

.         .         .         .         .         .           g.228275
aatgattcttcaccaacttgtgaaatgtaactttgttttttttttttcttttcatttcag  c.3317-1


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