Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A) - 6185 nt intron 19 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.231904
gtattgttatttttaactaatgtcctttcagaattggcttagggcttcatttggacattt  c.4251+60

         .         .         .         .         .         .  g.231964
tttgagtttgcagaattctgtgacagaattctccctctatattgattaaacagggcattt  c.4251+120

         .         .         .         .         .         .  g.232024
tttcttaatataatattatgtgtacaagcctccctctttgtatgtcacttgtatttttcc  c.4251+180

         .         .         .         .         .         .  g.232084
agtataatcatatattgaaactaagttggtataatttatttcataagacttgtttttttt  c.4251+240

         .         .         .         .         .         .  g.232144
ccatttatcatgtatccttaaatattttacatgaagttgactttcattaactgtgtacta  c.4251+300

         .         .         .         .         .         .  g.232204
tcatgttatttggacacacaataattatttaaccagtccacactcagttgatattgtatt  c.4251+360

         .         .         .         .         .         .  g.232264
gtattaattcttttggaaatataaataacattgataaaacttcttatatgtacatttcat  c.4251+420

         .         .         .         .         .         .  g.232324
atacatttctacttcaaaaatctgaagaattgaatttatcacagcttataacaaaatgaa  c.4251+480

         .         .         .         .         .         .  g.232384
ttatgaatatgttcaaagttttgaatatacagtcatatattgccttctagtaattcatcc  c.4251+540

         .         .         .         .         .         .  g.232444
cccagctagcagtagtgagaataattatcatagctaaaagttactgaggctttactgtgt  c.4251+600

         .         .         .         .         .         .  g.232504
acgtgaactaattcatctgatacatacagcaatcctagaggataggaggctcttgttctc  c.4251+660

         .         .         .         .         .         .  g.232564
tccagtttacagttgtggctgatatacctctctgcccattttaccagcatccaggtggcc  c.4251+720

         .         .         .         .         .         .  g.232624
aatagcagaagctgatggaaggatgtcaaccgaacaagttcttctgtgtatttggctgtt  c.4251+780

         .         .         .         .         .         .  g.232684
cagtgcctcctctgagagagatgctcttctctgggcattagcataagataaaaagatctt  c.4251+840

         .         .         .         .         .         .  g.232744
tacactttatacctactcccatagatctagccacatttttctttccatgaattcctagtt  c.4251+900

         .         .         .         .         .         .  g.232804
cctgatccttccatctttttttttcatgcccttggccaatatttccaagccactgccata  c.4251+960

         .         .         .         .         .         .  g.232864
ttgtccaggtacattttaccttgagacacgtctctttccacacaacatgggtgaccaggt  c.4251+1020

         .         .         .         .         .         .  g.232924
gaactgcctgaagttctgcccactaagaggatttcttcgctctgctgtttcacagggtca  c.4251+1080

         .         .         .         .         .         .  g.232984
tctctgacaagggttttagagcaacagctaccatttagacttgcagccacataccaagac  c.4251+1140

         .         .         .         .         .         .  g.233044
atcctatctgtaaactaaattctgctttttttccacattctttcagctcttaagggacct  c.4251+1200

         .         .         .         .         .         .  g.233104
cccatgggtcataggtatgagctgaggttgagccaccagtataagaatggtggatgtcat  c.4251+1260

         .         .         .         .         .         .  g.233164
gggggcctgaaccacctgcttgcacaatgtattacggcttttggctctgcttatacccaa  c.4251+1320

         .         .         .         .         .         .  g.233224
tctcagacatccacttccattttatgatgaatttctgttgggcccttctaacctcaagac  c.4251+1380

         .         .         .         .         .         .  g.233284
ttggctgagacaattccaagattataaaaaagtagctctagctgcatggctatttggtgt  c.4251+1440

         .         .         .         .         .         .  g.233344
tccatgaccagatgttctgtttttactgaagcctgaaagcatgctagggccatttagcaa  c.4251+1500

         .         .         .         .         .         .  g.233404
atggtatatagtttccattacatgttatgcctttgttccaagctcttggggtctatctgc  c.4251+1560

         .         .         .         .         .         .  g.233464
cctgtgattctctttctatgtgtgccttgcaacattttttcccacaatgcttacctctag  c.4251+1620

         .         .         .         .         .         .  g.233524
tgctgtaaaaattactacatgttatgtcccaagtggctcatctgcctgtaccacaggctg  c.4251+1680

         .         .         .         .         .         .  g.233584
gacctggtgcagagccctttccgcctctgggatacactcaaaactggcagcattccatat  c.4251+1740

         .         .         .         .         .         .  g.233644
tactcagtaaatttctcagaacagtattctcaaatgtggaatatgctcccttcagaatgt  c.4251+1800

         .         .         .         .         .         .  g.233704
gaagaggtcaactagacattttgtttccttcttagtggtggtagaagcaaggtgcaataa  c.4251+1860

         .         .         .         .         .         .  g.233764
tttgtcctttattttggaggggatatcctagcatgtctcaggccacttgaactcctaaaa  c.4251+1920

         .         .         .         .         .         .  g.233824
acttcactgatatggtagattccttaatcttcataatattgctgtctcactttctagaac  c.4251+1980

         .         .         .         .         .         .  g.233884
acatatgtcttacctctgcatacctaccatttcttgtttgtctgattcatttaatatgat  c.4251+2040

         .         .         .         .         .         .  g.233944
gctatcgatataaagaatactgtcaaggtggcatttatagtttgtcttaaattggtgatt  c.4251+2100

         .         .         .         .         .         .  g.234004
aatcaccctcagatttcctttgtctttcttcagtgcattgatggcgaccagcaagatcca  c.4251+2160

         .         .         .         .         .         .  g.234064
tgcattgtccttataattactagtttccccagagtagtccttgtaattactaattccacc  c.4251+2220

         .         .         .         .         .         .  g.234124
aaaccagtgaattaccttctactggtaactcatcgcagttcaccactaatggaagtttaa  c.4251+2280

         .         .         .         .         .         .  g.234184
gcattgcaccactagggcatgctgtggactgttagtactctacctgctgtctatgatgag  c.4251+2340

         .         .         .         .         .         .  g.234244
atcattgtaaaccagcaagtggatgatggagctccaaaatatcattttagagtctccttc  c.4251+2400

         .         .         .         .         .         .  g.234304
ctagggccagtcctgttacgactatcttagggcaaattcccccggaagcagactcttggt  c.4251+2460

         .         .         .         .         .         .  g.234364
agaggactgagtacaggaggtttattgggggaactctttcagaaacaacaaatgtgaagt  c.4251+2520

         .         .         .         .         .         .  g.234424
gataaagtatgtaggattgagcagcaaagaagctgaactgtgatgcaatagtggaagcag  c.4251+2580

         .         .         .         .         .         .  g.234484
cctcagcggattccgtgggtagttctggagctgaaatgaccctcttagcttatctcaaat  c.4251+2640

         .         .         .         .         .         .  g.234544
taagctaggaagtcagacctttgtaccctagagtatttgtgtcctcgggctggtgtaaca  c.4251+2700

         .         .         .         .         .         .  g.234604
aattaacataaactgagtgtcttaaaacaacggaaatttaggtgttagtacagccaggtc  c.4251+2760

         .         .         .         .         .         .  g.234664
ccccacaggctctaggagacaattcttctcttctacctacctgtggctcctggtgttcct  c.4251+2820

         .         .         .         .         .         .  g.234724
tggcttgtggcaacataactctaatatctgctgcctctgtcttcacaagtcctactctgt  c.4251+2880

         .         .         .         .         .         .  g.234784
gtctctgtctcctctgggtctgtgtgtccgtctcatttctcccataaaaataccagtcat  c.4251+2940

         .         .         .         .         .         .  g.234844
tggattttaagctaacctgaaatccaggatgacaactaattaattacatctgcaaagacc  c.4251+3000

         .         .         .         .         .         .  g.234904
ttatttccaaacaaggtcttattctgaatttttgggagacactatacaatccactactaa  c.4251+3060

         .         .         .     g.234937
taggtttgccatttttttctaagcctttttagg  c.4251+3093

--------------------- middle of intron ---------------------
               g.234938       .         .         .           g.234969
               c.4252-3092  agaccagaacccatgtacaacacacaatttta  c.4252-3061

.         .         .         .         .         .           g.235029
ttttctatactgatgaaaaagaagagccaataaataatttatgattacttatttttcatt  c.4252-3001

.         .         .         .         .         .           g.235089
aatctgtctacgtgttcactcatttgcaattatctcatgatgaatacacaactggcataa  c.4252-2941

.         .         .         .         .         .           g.235149
tatatatattttgacttaaacaggttagtctaccgatctggtataccatgggatttaagg  c.4252-2881

.         .         .         .         .         .           g.235209
taaagttagttgtaactttcatgtggtctttgccatgttgtatctcatttatactcaatg  c.4252-2821

.         .         .         .         .         .           g.235269
ttttattttgttgtttttactattctctggctttataaactattctttctttgtaaaaca  c.4252-2761

.         .         .         .         .         .           g.235329
cagttttgatttatctattacttatattatagtagttgttgttctaagaaaaaaataagg  c.4252-2701

.         .         .         .         .         .           g.235389
tgagaaatattatttataaaatacagccttagaagtcaacctgtttgttcatattccaca  c.4252-2641

.         .         .         .         .         .           g.235449
tctcccaattattagctgtatcacacgtctctctgcttctggttttattcatctgtgaaa  c.4252-2581

.         .         .         .         .         .           g.235509
tgggaaaaccatttttgctcacctacctgcttaaagagcctgataaatattgacacatta  c.4252-2521

.         .         .         .         .         .           g.235569
ttattagtgattattattaatggtgtggaactacattatactttataaactagctatcat  c.4252-2461

.         .         .         .         .         .           g.235629
ttaatggggcaggaaaataaatatttttattattgttgttgttatttaaaaggctgttcc  c.4252-2401

.         .         .         .         .         .           g.235689
ttatggctgaactggaataaggacatagatatatcaccttattctcttttttatttttat  c.4252-2341

.         .         .         .         .         .           g.235749
ttctttgagacagagtctcgctctgtcacccaggcttgagtgcagtggcgcaatctcagt  c.4252-2281

.         .         .         .         .         .           g.235809
tcactgcaatcttctcttcctgggttcaagcaattcttgtgcttcagccttccaagtagc  c.4252-2221

.         .         .         .         .         .           g.235869
tgggactacaggtgtgtgccactacacctgactaattttttttttaatttttatttttag  c.4252-2161

.         .         .         .         .         .           g.235929
tagagacagggttttgccatctttgccaggttggtcttgaacccctagcctcaagtgatc  c.4252-2101

.         .         .         .         .         .           g.235989
cacccgcctcggtctcccaaaatactgggattacaggcatgagccactgcactgggccta  c.4252-2041

.         .         .         .         .         .           g.236049
ccttattctcttttgaactctctctcctgtgcaaatattctctgttcaaggaaatgaaat  c.4252-1981

.         .         .         .         .         .           g.236109
caaaagtagcagaacaaagtccaattttttaccttctcaatgattaaatttgtatctgaa  c.4252-1921

.         .         .         .         .         .           g.236169
ctgacctgagtatgtcttgttataatctttgtaaataaatagccaaaattcccagggaaa  c.4252-1861

.         .         .         .         .         .           g.236229
atctactataaaaataactagtaagaaacctttgcctaagaatgagacaggggggatacg  c.4252-1801

.         .         .         .         .         .           g.236289
taaaagtggtgatgatgtaggattcattgtgggggatcaagctgctgtagaatttttcct  c.4252-1741

.         .         .         .         .         .           g.236349
acccctttgaagacttatttcatgaaaaactttcaattagatagattttataagacttat  c.4252-1681

.         .         .         .         .         .           g.236409
aaattgactctatgtacatgataaagacaaagtctatccaagtgataattttatgctgca  c.4252-1621

.         .         .         .         .         .           g.236469
agttctggggccaataatgtatttttaaaataatgtaatttataataatcatctgtaaag  c.4252-1561

.         .         .         .         .         .           g.236529
aaggaaaagccttttcaaaataaatattagtgtagatttcttctttcttattttatttca  c.4252-1501

.         .         .         .         .         .           g.236589
tcgtgggttcttgctacaaagaatattttgcttaaaaaatagttgtacttcctaaattaa  c.4252-1441

.         .         .         .         .         .           g.236649
ataagaaatagcttcatgtactttatcctaaaaacaataccattttctaaaaatttacat  c.4252-1381

.         .         .         .         .         .           g.236709
tgaaatctaccaggattattctaaaagggatgaatattacagcaatattcataagtttaa  c.4252-1321

.         .         .         .         .         .           g.236769
ctcagttcaaggtttattttacttagaaaattttaaatcacatttcacagaaaagtttgt  c.4252-1261

.         .         .         .         .         .           g.236829
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.         .         .         .         .         .           g.236889
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.         .         .         .         .         .           g.236949
ttattcctagagttttagaatctttaaaaacacctttatttctgaatgttattgaaacac  c.4252-1081

.         .         .         .         .         .           g.237009
tgtattctacattccaatctcactgctttttagaacaactcatgtaacttacgaaatttt  c.4252-1021

.         .         .         .         .         .           g.237069
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.         .         .         .         .         .           g.237129
tctagaaaactactccaaatgttactgaactttacatttatctgtatttatatttatgga  c.4252-901

.         .         .         .         .         .           g.237189
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.         .         .         .         .         .           g.237249
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.         .         .         .         .         .           g.237309
tgtacctacaacctaaacaaatttacatggttgcttttgatcacttcaaattataatgac  c.4252-721

.         .         .         .         .         .           g.237369
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.         .         .         .         .         .           g.237429
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.         .         .         .         .         .           g.237489
aaataacgtaactgtttgatctaatctttatatgtttgtttatataagaaagatgattga  c.4252-541

.         .         .         .         .         .           g.237549
gaattgacttaacgtggatgctcagtaatatgcttaatgtttaattttttcccctttttc  c.4252-481

.         .         .         .         .         .           g.237609
ttctgtgactttttttcataaagaaaatgatagtatcgatttaacatagcaacggcattt  c.4252-421

.         .         .         .         .         .           g.237669
ctttctgtcctagcaccatcaaatagcttgggtattactgctctgggttacttttggcca  c.4252-361

.         .         .         .         .         .           g.237729
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.         .         .         .         .         .           g.237789
tctaccattggtgacaataaccataccaccatgctgctttatgaggcaataacttggttt  c.4252-241

.         .         .         .         .         .           g.237849
tctcatttatccactcaggaactggattattacctcataaaacagtgtgattgtacaata  c.4252-181

.         .         .         .         .         .           g.237909
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.         .         .         .         .         .           g.237969
atggtggttggcaataattccctctgtctgaattcatggaactttgactgccaaggttat  c.4252-61

.         .         .         .         .         .           g.238029
attttcacactgattacctattatctttctttctttctttctttcttttttgccttgaag  c.4252-1


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