Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A) - 7943 nt intron 22 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.331374
gtaaatgagaaatcataaactttaatatttttaagaatttagtaggtgcctggtactgag  c.4758+60

         .         .         .         .         .         .  g.331434
gtaaatgcttctgttttcacactgaatcttcattcaaaccttgtaaggtaagtactatta  c.4758+120

         .         .         .         .         .         .  g.331494
ttatccccattttgccaatcaagaaaatgaaacttacaaaagtaatgtgacttgccctca  c.4758+180

         .         .         .         .         .         .  g.331554
gctaaaatagcggagctaacttttaaaccatcatggtctgactgagaatctgtgggctta  c.4758+240

         .         .         .         .         .         .  g.331614
acaaccaaaatgccaccttataatgaagattaaaacttttaaataaatttaaagagatct  c.4758+300

         .         .         .         .         .         .  g.331674
atttttatttttcttagtagcaaaaaatcatgtccccttttcttccttccctgtctttct  c.4758+360

         .         .         .         .         .         .  g.331734
tttttcattgtttcaccagcaaatatttaagtggctatcgggtactatggtactgggcgt  c.4758+420

         .         .         .         .         .         .  g.331794
tgcagactaccatagtttcaaagttaaatatgaccatgcccctgcaaaggatacagtaaa  c.4758+480

         .         .         .         .         .         .  g.331854
ataatcaatttaaaattcttataaattgtatcaaaataaagatttaggattctatgtatt  c.4758+540

         .         .         .         .         .         .  g.331914
ataggaacataaaataaagaaataaattgttttctgagttgtcaattttctctggaaatg  c.4758+600

         .         .         .         .         .         .  g.331974
tgatatttaactgagatacaaatcaatgaagaaaagttggtcaggacaagattatatgtc  c.4758+660

         .         .         .         .         .         .  g.332034
tgtatttgagggtgtatatttcaggtggggcagtacaggggagattctgatctccacctg  c.4758+720

         .         .         .         .         .         .  g.332094
ggaaggtgctgagcataaagtttccaggcaaagtgagcagcaaatattaaggaaatagca  c.4758+780

         .         .         .         .         .         .  g.332154
aatattaagtgcctgaggtggacgagaacatggcacattcagtacactgagatgaatctc  c.4758+840

         .         .         .         .         .         .  g.332214
ttatggctgggaacagagacaaagggaaaggtggtagattgaaaagctgggtagaaacca  c.4758+900

         .         .         .         .         .         .  g.332274
agtcatttaagaccttgtaagcaaatgtgaggatatgaatttttcctaagggcagtgaga  c.4758+960

         .         .         .         .         .         .  g.332334
aagcactgaacagttgtcttcacttgagttgaacaaatatcagtgagcatttgatattag  c.4758+1020

         .         .         .         .         .         .  g.332394
gtattgtattaagcatgtgagatgagtaagagaaatgagtaagactaagtaaaatatatt  c.4758+1080

         .         .         .         .         .         .  g.332454
agctttccattttctcagttcttcaacttaaaactgatgatctaaatcacacgttatgct  c.4758+1140

         .         .         .         .         .         .  g.332514
tgacaaataaatgttttacattttattggtaaagcagacacaacgttcaccctctgtatc  c.4758+1200

         .         .         .         .         .         .  g.332574
caagttgcgtctaggatcatggactgagtgatctgactgaggatctcagcctcatgaacc  c.4758+1260

         .         .         .         .         .         .  g.332634
ctggagatccattgaccttagagagaaaaggcagggcctattgtaccaagtgtatctgag  c.4758+1320

         .         .         .         .         .         .  g.332694
gaccctgccagactcaaaaagcaggccaaagtcctcctgctttatgaagctgggagagcc  c.4758+1380

         .         .         .         .         .         .  g.332754
gcacagtggccactcgaaggaccagggacagaaaggctccctcctcatgacttgacaggg  c.4758+1440

         .         .         .         .         .         .  g.332814
ctctgctaactccctggctggtgcacagcaggtcctcagacacaaagatttctgagcgtc  c.4758+1500

         .         .         .         .         .         .  g.332874
ccctagtaatgcagcttcttaaaggatgccagcaggtgggcagtgagtaagcaaaaggaa  c.4758+1560

         .         .         .         .         .         .  g.332934
atagcatcacacctaagcagatcctgcagccagagggaaaggaagaagcagcagctatcg  c.4758+1620

         .         .         .         .         .         .  g.332994
cagaaggcaagacagatggcaactgaaaaaaatttttaaaaaatcagctgaagttgattc  c.4758+1680

         .         .         .         .         .         .  g.333054
aattacataatggaagatattattttttatttgaaaactttaagtagattaattagagga  c.4758+1740

         .         .         .         .         .         .  g.333114
gagacactgagcctcagattagtaggtcagaagattaagttgaagaaatctctcaaaata  c.4758+1800

         .         .         .         .         .         .  g.333174
cataaaaatgtgacaaaaacaagaaagttagatactactactgtcactaagaagcgaatc  c.4758+1860

         .         .         .         .         .         .  g.333234
ggaaggagaacaaaaagcacatgctcaagaaaaagagggataacataaaatgatgaaaca  c.4758+1920

         .         .         .         .         .         .  g.333294
aaaaataggagagaatatctgatttaagagggaatttagtataaatccattgaaaagact  c.4758+1980

         .         .         .         .         .         .  g.333354
catcaatttcctgtcaagattaagcaaaactaatacttctatgagacctctttgtgccag  c.4758+2040

         .         .         .         .         .         .  g.333414
gcattattctaagtggtctctctatacatcagtttgtacacttacatacacacatatgcc  c.4758+2100

         .         .         .         .         .         .  g.333474
tatacacacacacacacacacacacacctacacacgcacataaactcatttgaacttttc  c.4758+2160

         .         .         .         .         .         .  g.333534
aacaactctgtgaggtagatactcttcatattcccattttacaggtgaggaatctgggcc  c.4758+2220

         .         .         .         .         .         .  g.333594
acaggtaagttaattttccccaagtcacaacactaataagtgaccaagccaggttataaa  c.4758+2280

         .         .         .         .         .         .  g.333654
cacaagcaattgagctccaaagaccatgattttagctacagtgctatactgcttttcaac  c.4758+2340

         .         .         .         .         .         .  g.333714
atgaaagaaagatggttgttgatatccataaattcagaaaaaaaaaatccatctctgcac  c.4758+2400

         .         .         .         .         .         .  g.333774
caggttggaaagaaatatttcagtaagtaatctagccaaaaggaaaaataacagagtcag  c.4758+2460

         .         .         .         .         .         .  g.333834
aaatataaaaagaagaagcatcagtgaataataaatctagtaatattaagttatgcctaa  c.4758+2520

         .         .         .         .         .         .  g.333894
atatttaatgatagagtgactagaactctgttttacagtgccaaatgagaatctttgaaa  c.4758+2580

         .         .         .         .         .         .  g.333954
tagaagagaagtatagcaaaggcaagaaaaaaaacgtgaataatcatttgttgctaaaat  c.4758+2640

         .         .         .         .         .         .  g.334014
tagtaagatttgaaggagaggaaagatgagtgaattaaaagttctgaagataccagctta  c.4758+2700

         .         .         .         .         .         .  g.334074
gtggcggggtgtgggtggaataagggaatagattatactgacgttttgttttcgttaaat  c.4758+2760

         .         .         .         .         .         .  g.334134
aaatagggcaaatgtttgatttcaaatgttatagaaaaataagttactactaataaaaag  c.4758+2820

         .         .         .         .         .         .  g.334194
tgctcttcaggacatccaaattaacaaggttaaaaaggacagcaaatgctaagttaaaaa  c.4758+2880

         .         .         .         .         .         .  g.334254
atcaacaaaaatcagaaaaagaaaggggagagtacagtaaaatagaagactgtcaatgag  c.4758+2940

         .         .         .         .         .         .  g.334314
aaagaaaaatctggctctgctttttccccttcaacctgttagtatctggagatatttaag  c.4758+3000

         .         .         .         .         .         .  g.334374
aagaagccagatggaaaaaaaactaatcacaggaccacttgtttatagagctttaaagta  c.4758+3060

         .         .         .         .         .         .  g.334434
tacaaagtgagttcctgttaatgatctcatttcattcttgaagtagccccttgaggttga  c.4758+3120

         .         .         .         .         .         .  g.334494
ttttgttttcatccctgctttagatgaagtggcttaactacggtcatagagtggtttagg  c.4758+3180

         .         .         .         .         .         .  g.334554
gatagaactagcactgaattcaattatttgaatagcactgaattattttattcaatgaaa  c.4758+3240

         .         .         .         .         .         .  g.334614
ctttgctaagaatttattggacttcacagttatgcactgggaacacagaaatgaacagaa  c.4758+3300

         .         .         .         .         .         .  g.334674
tgacactcattggaattctggccattggttgttcatcacagattttgagtatttatagcc  c.4758+3360

         .         .         .         .         .         .  g.334734
acccccctaccaaacatgggacagtcattggagaattaatccaaaaatgatttccccaag  c.4758+3420

         .         .         .         .         .         .  g.334794
tctgaagcatgactgccatctcttttgacatgtggtgttgctatttctaaaggatgcgat  c.4758+3480

         .         .         .         .         .         .  g.334854
accttaagactctgtaggataggagggtaaaggggtcaaactgcttaacggagaatggct  c.4758+3540

         .         .         .         .         .         .  g.334914
gccaggaaactcatctggcaggtctagttgttttcatatcctttacggtgatcacctgga  c.4758+3600

         .         .         .         .         .         .  g.334974
caggctggtgcaaagcgtggtaacagaattcagggaaacattcacagggcatttgcccat  c.4758+3660

         .         .         .         .         .         .  g.335034
catttccgcccccttacccttctcattcacacaattgcttagagtactcgtcactgctat  c.4758+3720

         .         .         .         .         .         .  g.335094
tagttttcccagttgctctgtccctaccctgtatagccaaaccctaagctgtatacatag  c.4758+3780

         .         .         .         .         .         .  g.335154
tccgcaggtgccagccaagtattaataaaattgttaaagccactgggcgtggtggctcat  c.4758+3840

         .         .         .         .         .         .  g.335214
gcctgtaatcctagcactttgggaggctgaggcgggtggatcacaaggtcaggagttcaa  c.4758+3900

         .         .         .         .         .         .  g.335274
gaccagcctggctaagatggtgaaaccccgtttctactaaaaatacaaaacttagctggg  c.4758+3960

         .    g.335286
cgtggtggcagg  c.4758+3972

--------------------- middle of intron ---------------------
                                    g.335287      .           g.335297
                                    c.4759-3971  tgcctgtaatc  c.4759-3961

.         .         .         .         .         .           g.335357
cccgctactcgggagactgaggcagagaattgcttgaacccgggaggcagaggttacagt  c.4759-3901

.         .         .         .         .         .           g.335417
gagccgagactgagccactgcactccaacctgggtgacagagtgagaccttgtctcaaaa  c.4759-3841

.         .         .         .         .         .           g.335477
aaaaaaaaattgttaaagccaagttgggggctaaagggagtgaggaaggtttaatgatgt  c.4759-3781

.         .         .         .         .         .           g.335537
ctagtaagtaaatttttatctgaaataatctctctccataaggtaaaactgcttgagttt  c.4759-3721

.         .         .         .         .         .           g.335597
tcaggaaagtgacaattattttttaaaatacaagatatgggttgagcaggatggccttag  c.4759-3661

.         .         .         .         .         .           g.335657
gatctagctgagaaaatgtaatcagatgcattacactatgtgctcacgggccatgaggct  c.4759-3601

.         .         .         .         .         .           g.335717
ctctatatatgaaacaacgagcttatgctagcaaggactgtgtccttccttacttccaat  c.4759-3541

.         .         .         .         .         .           g.335777
gaatttatactctaaaacaggtactaaacatattttctaaatttataatgaaagccccac  c.4759-3481

.         .         .         .         .         .           g.335837
tcatttttagacaaagaagtgttaaaactgagggatggtgaaaattttgaatactcttct  c.4759-3421

.         .         .         .         .         .           g.335897
cttatttgctctctttttccaaagtaatatcaatgcagcttcttgtatgaagttagagct  c.4759-3361

.         .         .         .         .         .           g.335957
actctgggttttaaaaagtatagaagtttatttcatatgccttctattggcattacattt  c.4759-3301

.         .         .         .         .         .           g.336017
atttatattttaaatactttgggtaccactttaagtcagtttttctcctttaatctttaa  c.4759-3241

.         .         .         .         .         .           g.336077
atgcggacgagattatctagtgaatactttttatactcatcacacaagtaattatgtact  c.4759-3181

.         .         .         .         .         .           g.336137
tagtgtgtctgtcttatcagactgtatgatccagtgagggcaaagtctatgaatcttttg  c.4759-3121

.         .         .         .         .         .           g.336197
cccacaggtacttcctcaggacttagaacagtctttggaacatagtagatgcccagtaaa  c.4759-3061

.         .         .         .         .         .           g.336257
taaatgaccattgacatattacctggctgattgactcaataactgttggtaggatactac  c.4759-3001

.         .         .         .         .         .           g.336317
tactcataactgaagaaaattatccatttttctggcttacaacgtctagctttgtaatga  c.4759-2941

.         .         .         .         .         .           g.336377
ttacacagatattttgtgatgtttgttttatttttttttattttgaaaaaattagagaaa  c.4759-2881

.         .         .         .         .         .           g.336437
aagtcttgctgttttgctcaggttggtcccgaactcctggcctcaagcaatcctcccacc  c.4759-2821

.         .         .         .         .         .           g.336497
ttggcctctcaaagtgctaggattacagacatgagacaccatgcccagccttgttcaaat  c.4759-2761

.         .         .         .         .         .           g.336557
ttgtctgtttttcagataatttgatttttatcaggaaaaaacgagatgcttatttttaaa  c.4759-2701

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ttgtttttactgaattcattcaaaatagccaaattttgaattatgaagagaatttcaagg  c.4759-2641

.         .         .         .         .         .           g.336677
aattttaaagtagttatctagcacatatttataaaataacttgaagtcattgtgtacttt  c.4759-2581

.         .         .         .         .         .           g.336737
gctctttttaaaatatcttaataaaattgagtattaaattccttacaaaacaatttaata  c.4759-2521

.         .         .         .         .         .           g.336797
caacgtagaggctatagatataaaaatgtatttggtttgtcatccaactatccgaagcat  c.4759-2461

.         .         .         .         .         .           g.336857
tctattgaataaatgtttagggaaagggagattcttcatagtacataaaattggaaatgt  c.4759-2401

.         .         .         .         .         .           g.336917
gtttgtatattacaaactgggcacttgccattgttaaaagatacaataaagaaaagttaa  c.4759-2341

.         .         .         .         .         .           g.336977
ctgcaacttttaattacagtttttattgttatctccaacaattttctataattttcccat  c.4759-2281

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tcttcacttaattaaattcaattttgaatatacttgatcagataatattttagtgaccag  c.4759-2221

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taatgatctatgtttatcccttaaatattctatgttcagtgacattaacaggaaattcac  c.4759-2161

.         .         .         .         .         .           g.337157
atcatattctgggcttacttggaaggaagctgtgaaaatgaaagctttaaaacaattctg  c.4759-2101

.         .         .         .         .         .           g.337217
aatagcatctattgaatgtgtctgatatgttccaaatagaaagaacaacatgcataatat  c.4759-2041

.         .         .         .         .         .           g.337277
gacaccagaagtcatcacagaattgttctttcaacattgatggggggaagtaatcttaaa  c.4759-1981

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atagtcttcaaaaaatgatattctaaattgctgtaagtataaagtgagtttgtcatgctg  c.4759-1921

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aggctgtaggtaatgtacttgaatttgtctccaataaacttgatttctgatgtagagaac  c.4759-1861

.         .         .         .         .         .           g.337457
tattaatgcttcagattgttgccaaacaaaatatgaagaaccacttattcagacacctga  c.4759-1801

.         .         .         .         .         .           g.337517
tctttagaatgcagcatcgtttgtaacaattttaacgctaactaagtacactttgatgag  c.4759-1741

.         .         .         .         .         .           g.337577
acagcatttaataaaatgctcattaatttcatcattagcaagggtatgctaagaagtaag  c.4759-1681

.         .         .         .         .         .           g.337637
ccagtttcttatgtcacgcccaattagcatcccatgctagtaatcccattagtattgttg  c.4759-1621

.         .         .         .         .         .           g.337697
aattcactaatggaaaaactaatgggcatgctaccagggcacattaattgggcacgacac  c.4759-1561

.         .         .         .         .         .           g.337757
cagttctggttttaattattaaactacgataatgaaatgtgtgtttgtaaaatattaaaa  c.4759-1501

.         .         .         .         .         .           g.337817
tgttgaaatagggttgaagaaaataaaagggtgtgtagacaaaacagatataaggaaagt  c.4759-1441

.         .         .         .         .         .           g.337877
caacctacaaaaatacgaagactagaacttgccagatggtcatgtttctagctgatggag  c.4759-1381

.         .         .         .         .         .           g.337937
ttgtctgtaaaagttgggatattgtccatgtgagagacaacccactcatactcatgggaa  c.4759-1321

.         .         .         .         .         .           g.337997
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.         .         .         .         .         .           g.338057
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.         .         .         .         .         .           g.338177
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tttagaagttgtaatttcttttttatttttatttaatagtagtactagtagctgttggtg  c.4759-841

.         .         .         .         .         .           g.338477
acaaagttgggatatctttcacttagtcttattcacttaacacagaaaatgttactatag  c.4759-781

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gtaaccaaggctactataacatactggaaaattgtttacttttctcgaaagtagtgagat  c.4759-721

.         .         .         .         .         .           g.338597
ggcaggtgtttcttctatttctctttctcagtttttttttttattcttacctcctatttg  c.4759-661

.         .         .         .         .         .           g.338657
ctaaactctgttcttaatatctgccatttcctatgtcttatcacttaggaacatgttttt  c.4759-601

.         .         .         .         .         .           g.338717
aactattatatgattaccttagccagaactataattattggattttaactacaaagcatt  c.4759-541

.         .         .         .         .         .           g.338777
gtgtactacatttaactccacccttatgtttaatgtatcacaactggctagtttttaagg  c.4759-481

.         .         .         .         .         .           g.338837
tgaatgtcattcccatttgttattgataattttgtgaagataagagtgacttgtctgaca  c.4759-421

.         .         .         .         .         .           g.338897
tctctctatcttcagaactcattttgagtggtattttatgagttttaaatttttctcttc  c.4759-361

.         .         .         .         .         .           g.338957
tttttcatatttatgccatgaaacttaaagtctaaaattttagaatagaaaattctttac  c.4759-301

.         .         .         .         .         .           g.339017
ccttctgatgaatagctatattcatcagaaaatgcaagtgactttgtaagaaattcttac  c.4759-241

.         .         .         .         .         .           g.339077
tgcaaaggtgagacctttacagatctgtacactgtggtgcacagggaagtattaatacat  c.4759-181

.         .         .         .         .         .           g.339137
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.         .         .         .         .         .           g.339197
atgcatgcttgtatcaggatcataatcttgaaacttgtaaattggtttataacaaatatg  c.4759-61

.         .         .         .         .         .           g.339257
tgtgtgtttatttgtagatatgcatgtataaacatttatttattcattcattcccttaag  c.4759-1


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