Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (USH2A) - 9327 nt intron 41 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.540031
gtaagatactgactattctctctcctttgcagacttaggaatgtaccctggattgactct  c.8223+60

         .         .         .         .         .         .  g.540091
gtgttgaacagagccatctactgactaaacaaacgcatttgttgttttaggcattcactg  c.8223+120

         .         .         .         .         .         .  g.540151
gagaaactgggttttggcctttggcccaaactatcttaaattcgatgtcagtttttcatt  c.8223+180

         .         .         .         .         .         .  g.540211
tatccctgtatccccttaattatattgttgagatgcttccatttgcctcgcacacctgaa  c.8223+240

         .         .         .         .         .         .  g.540271
atattttgaatgccacaatgatgcttagcttaaccaccacgtcagatttaaatagatcag  c.8223+300

         .         .         .         .         .         .  g.540331
aaaatgagaagagatgggaaaataaggaggaatgaattagcatattaacaaaattttcca  c.8223+360

         .         .         .         .         .         .  g.540391
ttaccaatagtctggtattttttaataatcaaagaatcaaagtaatggggaaagaaataa  c.8223+420

         .         .         .         .         .         .  g.540451
aaatagcatattaacgggctatccagaaagtgttcaattattcacctcattctattggga  c.8223+480

         .         .         .         .         .         .  g.540511
atgaactctagtggacaggataactaccattgttttggctggcatacaaacttcattcaa  c.8223+540

         .         .         .         .         .         .  g.540571
gggaaattagtgtaaccaaacaggagggagttttgtagcttagaagcctcttttgtgtaa  c.8223+600

         .         .         .         .         .         .  g.540631
atacacacaggcttccatggattcagtcttgtactactgccaaaagcattggtacagtag  c.8223+660

         .         .         .         .         .         .  g.540691
cttgctcaccggagcacaaaacaaaggacatttgcataacagcaaagttcatctgctgaa  c.8223+720

         .         .         .         .         .         .  g.540751
attattacttggatctatgttgtgtgttctctctcccccaccaaaagcaaacactaggtg  c.8223+780

         .         .         .         .         .         .  g.540811
atgctaaacagtgtaaattgttggagaaatttaatttaacctacaaattaaaagctattt  c.8223+840

         .         .         .         .         .         .  g.540871
ttaaaagtctttgttagttttaatatgaagctggtcaaagcaacacacatttttgatata  c.8223+900

         .         .         .         .         .         .  g.540931
aatatgtgtatagaattccattcattaaacactaatgggaaattaattttaagtacacga  c.8223+960

         .         .         .         .         .         .  g.540991
tatacgatgtttattgtatgaactgagcaatgtaaagaattgctcttgattcaaaataaa  c.8223+1020

         .         .         .         .         .         .  g.541051
aacaaaaccaaaaacaaaacccaagcatagagttaataatcattccagaaatgacttttt  c.8223+1080

         .         .         .         .         .         .  g.541111
ttttcaatcttgggggagttttgtaaaactttggtagcagtaccaatcactatgatgcaa  c.8223+1140

         .         .         .         .         .         .  g.541171
caaaacaaacacagtctctttacaaaggcaacactacataatggacattgttctggatta  c.8223+1200

         .         .         .         .         .         .  g.541231
tttcgaataaaaatcttataactaggcgttactgattgtggccgatctgaaaaagagtaa  c.8223+1260

         .         .         .         .         .         .  g.541291
gtattttcaggccgggtgcggtggctcacgcctgtaatcccagtactttgggaggccgag  c.8223+1320

         .         .         .         .         .         .  g.541351
gcaggcagatcatgaggtcaggagatcgagaccatcctggccaacacagtgaaaccccgt  c.8223+1380

         .         .         .         .         .         .  g.541411
ctctactaaaaatacaaaaaattagccaggcttggtggcgggcacctatagtcccagcta  c.8223+1440

         .         .         .         .         .         .  g.541471
ctcgggaggctgaggcaggagaatggcgtgaacctgggaggcggagcttgcagtgagccg  c.8223+1500

         .         .         .         .         .         .  g.541531
agattatgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccatctcaaaagaaaaa  c.8223+1560

         .         .         .         .         .         .  g.541591
aaaaataagtattttcagaggaggaactcagtgtacaattctgcttgattcagcatatat  c.8223+1620

         .         .         .         .         .         .  g.541651
aaacaataattaaaagtatcagcttgcctggctttttcttcacatttttaccctcttttg  c.8223+1680

         .         .         .         .         .         .  g.541711
attttgtaatatcatccatgaattaaacaatatacatggcttgtcagcctgctagagaag  c.8223+1740

         .         .         .         .         .         .  g.541771
tttagattagcgtggctagaaagctgaatctcataggcactcacctgaggccacaaggca  c.8223+1800

         .         .         .         .         .         .  g.541831
ttggtaaccccaagtcaggaatctcaatgtctctaagaaggtgtctgaaatatatgaaca  c.8223+1860

         .         .         .         .         .         .  g.541891
tggtacactagtaatattctaaaaattcacactttttattctcatcttataactaggaaa  c.8223+1920

         .         .         .         .         .         .  g.541951
taaaaagttatcaatagaatcagcaggaatattcaactgagtctagtatttaatgctata  c.8223+1980

         .         .         .         .         .         .  g.542011
tactatttaaagagtattaagataacatatctgtccttcagtattattggctcacatgtt  c.8223+2040

         .         .         .         .         .         .  g.542071
cagaacgatcttaagactttaccgaagtggacgttctcgtgatatagcttagctggtaaa  c.8223+2100

         .         .         .         .         .         .  g.542131
cagaggtatatgacagctaaacaacgacttctctttgtaaaatatgagatttaaaagtcc  c.8223+2160

         .         .         .         .         .         .  g.542191
aaattgcaaatagaaaatattttatatgaaataacagaaggatagtcattaatgcattgg  c.8223+2220

         .         .         .         .         .         .  g.542251
ttaagaaattaattcaactatttatcatagagggttgttccaggtattaggatggatgaa  c.8223+2280

         .         .         .         .         .         .  g.542311
ggaaattgacagtaatattaacagcagtaacaataataatttcagttctattgacattta  c.8223+2340

         .         .         .         .         .         .  g.542371
cggaacatcagtacatgagtgaacatctttgtaagtgcctcttttaggcagtagggacac  c.8223+2400

         .         .         .         .         .         .  g.542431
agaagagatcaagatgaagtccctaggctcatggcgattacattttagacagaatgcaaa  c.8223+2460

         .         .         .         .         .         .  g.542491
caaataactatgtaatatacctggaagtaataaggacttgggggagaagaacaaattgag  c.8223+2520

         .         .         .         .         .         .  g.542551
tgtagagaaatatggaatgccagctgatagggtgggggataatacaaggagcagagttgg  c.8223+2580

         .         .         .         .         .         .  g.542611
tatttcaccttagtgttactcattttgtgcaatgtggtttttttctccatacaatgccac  c.8223+2640

         .         .         .         .         .         .  g.542671
ctgtaagaattacagtccaatagggaaatcaagagagacaacacatacttaggctaacta  c.8223+2700

         .         .         .         .         .         .  g.542731
gaaaataaatgcaatgtaacatattagtaagtactaaaagaggtgatatgacttggtata  c.8223+2760

         .         .         .         .         .         .  g.542791
aatatgagccttgagaaaggcaaattggagagcacagcagcatagatgaaataatatgct  c.8223+2820

         .         .         .         .         .         .  g.542851
taaaatcttatttgattacaagaaaaataaatatataatgtcaaagagttgtgtcacctg  c.8223+2880

         .         .         .         .         .         .  g.542911
aataagtgaaagccatgcacttttatttaatatttaatcacctaagaaaatgtatttcat  c.8223+2940

         .         .         .         .         .         .  g.542971
tttataaggttggtaaaaatgctctaccaagacctaaaacagttcaatgaaactatagac  c.8223+3000

         .         .         .         .         .         .  g.543031
taatttcatttatgagtacagattcaaaatttctaaataaaagattaccaaattgaatta  c.8223+3060

         .         .         .         .         .         .  g.543091
agcagtatattaaaagaatgatatacaaggacaaattgatttcattttaaaaatgtaagg  c.8223+3120

         .         .         .         .         .         .  g.543151
atggttcaacatcaaaaaatctatcaacatatgtcttacatcaaccaattaaagtagaaa  c.8223+3180

         .         .         .         .         .         .  g.543211
gcccatatggtttttttttatcaatagatgcagaaaaaaaggcatacaattaagaagtta  c.8223+3240

         .         .         .         .         .         .  g.543271
tttctaacaaaaagtcaaagtaaaatcagattaggaagaaggtacttaaatgggataaag  c.8223+3300

         .         .         .         .         .         .  g.543331
tcaatgtataaactgctgtactgaagccttgaattgaggattgataagaaataacatgta  c.8223+3360

         .         .         .         .         .         .  g.543391
taaataactaagttgcatgactatgatgcaccaaaaaaaagaaaaaaaaaacttctttta  c.8223+3420

         .         .         .         .         .         .  g.543451
tgataacatcatgagcctgtaaaccttgatgcccctgtccactttttcacaggtgaagca  c.8223+3480

         .         .         .         .         .         .  g.543511
gaataaaatagagtaatcctgcagctgtcagctcctcttatacagtagggtcctcactca  c.8223+3540

         .         .         .         .         .         .  g.543571
gctcagacaggtgaagccaccagccttggcaggtgcgccacaaggaacagtgtcacccag  c.8223+3600

         .         .         .         .         .         .  g.543631
accacaaacatgtgtagcttccttccctctgctatgtacacttagggtcactcatttatg  c.8223+3660

         .         .         .         .         .         .  g.543691
ggtttgataataaagcaaagtaaaagaagttgagtcttaatcatcatcctcattgacttt  c.8223+3720

         .         .         .         .         .         .  g.543751
taaagatgggccaatgtttgatgtctacttaaaataaaccacagacaaaaagtataaaac  c.8223+3780

         .         .         .         .         .         .  g.543811
agaggaaataaaataataatgaaaatatattcactgagttcatgttatgttctagaaatt  c.8223+3840

         .         .         .         .         .         .  g.543871
gctttcatttaattcttactacaactgtgtcagatagatgctattgtcattcccatttta  c.8223+3900

         .         .         .         .         .         .  g.543931
cagacaggaaaactgagaatgagggattaagtaatctgcataagattacataaggagtaa  c.8223+3960

         .         .         .         .         .         .  g.543991
gagttggaattcacacccaggcaatagggttctggagcctatgttcttctctacttcttt  c.8223+4020

         .         .         .         .         .         .  g.544051
acactgcaacaaatggaaaaaaagtgcaatcttcctggatggaaggacttaactccataa  c.8223+4080

         .         .         .         .         .         .  g.544111
caagacaatccttccaaagtcaacatataaactgaacatcattcaaatcagaatgccgat  c.8223+4140

         .         .         .         .         .         .  g.544171
gttttttgtttgttttatttcaaactggataaaataattttttattttttattttacttt  c.8223+4200

         .         .         .         .         .         .  g.544231
aagttctgggatacatgtacagaacgtgcaggtttcttacataggtatacatgtgccatg  c.8223+4260

         .         .         .         .         .         .  g.544291
gtgatttgttgcacctatcaaaccctcatctaggttttaagccctgcatgcattagttat  c.8223+4320

         .         .         .         .         .         .  g.544351
ttgtcctaatgctctccctcccgttaccctccaccccttgacaggccccagtgtgtgatg  c.8223+4380

         .         .         .         .         .         .  g.544411
ttcccctccctgtgtccatgtgttctcattgttcaactcccacttacgagtgggaacatg  c.8223+4440

         .         .         .         .         .         .  g.544471
tggtgtttggaacatgaggtgtttggttttctgttcctgtgttagtttactgagaatgat  c.8223+4500

         .         .         .         .         .         .  g.544531
ggcttcaaggatgaagctggataaaatgattttgaagtataaatagaagactaaatgatt  c.8223+4560

         .         .         .         .         .         .  g.544591
gaaaatattatagaaaattgtggaagaataatgaggtggtactttctgtagtatgtaaac  c.8223+4620

         .         .         .         .      g.544635
ttactttaaagccattgagttataataatatggtattggcatga  c.8223+4664

--------------------- middle of intron ---------------------
    g.544636        .         .         .         .           g.544678
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agataacgagtatttgttgaaatgacttattgtaggtagaatctgcattttatttcattg  c.8224-4561

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ctggagtactgctaattgatctcaaacccttcattactgtctagtccaaaggcctcagga  c.8224-121

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gaatgtagccatttagaaaatgacttaactgaaaacaagagcaaaattctaggcctcgtg  c.8224-61

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aacttcaattgctctattcctgtatcgtcacactgattctaagtttatctttcatttcag  c.8224-1


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